Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP009498_5                                                                                                                 top


Strain : Endomicrobium proavitum GCF_001027545 RefSeq :NZ_CP009498 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009498_5
DR consensus (36 bp) : GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATNumber of repetitions :43
Begin Position : 1285396 End Position : 1288204

1285396ATTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATATCGGCGCTCTGAACCCATTTAACATCCGG1285461
1285462GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAAAGCAAAACTACAAAGAATAAAAGCAAAA1285527
1285528GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAATTAAGGTGCATTTATTTAACGCTCAATT1285593
1285594GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATTGGGAAAGGGAAAAATTTAACACTGCCGCA1285659
1285660GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATGACGCAGCGGAATACGTTTGCACAGCGCGT1285725
1285726GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAAATATGAACTCAATAAACAGCTTCCTACA1285791
1285792GTTCTGGCGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATCCAGCGCATTTGCAATTTCCGGATGATTCA1285857
1285858GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATTACAACCCAAAATTAGCGCACTTAGGCGAA1285923
1285924GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATACTTTTAAGGGATTATGTAATTAGCGAGGA1285989
1285990GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATCCGATACAGGAAGCATCGCAAACTACGGCG1286055
1286056GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATCGTATCAGGTTAAAAGTTCAATGCTTCGTA1286121
1286122GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATTTTAAGAGCTACTAATAAAATGATAGGGGG1286187
1286188GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATTCAATTAATAAATTAGGCGTTGCCGCGCAT1286253
1286254GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATGGTTGGCGATGGGAAGATTATCTCAAAGTG1286319
1286320GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATCCCTGTTACACTGTAATCAGCAATGCCTTC1286385
1286386GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAAATCTTTTATCACGTCAATACCTTTATTA1286451
1286452GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAAGGTGAGAGAGCAATATCACCCTGAATAT1286517
1286518GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATACATATTGTAGCACAATGTATTTGTCTTGT1286583
1286584GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATCCAACCAAACACCAAACACCGCCGCAAAAA1286649
1286650GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAAAGAATTGGGATTGGACAAAGCTGAATAT1286715
1286716GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAAACAGATGGGCGAAATTGTGAACTTACTT1286781
1286782GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATACAAAAGAAGCGGTTAAAGCAGGCATACTA1286847
1286848GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATCGACAATGAATATATATCTGTAGATAATGCG1286914
1286915GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATGCCCAATTCAATGATTACGTTGAGGTTGAG1286980
1286981GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATACATATTGTAGCACAATGTATTTTTTTTGT1287046
1287047GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATCCATATTGTAGCACAATGTATTTTTCTTGT1287112
1287113GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAAATCGGCAAATATATTTTTGAAGAGGTGG1287178
1287179GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAAAGAATTGGGATTGGACAAATCTGAATAT1287244
1287245GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATTGAAATTTTGGCGGATACGCTCTACATTAA1287310
1287311GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAAAGAAGTTGTATTTATATCTTCCGCCTGC1287376
1287377GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATATTGTGCTATAATATGTCTACAGCAGATAG1287442
1287443GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATCGCCAAGTGTTTTGTCCGTTGGTTGAAATA1287508
1287509GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAGCTGAAACAAACATGCTTGGAAGAGGTGT1287574
1287575GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATATTTGGCGATTGTAGGTTACGCGCCAAGCA1287640
1287641GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATCACGATAAAGCCCGCTGTAATTCATCATAT1287706
1287707GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATGTGCGCTTGGGCGAGCCGCGACGACGAGAA1287772
1287773GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATACGGCGCATTGAGGCGGCTGTTGCCGAATA1287838
1287839GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATTTGCCACGAAAAAGAACTGGAAGAGCGTAG1287904
1287905GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATCAGACAAACCCGTTGTAGCGCCCAACGGAG1287970
1287971GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATTTAACTCAATACGTATAACAAATTGCCTAT1288036
1288037GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATACCATATTGTAACACAATGTATTTTTTTGT1288102
1288103GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAATAATATTATTGACAACCCTGCAGCCTACTCG1288168
1288169GTTCTGACGGGACTAAAAAAATGGATTTGTTATAAT1288204
Left flanking sequence : Till position 1285396 (length bp)
ATGCTTTGTCAAGATACTAAATTAAACAAACACGATATAAAAAACTCCATCCATTCTTTACACTGATTTA
ACTTTTTAGAATTTGCTAATATGTATTAAA
Right flanking sequence : From position 1288204 (length bp)
AGGATTCACTCTTAAAGTTTGTAATTTTTTTGGTTTTTATGTATACTTTTGGAAGTCCATTTTTTTAGTC
CCGCCTCAACTAAAATTAAAACTGTCTTGC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp