Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_AP014924_1                                                                                                                 top


Strain : Limnochorda pilosa GCF_001544015 RefSeq :NZ_AP014924 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_AP014924_1
DR consensus (36 bp) : GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACNumber of repetitions :42
Begin Position : 245296 End Position : 248298

245296GTTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACTCGGATACTGCTCGGGGTGGACCAGGCGGGCGTTGTC245368
245369GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACTCAAGGTGGGCGTGGATCTTGGGGTTGCATAGGAGG245440
245441GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCCATGACCGGGAGGAGGTTGAGATCCTTCCAGTACTC245513
245514GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGTGGCCCAGCCCGCATGAGTCAGTGGAGGGTGCCGTT245586
245587GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACAAATCCATTTCATCTCGATGTTGTGACTAACAGAGA245658
245659GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGAGAACAGGCCGCCGTACTATGCGCTGTGCTTCATCAT245732
245733GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACAAGAAGGTGGAGGGCGCGTCCGTGGACCTAGCCCGG245804
245805GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCACCTGCTGCCAGTCAGCCTGGGCGGTCCAGCGGCG245876
245877GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGCTGGAGGAGGGTGTAGACGCGCCGCCTCTGGTACCA245949
245950GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACACCGAGGAGGGTGGTGAAGGCGATCCGGCTTTGCTC246021
246022GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACTAGCTGGGAGGCAGGGCGGAGGATGCCAGACTACGG246093
246094GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCCGAGGCTGGGAATGTCGTGCTGGTCAGGGCCCCGTG246166
246167GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACTAATCGTGCGTAGGTGCGGACGCTGGGAGGCGGAGGC246239
246240GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCCGGGAGGCCCTTGATGGTTCCCTGGTAGTACCAG246310
246311GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGAACGTCAGCGCCCCCACGGGGAGCGACAGGGCCAT246382
246383GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGATCACTTGGCCGTCGCGCAGGATCAGGGAGCCGGAC246455
246456GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCGAGCGGGCCGCCATCGAGACGTGGACGCGGAGCGC246527
246528GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCAGAATCGGCGCTCCGGCGCTTGCGGGCGGCCAAGG246599
246600GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACAGGGCCGCGGAGATGCGCGAACCGGTGGAGAGGAG246670
246671GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGGTACTTAACTATCCACCACCCTTCGCGCTCACGTAT246743
246744GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCCGCGAAAGGGTCGAGCAGCCGGGCGCCGGGGAATGCGTA246819
246820GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGCCCCAATCGATGCCCTGCTGAAGATGCTGGGCCC246890
246891GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGAGTTCGTGGACGTCTTGGCGACCGAGGCGTTTCTT246962
246963GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCAGGGTACGAGCCACGGCGTGCTGCTTGCCTGCCTG247034
247035GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGAGAGGGCCGACCCGTGCCATCTTAGGATGATCTG247105
247106GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGCCTCCGCCCGCAACCTGTTGAATCGGAATCCAGTG247177
247178GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCTCATCCACGTCAATGCAGACCAGACCCATGGAAGC247249
247250GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCACCAAGGTCTTCCGCCCTGGGGTGATATTGGTCA247320
247321GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACTTCAGGCGCAGATACAGGTCCTCTGGCACGTCCACGC247393
247394GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACTTCAGGCGCAGATACAGGTCCTCTGGCACGTCCACGC247466
247467GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCCTCGTGGATGCGTGGCGCCCCTGCGGCGCGTCCTGAC247540
247541GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACTCCTCGTCGAAGCCGCGCCCCGTGCCCACACTCGAT247612
247613GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACAGGTGGCTTGGGGGCGGCAAGGTTCCGATATACGT247683
247684GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGAGAAGTACAACCGGAACACGGCGCAGGCCGCCCCGC247756
247757GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACATGCCAGCCGAAGGGCGGCCCGAACGACTGGTGGCCG247829
247830GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGTGGCTCATCAACACGATCCGCTACGTTGCGGCCA247900
247901GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGGCCGATGCCGTGAATGGGCACGAGTTCCGCAACGGTGG247975
247976GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGCGACAACTCGTTCAGACGCCGCTCCAAGCCCGCTG248047
248048GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGACGCGAAGTCCGTCACGCCCCACTCGGCGTAGTC248118
248119GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACGGGAGCTTGGCGATGAGGTCCCGCAGCGCGCCGAC248189
248190GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCACCAGCGAACGAGACGCCGGTTGCCACGTCGATATCGAC248262
248263GCTTCAACGGAGCCACCGCTCTCCAGCGGTGGTCAC248298
Left flanking sequence : Till position 245296 (length bp)
GGTGAGGACGGGGTTCGTGATCCCGGCCGTAGGAGAGAAGTTCGAGGCCACGGGGCGGATCCCCAGCCCG
GAGGTGGGCGCGGTCGCGCGGGTCTATGAG
Right flanking sequence : From position 248298 (length bp)
CCCTCCTTGTGCAGGACGCTTCCCTAGGGCTCTCTCGCCCTTCCTTTCGAGCACCCCCCTTGGCTCCAGT
GGAGCAGGGGTCTCTCTGGCACGCGCACCA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp