Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_AP014724_7                                                                                                                 top


Strain : Sulfurospirillum cavolei GCF_001548055 RefSeq :NZ_AP014724 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_AP014724_7
DR consensus (31 bp) : CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGNumber of repetitions :15
Begin Position : 2125601 End Position : 2126560

2125601CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGAATGTATGCAGGGATTCAAGATCATGGCGGCGTTGC2125667
2125668CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGCTAACGGGGATGTATTTCAACTTACTACATCGACGA2125734
2125735CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGACGTGTTCATTGCAGAGTGTGAACAAGAGTACAACA2125801
2125802CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGAGTAAAGAGTTATTGAGTGAAGTATTTGCAGTAAAT2125868
2125869CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGATGGAAGAGGTTAGTTCCCCTTTTGGATATAAATTT2125935
2125936CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGTTAAATCAAAAAGCGATAAATCAATCAAAGAAGAGA2126002
2126003CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGGCGTAAACGGTTTTTTTTGTAACTCCGCCGATGACT2126069
2126070CTCTAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGCGCATTGAAACGAAAACGGTATCGGCTTTAACGC2126134
2126135CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGACAACAACAAGTGCAAAATGGAGAAAGATTCTAA2126199
2126200CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGAAATATTCCATAAATGCCCGTGCTTTCGATCTTT2126264
2126265CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGTTTGTTTATCAATTCAGCTAATTATGAAGCGTTAG2126330
2126331CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGAGTACCACATGACAAAAGATTTAAACCTATCTATCTC2126398
2126399CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGCACATGAAAAACTACGAACTTTTACAATACTATC2126463
2126464CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAGAATTTAAAGCATAATGAAAACGTGAAAATCTATCA2126529
2126530CTCAAACCGACACAAATTGTTGTATTTAAAG2126560
Left flanking sequence : Till position 2125601 (length bp)
TTTTGATCTTTAACAATACATTGTTAATTTTAATTGGAAAAAATGACATAAAAGGCAATTTTATGGAATT
CTAGTTTTTAAGAAGCTCTATAATTTAGCA
Right flanking sequence : From position 2126560 (length bp)
ATCATTCTTACCTATTTTAGATAGAGCAAATGCAAAAAGGGGTCAGGGCTAAACTTTTAACTTTTGACCA
TTAATCTTCTATTTAATACGTTAATTCTAG
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp