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CRISPRs details
NZ_CP009267_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP009267_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013 GCF_000807175
RefSeq :
NZ_CP009267 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009267_2
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
Number of repetitions :
38
Begin Position :
2831711
End Position :
2834172
2831711
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGTGGTAGTTTAGATACAGATATAAGTCAATATGTA
2831776
2831777
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TGATGCTAAAGTTGCATTAACAATCATTTTTTGTGC
2831842
2831843
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ATGCAATTTTATACCAAATGCCGCAGATATTTGT
2831906
2831907
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATACTTTTATAATTTCATCCTTTGTAACACCTTCC
2831972
2831973
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CATAGATAAATTCACCTACCTTTCTATTTTTGTTTT
2832038
2832039
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GTAGAAGAATATGAGCTCTTTACAAGTTCATTAATT
2832104
2832105
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CATCTCTGCCAGTGCTATGTTTGCAATTGGTAAAGA
2832170
2832171
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATTTAACTTCTGAACACTCTTCAATCCATATTAT
2832235
2832236
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCACTAAATAAATAAACTCTATCGCCATCTTGTTTGG
2832302
2832303
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ATTTAGGTGATTGCCAAGTTCCGTTGGAGTTCCAAG
2832368
2832369
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTTATATTCAAAACTAATTCCTTTTTAGTCATTACT
2832434
2832435
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TACAAATAAATTCAATTCTTCCGTAGAAAATGAAA
2832499
2832500
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TCAATACATATCTCTTTGGTATAATTAGCTTCTC
2832563
2832564
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACATATGAGTATGGTCTTTATCACATTCTATTGCAA
2832629
2832630
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAAAACAAGAAACAAGTCTTATCAAATATGAAATGTC
2832696
2832697
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TGATTTTTCATCGCCAAGATCAGCATACCAAATTTGC
2832763
2832764
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GTACTATTAGCAACTGCAACATCTTCTTCAACTTTT
2832829
2832830
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATAATGTATGCTTTGGTATTGCACCTATCCTATTT
2832895
2832896
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACTTTTTCTATCTCAGTCCAATACACAGTAATAAT
2832960
2832961
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTTCTTCATCGCAATGAGGACAATCAAATTTTAC
2833024
2833025
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAATCACTTCAACTTCCTCACTGTTTACAGTTACAA
2833090
2833091
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCTTTTTCTGTCAAGTTCTTTTTTTATTTTTTCACA
2833156
2833157
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CAAACTGGCTAGAAGAAACGAAACGGATGTAATAA
2833221
2833222
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAGAAGTGATTCTTCATCCTGATAATTCCACTTAGT
2833287
2833288
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATCTATTGTTACTGGTGTAGCTTTACCTGCTAGC
2833352
2833353
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATTCTTTAAAATGTCTTTTGTGTTTAATACATTAT
2833418
2833419
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAACAAAGGTTAATAGCTTAGCTTTTGTTTTGAGG
2833483
2833484
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTACCTGTTACACTAAATTCATCAACCAAGATTTT
2833548
2833549
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTACTTTTTCTCTGCTGTTAGACGGTATATCAACGCA
2833615
2833616
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CAGTTTGCCTTTAATTCTTGTTTCTTGCCATTCACT
2833681
2833682
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACTAGATGCTCTCTACAAGATATTGAGTTCACATAT
2833747
2833748
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGTAAGGAGCATAAGAGCATAGATAAAGATGACTG
2833812
2833813
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCAACTATACCATCTACAGGAAGATGCAATATAGTC
2833878
2833879
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GCTGACTGGCATTTAATTTTTTAGCAATTTCGACCTG
2833945
2833946
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CTGTGGTACTTACCTTTAAAGCAATGCTGTTACTCAA
2834012
2834013
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGAGTAAGACCACCAGTAATTGCAATCCCTGTCCA
2834077
2834078
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TAGAGCAAGGTAATGTAATTTAGATACTTAAAATT
2834142
2834143
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
2834172
Left flanking sequence : Till position 2831711 (length
bp)
AATAACTCTGTTCTATCCATAATAAAATCCCATCCTTAATTTAAATATTAGATAATTAATATTATAACAT
ATTTATTAATCATTTATCCTTTATTTTAAC
Right flanking sequence : From position 2834172 (length
bp)
TACTTAAAACTAGCCATTCTTTACTATAATTATAATGCTCTATTCATTAAAAATAAAGGATTTAGCAAAA
ATTTTACCAGCTATTTTTAGTCTTACGTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp