Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP006909_2                                                                                                                 top


Strain : Clostridium botulinum CDC_1436 GCF_000817935 RefSeq :NZ_CP006909 (plasmid pCBG circula)
CRISPR id : NZ_CP006909_2
DR consensus (29 bp) : TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAACNumber of repetitions :13
Begin Position : 154922 End Position : 155742

154922TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAACTTGTTTTTTATAGAATTTAGCATTACAAAAACCTCCG154987
154988TTTAAATACACCTAATGTAAAAGTTAAACTTTATTTGTTTTTATTGTTACTATTAACACG155047
155048TTTAAATACATGTAATGTAAAAGTTAAACTTCCCCTTTTCAGATTATAAATTTAATGTTTCG155109
155110TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAACCATCCAAAACTCTTCTCTTTTTTTGCAATTGTTCTCTG155176
155177TTTAAATACATATAATGTATAAGTTAAATTCAGTGTTGTAGCTAACTTTATAATAGTAGTTATGG155241
155242TTTAAATACATCTAATGTACAAGTTAAACAAATCATCTATTTTATATTGGTAATATATTTACTATAAATCGGTAG155316
155317TTTAAATATATCTAATATATAAGTTAAACCCAATTTACTCCATTTTTCATATTTCAAATATGCGTG155382
155383TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAACGTATCTTATTTTTAGGTAAAACCTCTCTTAAATTCTTG155449
155450TTTAAATACATATAATGTAGAAGTTAAACTTTTCTATTCTGCACCTCTCTTATAAAAAAAGAACCC155515
155516TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAACTTATATCTATGCATTTGCAAAACCTCCATTTCCTGTTG155582
155583TTTAAATACATATAATATATAAGTTAAACTATTCCTTTTTATTTCTTTTTATAAAAATTATTATG155647
155648TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAACTATTTAATTCTTTAATTACCTTTTTCTGTTCTTTACA155713
155714TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAAC155742
Left flanking sequence : Till position 154922 (length bp)
AACAAAGATAAAAAACAATTGTAAGTATTATTAATTTTAAATACATATAATGTAAAAGTTGAACATAAAA
ACTGAAAGATTTTTAATATTCCTAAACATG
Right flanking sequence : From position 155742 (length bp)
CAATGAAAATAAGCTATTTGTAAATAATAAAATGTTTATATAATTATTATAACATGCTTTCATTATATGA
CTTTTAAATTTCTAAAAGAAATATAAATTA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp