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CRISPRs details
NZ_CP006933_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP006933_4                                                                                                                 
top
Strain :
Methanobacterium formicicum BRM9 GCF_000762265
RefSeq :
NZ_CP006933 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP006933_4
DR consensus (31 bp) :
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
Number of repetitions :
36
Begin Position :
1950906
End Position :
1953262
1950906
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GGTGTTAGTTAGGTACAAATAGAAAGGTTCATCTGG
1950972
1950973
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TTCATTTCTTAATTCAGGATATAAAACTCCGTCCAA
1951039
1951040
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GGGCAAAGATGACATTATAAAGGAGGAGGGTTCTGT
1951106
1951107
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TTGAAACAGATGATAACCCCCAAACCATAATGGAT
1951172
1951173
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
CCCATTGGGGCCACTCTTTGGTTTCGTGGGTTAA
1951237
1951238
TGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
AATGTGGGCATGAAGAGGTGGCACGGAAATGACTG
1951303
1951304
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
AAAGGGGGGCCTAATGAGTTAATAATTCAAGAGCTTA
1951371
1951372
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GAACCAGACGAACCCGACAATGTACAGGAAGGTCAG
1951438
1951439
TGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
AAAAGAGACGCTTATTTTGACAGCCCAGAGGTTCAAC
1951506
1951507
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
AGGATAACCTTCTTTGTTTTAAATACATGGCCAGT
1951572
1951573
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
AATATGCCCAGGTCCCGGAAACTAAGGAGGCTTTAA
1951639
1951640
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TTTTATTTGTATTGGTTTAAATCTATTGAATTTGAT
1951706
1951707
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GTAAGACTATGATGGGTCATGTTATCTCTGGTGTGG
1951773
1951774
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TGTATCTGTTGAATTATATCGAGTATACTGATTAT
1951839
1951840
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TCTAAATAATATGGATCTGTTTCTGCCAGGGCATA
1951905
1951906
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
ACCTTCTTAGAATGTCTGCTGATAAGTTAAGGGG
1951970
1951971
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TTCAGGTAATGCCATAATATTTACCTCCTAAAAAA
1952036
1952037
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GGTGATATGGATAATCCAGAATGGCCCTTCAACTAA
1952103
1952104
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GTCATGTAAGTGTTCATCTGCAAATTTCAATAACT
1952169
1952170
CGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GAGTTCGGGATGTATATCGCCTGTTACTTTTAATT
1952235
1952236
TGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TTATTTGACGACTTGAACTCTAAAGTAGATTATATT
1952302
1952303
CGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GCAAACTGGTTTGTTAAAGGCAGTGTTACACAACAG
1952369
1952370
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TTTTTCGATTCTTTGTATTTCTGTTGCGAAGTTTC
1952435
1952436
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TCAATGTATCATTGCTTATGAAGGGTTAGGAACAC
1952501
1952502
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
AGCCTTAAACAATTAGGAATTAACACCTCCGATTATGGG
1952571
1952572
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GTACAGCCCCTGTAAGTTCTTATACCTTTACGGG
1952636
1952637
CGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
ACACTGGCCTGGTCAGCTGAAGAGGTGATAGTACC
1952702
1952703
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GGAGTAAATACACTATTAAATCTTATTACGTGCAA
1952768
1952769
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GCACTCATCTACTTGAGTTACACAGGCAAAAACAA
1952834
1952835
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
GGTGATTGAGGTGTCTGCAAACATGAGGTACCTTT
1952900
1952901
CGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TCCAAGGAGTTGGATCAGCAGACTGTGAAATAATAAC
1952968
1952969
TGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TGAAATGAACATGACACAGGCCCTATTTAATATGG
1953034
1953035
GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
TCACATCAGTATGTAACAGCTGATGATTTATACA
1953099
1953100
AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
CTGTTTTGCTGATTTTCTGAGCGGACTCTAAGGCC
1953165
1953166
TGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC
ACTATAGAAAAGTATATATAGTATGTGCAACAATG
1953231
1953232
TGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATAAATAA
1953262
Left flanking sequence : Till position 1950906 (length
bp)
AAGGAATGTTTCCAGTGCAAAGGCCCCATTAGTAGGCTAAAATCTGTTAAGGGTCATTAAAATGCCTGTG
AAAAACTCATGTGCAAAGGCCCCATTAGTA
Right flanking sequence : From position 1953262 (length
bp)
TTACTCATTAATCCTATTTTCATTTGTGTCTTACTCTGTGCAGTTATCATCTGATTAACTCCCCCTTCCT
TAACTTTATATCCCGCTATCTCAAAAATCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp