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CRISPRs details
NZ_AP014924_1
Flanking alignement tool
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NZ_AP014924_1                                                                                                                 
top
Strain :
Limnochorda pilosa GCF_001544015
RefSeq :
NZ_AP014924 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_AP014924_1
DR consensus (36 bp) :
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
Number of repetitions :
42
Begin Position :
245296
End Position :
248298
245296
GTTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
TCGGATACTGCTCGGGGTGGACCAGGCGGGCGTTGTC
245368
245369
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
TCAAGGTGGGCGTGGATCTTGGGGTTGCATAGGAGG
245440
245441
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CCATGACCGGGAGGAGGTTGAGATCCTTCCAGTACTC
245513
245514
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GTGGCCCAGCCCGCATGAGTCAGTGGAGGGTGCCGTT
245586
245587
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
AAATCCATTTCATCTCGATGTTGTGACTAACAGAGA
245658
245659
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GAGAACAGGCCGCCGTACTATGCGCTGTGCTTCATCAT
245732
245733
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
AAGAAGGTGGAGGGCGCGTCCGTGGACCTAGCCCGG
245804
245805
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CACCTGCTGCCAGTCAGCCTGGGCGGTCCAGCGGCG
245876
245877
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GCTGGAGGAGGGTGTAGACGCGCCGCCTCTGGTACCA
245949
245950
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
ACCGAGGAGGGTGGTGAAGGCGATCCGGCTTTGCTC
246021
246022
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
TAGCTGGGAGGCAGGGCGGAGGATGCCAGACTACGG
246093
246094
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CCGAGGCTGGGAATGTCGTGCTGGTCAGGGCCCCGTG
246166
246167
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
TAATCGTGCGTAGGTGCGGACGCTGGGAGGCGGAGGC
246239
246240
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CCGGGAGGCCCTTGATGGTTCCCTGGTAGTACCAG
246310
246311
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GAACGTCAGCGCCCCCACGGGGAGCGACAGGGCCAT
246382
246383
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GATCACTTGGCCGTCGCGCAGGATCAGGGAGCCGGAC
246455
246456
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CGAGCGGGCCGCCATCGAGACGTGGACGCGGAGCGC
246527
246528
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CAGAATCGGCGCTCCGGCGCTTGCGGGCGGCCAAGG
246599
246600
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
AGGGCCGCGGAGATGCGCGAACCGGTGGAGAGGAG
246670
246671
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GGTACTTAACTATCCACCACCCTTCGCGCTCACGTAT
246743
246744
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CCGCGAAAGGGTCGAGCAGCCGGGCGCCGGGGAATGCGTA
246819
246820
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GCCCCAATCGATGCCCTGCTGAAGATGCTGGGCCC
246890
246891
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GAGTTCGTGGACGTCTTGGCGACCGAGGCGTTTCTT
246962
246963
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CAGGGTACGAGCCACGGCGTGCTGCTTGCCTGCCTG
247034
247035
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GAGAGGGCCGACCCGTGCCATCTTAGGATGATCTG
247105
247106
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GCCTCCGCCCGCAACCTGTTGAATCGGAATCCAGTG
247177
247178
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CTCATCCACGTCAATGCAGACCAGACCCATGGAAGC
247249
247250
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CACCAAGGTCTTCCGCCCTGGGGTGATATTGGTCA
247320
247321
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
TTCAGGCGCAGATACAGGTCCTCTGGCACGTCCACGC
247393
247394
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
TTCAGGCGCAGATACAGGTCCTCTGGCACGTCCACGC
247466
247467
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CCTCGTGGATGCGTGGCGCCCCTGCGGCGCGTCCTGAC
247540
247541
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
TCCTCGTCGAAGCCGCGCCCCGTGCCCACACTCGAT
247612
247613
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
AGGTGGCTTGGGGGCGGCAAGGTTCCGATATACGT
247683
247684
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GAGAAGTACAACCGGAACACGGCGCAGGCCGCCCCGC
247756
247757
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
ATGCCAGCCGAAGGGCGGCCCGAACGACTGGTGGCCG
247829
247830
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GTGGCTCATCAACACGATCCGCTACGTTGCGGCCA
247900
247901
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GGCCGATGCCGTGAATGGGCACGAGTTCCGCAACGGTGG
247975
247976
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GCGACAACTCGTTCAGACGCCGCTCCAAGCCCGCTG
248047
248048
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GACGCGAAGTCCGTCACGCCCCACTCGGCGTAGTC
248118
248119
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
GGGAGCTTGGCGATGAGGTCCCGCAGCGCGCCGAC
248189
248190
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
CAGCGAACGAGACGCCGGTTGCCACGTCGATATCGAC
248262
248263
GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC
248298
Left flanking sequence : Till position 245296 (length
bp)
GGTGAGGACGGGGTTCGTGATCCCGGCCGTAGGAGAGAAGTTCGAGGCCACGGGGCGGATCCCCAGCCCG
GAGGTGGGCGCGGTCGCGCGGGTCTATGAG
Right flanking sequence : From position 248298 (length
bp)
CCCTCCTTGTGCAGGACGCTTCCCTAGGGCTCTCTCGCCCTTCCTTTCGAGCACCCCCCTTGGCTCCAGT
GGAGCAGGGGTCTCTCTGGCACGCGCACCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp