Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP004392_4                                                                                                                 top


Strain : Pasteurella multocida OH1905 GCF_000973565 RefSeq :NZ_CP004392 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP004392_4
DR consensus (28 bp) : TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACNumber of repetitions :44
Begin Position : 1081980 End Position : 1084588

1081980AATTGAAACTGCCTATACGGCAGTTAACCGAGTTTTGCCAACAGTTTTCGCAAAATTTCA1082039
1082040TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACGCATGAATCCACTCGGTTATCTAAGAGCAATA1082099
1082100TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACAATGCGGTGAGCACGTTACCGACAAATGAACA1082159
1082160TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACTTGCTAAAATGCCACGGTCTAGCTAGACAAGT1082219
1082220TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACGCAAGTGCCAGTGCGGCGTGCCGTCGTGGTGT1082279
1082280TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTTGGGTATATTCAGGCGGTCGTAAGCTCAAAG1082339
1082340TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACAACACCGTCCACAATTTCACCACTTCTAAAAT1082399
1082400TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACATGATAATGGTGAAAATTGTCATATTGTTGTT1082459
1082460TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTGTTCAGCGCCAGTAATTGACTGATGGACCGT1082519
1082520TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACCAAATTATGTTACAATTCACGCGCGGTAAAAT1082579
1082580TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACAAAACTTGACCTTTTACGCTAAAATCATAGCC1082639
1082640TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTCAATGAACGGTCCGGCAGTGATTGACGCACT1082699
1082700TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTCCCGCACTTGATCCGCCACATCCTGCGGAAT1082759
1082760TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACACCAAGTGCGCACTTCTTCAACCGTTGGCAAT1082819
1082820TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTCGCCTTTCGCTCGGCTTTAATCCATTATAAA1082879
1082880TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACGCGAGAAAAATTTATTCTTCTGGGTTTAGCGT1082939
1082940TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACGGTTAGATATACGCCAAGCAGCCAAATAATAA1082999
1083000TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACGTAAAACTTTTGTTAAAAAAGCAATTAAAACA1083059
1083060TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACAAACGCTCCACTTTTATCTGAAATGGAATAGGT1083120
1083121TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTTGTGTCAATATCTTCTTTTAAAATTTCCGTT1083180
1083181TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACGTGCAAAGTCAGACTTATGCAATTTCGGCACG1083240
1083241TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACATGCTTATTTTGAAGTGGTGCGCAATGCGTTT1083300
1083301TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACGAAATACATCGCTTAATTGCAACAGATGAAGA1083360
1083361TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACCAAGTAAGCCTTAGTCCTGCGCTGTCCATCGT1083420
1083421TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTTGAACATCCAAAAATTGTTGAATATCCAAAA1083480
1083481TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACAAGCCGAAAACTTTAGAGGGATTGTATTTAAC1083540
1083541TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACATATGTCAATTACTGCATATGTGGGCATTCCC1083600
1083601TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACGGAACTGCCCTGTTAAATCTTTTACACGAACA1083660
1083661TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACAAACACGCTGATTGAGTTCAACATCATCAAGC1083720
1083721TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACAAATCCGTCGCTCGGATTTTTTTCCGACTGTC1083780
1083781TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTCCGCAGATTAAGGCAATGATTAAAGAATTTT1083840
1083841TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTTGCAAGACTAACAGGCAAAACAAAAGAAATT1083900
1083901TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACCGCCTGATTTAGAACTGGACGATTTAGAAAAT1083960
1083961TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACCGGTCCGGCAGTGATTGACGCGCTAGTGTCAT1084020
1084021TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTTAAATCATTTGAACACTGCACGAGCTAAGCT1084080
1084081TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACACATTGATTGGCTAGCAATAGAACAGGATTTT1084140
1084141TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTATAACATTGACACTCTTTGCACACTTTAACT1084200
1084201TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACGTAGCGGCATTTCACCGTTTGAGTTTGTAAAA1084260
1084261TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACCCCATAAAACGATTTTCTAAACTTAGGTGGTG1084320
1084321TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTGAAAAAATGGACAGCGAAAGTCTCAATGAAC1084380
1084381TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACGAATACCACTTAGATAAAAGAGATTGCTTGGT1084440
1084441TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTTGGTGACAATTATAGTCAGAGAACATCAAAA1084500
1084501TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACATACATCTGACAGCCACGTTATTGAACCGATT1084560
1084561TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC1084588
Left flanking sequence : Till position 1081980 (length bp)
TGAAATTTTCCAAAAATTGACCGCACTTTTATCGTTAAACACGATATAAGCTAACAGACCGATCCCCATA
TCCAACTGTTTTAGTAATATACCAACAGTC
Right flanking sequence : From position 1084588 (length bp)
AAAACAGTCTAATCGACATCCCTTTATTCAGCAAGTATGGCGCCGATCAAACTGTTAAAAACCCTTTTTC
TAGACATAGAAATAACCCTTTGATCTTATT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp