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CRISPRs details
NZ_AP017295_14
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_AP017295_14                                                                                                                 
top
Strain :
Nostoc sp. NIES-3756 GCF_001548375
RefSeq :
NZ_AP017295 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_AP017295_14
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
Number of repetitions :
18
Begin Position :
4427741
End Position :
4429032
4427741
GTTTTAGTCCCCGTAAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
GCATGACAGGTACATGTTGTTTCATATTTATATAGTTT
4427815
4427816
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
AGTAGGTGCTGTATCTGTTACTTTCTCATCTTTAAAT
4427889
4427890
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
TGGCTCATAAATCTCCTAAATAGGTAATAAAAATTGC
4427963
4427964
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
GAACAACTTGATAGAATGTCTCCGCAGGAGAGAGAAGTT
4428039
4428040
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
CCACTACCTCCACGCAGACAACTTCGCTGAAGTGGCAG
4428114
4428115
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
TATTGTCTTATTGTCCCACGTTCGTAAACGTCAAG
4428186
4428187
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
CGCAAAGTGTTATCAACAGAGACAGAAACATTAGT
4428258
4428259
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
TAGCGCGGCAACCCCTCACCGATACCTACGGGCGT
4428330
4428331
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
TTTGGTTGACTCACTAATCAATACTAGCTGGTGAAT
4428403
4428404
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
CTATCTGCGTCTTGGGGGAGGACATATTTTTTT
4428473
4428474
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
TTCTAAATCTGGCGGTAGTGGGTTGAGGTTGGGGAT
4428546
4428547
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
CCGCGATGGTGTTGCTTCTGGTTAGTTTGTTCATGGGTGTC
4428624
4428625
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
GGAAAGGACAGTGGACTGTAGGACTTCGTTGGCTGTT
4428698
4428699
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
CATGATCGGCAGATGGTGTTGATTGATATTGGTGGGAC
4428773
4428774
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
CTTTAGCCAGTGCGGCAAATTCTTCGGCGCTATTGA
4428846
4428847
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
CCCGGATTCAAAGTTCTGGCTCAAAAGATTTATTTATTC
4428922
4428923
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
GAAGCTAACTTTATCATTCCTATACTCAAGCGTTGT
4428995
4428996
GTTTCAGTCCCCGTGAGGGGAATTAGTTAATGGAAAC
4429032
Left flanking sequence : Till position 4427741 (length
bp)
TCCTTTAATTTGTTGTGTCTTTAAGCGCCAAATTTTTGATATACGCTACTAAATCTTTGTTATGCACTAA
AATTCTGCCAAATGATTAAGAAAATTTTGA
Right flanking sequence : From position 4429032 (length
bp)
AGCTCTGTGCTGAAACTATTACAGAGACAGCTTCTTGGGAAGCGATTTGACGGATAGAAAAATTAGGTCA
TTTTCAGCAGTTCTTATTGCAAATAATTTG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp