Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_022777_1                                                                                                                 top


Strain : Clostridium tetani 12124569 RefSeq :NC_022777 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_022777_1
DR consensus (31 bp) : AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACNumber of repetitions :23
Begin Position : 1469658 End Position : 1471149

1469658TATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTGACTTTTAACTTCTCCTTATCACTCAGCCTCACAG 1469724
1469725GATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTTTGCTTTATCCTCTACTAATTTACGGCGTGCTT 1469789
1469790CATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACATATAACTTGTAAAAAATGTGAAAATTCTCTTACAT 1469856
1469857AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTTAATTGTAACTCTTCTAATAGTTTCTCCTTCTCTT 1469923
1469924GATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTAGAAACACATACTAAATTAATGATAAATAGATTAA 1469990
1469991AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTAAGCTTGATTTTCTGAAACTTTTTCTTCTACAAAT 1470057
1470058AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACGGATACGAACAACAAGTATTAAATATATCTAAATCA 1470124
1470125AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACCCCCATATACCCTACATATATCATCTACTGTTCTT 1470190
1470191AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTTTTTCTGGATTTAAAAGAAGTACTCCAGCACTTT 1470256
1470257GATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTACTTATTGTAGGTGCTTTTTCTTATTATCTAAGA 1470322
1470323AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACCATTCCCATGCTCCCCCTTTTTTTTATTTGATCAAA 1470389
1470390AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTTTATTAGTACTTAGTAGTGTCTGATTATCCGTTT 1470455
1470456TATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTGCATTACAAGTTCTTTTATGTTATTATAAATTTAA 1470522
1470523CATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACGTCCATTTTCTAATATTTTATATTCCTTTGTAAAAC 1470589
1470590GATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTCATCAAACAGTTTATAAATTGCATCATAAACTTTA 1470656
1470657AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTAAAGGCAGGTGAAAAAAATGATACCACTAGATGAA 1470723
1470724AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATGCAGTTGCAAAGATAGCTTCAAAAGAAGATATAAAGA 1470789
1470790TATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACGATTCAAAAGACTATGGCTGAATCATTTAAAGCTG 1470855
1470856AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACGTTATAGGAAGAATTCTTTCTTCCAATAAAGTACC 1470921
1470922AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACGTTGAGAAACGATATAAAAAATCAATAGTAGCCA 1470986
1470987AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTGAAATATTCCTGTATCGGGTTCATATGGTGCATC 1471052
1471053AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACCATCTATAAGAGTAGAAAGTTCCCTAACTGGGATA 1471118
1471119AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC1471149
Left flanking sequence : Till position 1469658 (length bp)
TTAGGGTATCAGTATCCAACTAATATATATAGTTGTTTTAATTGTTACGAATAGTGTTACTGATACAATT
TATACCTATTTTATCTAAAATCTACAGTTA
Right flanking sequence : From position 1471149 (length bp)
GCGTTCACCCACAATATGCTATATGCCTATAGTAAAAATCCTATTTCTGTCTATCTACTAAGTTGAGACT
TCTTATAAGCTATTATTATAATACAAGTTA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp