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CRISPRs details
NZ_CP008881_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP008881_2                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium psychrophilum GCF_000831185
RefSeq :
NZ_CP008881 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP008881_2
DR consensus (46 bp) :
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
1576111
End Position :
1577671
1576111
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GCTAAATATTTCTTTTATTTTATTTTGCTT
1576186
1576187
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TATTGAACAGCAATTTTCATCAGATGATGA
1576262
1576263
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TACGGCATTCAAACCCCCCATCTATTACT
1576337
1576338
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AAAGACTTATTTAAGTCTAAAGAAGTGCCT
1576413
1576414
GTTGGTAATTATAAGCTGAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GAATGCGTGCGCTGTATGTATTTCGTTTT
1576488
1576489
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AATGTGTCTATTGTGAATACATTACCTACT
1576564
1576565
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ACGGAATAAACGGAAACGAGCAACTTATTA
1576640
1576641
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATTACAGTTGCTTTAAATAAAAAGTAAAA
1576715
1576716
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AAAACAATCATCTATGTTGCTAAATCTTTT
1576791
1576792
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GAACACATAACAGGACACAAGGCATTGGCT
1576867
1576868
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ACTTTGATATACGACATCTCGCTTACTGGA
1576943
1576944
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TAAGTTTTCCTACTTAACCATTTTTTAAAA
1577019
1577020
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATAGTACTTTGATTTCACGTGCGAAAACG
1577094
1577095
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GGTGGCAATGTGTATTCAAACACGGATATA
1577170
1577171
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GGAGCTGGTTCGGGTACAATTACATTAAAT
1577246
1577247
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATTCTCTTTCAGTTTTTCGATATTGTTTTT
1577322
1577323
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
CTGTCGTACGCTCTAGTATTAGATATATCT
1577398
1577399
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TAATATTTAGCATAAATTTATAATCGTCCT
1577474
1577475
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AGTGCTACCTTCGATAATTAGCGCATTAAT
1577550
1577551
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
CACAAATGGGGAATTTGACGAAAACAAAA
1577625
1577626
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATAACCCGTTGGGTGTAATTAAATTA
1577671
Left flanking sequence : Till position 1576111 (length
bp)
ATATTAGACCTACCAGAATATCAACACACAAACAGAACTGTTTTTTAATTTCAAAATAAGCATATAACCA
CCAACATATCAAACGATTAACTCGCGGTAT
Right flanking sequence : From position 1577671 (length
bp)
TTTGATGACACTATCCCGCAAAGTTTTTATAGGGGTCAAAACACCATTTACTTTTATGATGTTTTACGTC
GACCTCAATTGCGATTTCCTGTGTTTGTGG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp