Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP009506_8                                                                                                                 top


Strain : Methanosarcina siciliae T4/M GCF_000970085 RefSeq :NZ_CP009506 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009506_8
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATNumber of repetitions :71
Begin Position : 3870714 End Position : 3875875

3870714GTTCCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTCCGTAACATAGTGTCATAACCGGGGGTCTGAATAT3870787
3870788GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATCAAAAAGGCTAAGTTTTGACGCAAGGCCTTCTATGT3870860
3870861GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATCGAAGATTTGTTACTGTATTTGGAATATCAAATGATT3870934
3870935GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTGTTATAAACGTTGTCCGTATCAATGTACATCAGGATG3871009
3871010GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATATAGACGACTTGAAAGAAAACATCGAGATATCGAA3871081
3871082GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATATTGATAGCATCGGATGTATACATATACATAAAACT3871154
3871155GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTTGTTAGGCGCTCGGTCTCGATTAATTCGGTGGATGTCCCAT3871234
3871235GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATACTATTTTTATAATTGTTTTTGTTATACCGTCAATA3871307
3871308GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAGTCGCACATGTTGCCAATGCTCCGAAATATTATG3871379
3871380GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATACTCAATATATTACGATCTCTGGTGGAACGAAATAA3871452
3871453GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATGAATCGCAAGCAGCGCGGCTGACATAATCAATGGAA3871525
3871526GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATCATATAACACAAGGGGAATTTTCATATTTTAATAA3871597
3871598GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTGTTCTTTGTGGAGAGGATGATTTTCATTTGTAG3871668
3871669GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAGATAGAGAGTATGATAGAGTTCCTGTACACAA3871738
3871739GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTTCGTTGTTATCTTTTCCAAATAATCGCATACGG3871810
3871811GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATGTAAGAATCGTCATATCATTTGATATGACATAAAAATA3871885
3871886GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTTTTGTTCGGGGGTAATCCCCCCTGAACCATACCGAC3871960
3871961GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAGGATGAAAACATAACTTCCCTATCAAATCCAACCCC3872034
3872035GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATCTATTAAAGAAGCAAAGAAGGAAAGAGAGCAACTTGA3872108
3872109GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATACAGCTACAATTTCCCGGATAGTGGAATCGTCAATAA3872182
3872183GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATGAGGAGGCTGAAGGAGTCTAAAATCCTTGAAGAAAA3872255
3872256GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAGGATGACAAACGCATTAGCAGCATTTTCAAAAGAC3872328
3872329GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAACATATCCGCCATTTGCTTTAATGAGGATTGCAGAA3872402
3872403GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAACTCCCTTTTTCTTCTATCGCATCATCCCGATAAA3872475
3872476GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTGGAATTATCTGAGTTCCCATGAGTTCGATATCGA3872547
3872548GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATCTACCTTGCTTGTTTTTGTGACAGGGATAAAAGAAT3872620
3872621GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATATGAAAGAGTCTCAGGAAAAGTATTGTCCTGTAGA3872692
3872693GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATACGCCCGTTCAATTCGGGCAGACGGCAACATAGCAA3872765
3872766GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATGAAAGTAGGAATGATATTCCAAGGGGGTAAATACA3872837
3872838GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATATGGTGATAATTCGGGGGGTATACATGAGAATTATCA3872911
3872912GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATCGACGGCAGACTATTTTGTAATGTGTACATGGGCTA3872984
3872985GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAACTTCAGGAAAAAAGGTTCATCAGAGAAGGTGAACT3873058
3873059GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATACGATAACAGGAAAGACGTCATAGTATTCTGTGACA3873131
3873132GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATATTGATATCTGAGAACGAGCTCAGACCCGGAAACTCGGAAAATC3873212
3873213GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAACAAGCGTGAGCCCCTATGTAAGCGTCCCACTGAA3873285
3873286GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATCAGATGAAAATGAACGGGATCATAAACACGATCAGG3873358
3873359GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATCACACGAAAGCAGGCAGACGACACTATTAAAAAAGT3873431
3873432GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAGTTTAGGGTTTTACAGTACTCGGATGACCAATA3873502
3873503GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTTTTCATAGATATTATCATTTATTTCTTGATCTG3873574
3873575GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATGACGTGGTGTAAGTGAATTTGGGTGTTATGAGTT3873645
3873646GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTACTCATTTTTCCATTCTCCTGGGGTCGCTCTTACT3873718
3873719GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTAAAAAATGGTATCGAAGAAGGTTGTTGGGGGGTGAC3873793
3873794GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATATATGGAGGTATACTATTTTGGCTGAAAATATAGATG3873867
3873868GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAGTGTTGAATTATCTCAGAGTCAAGTTTTGAGAGTATG3873942
3873943GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAACCGTATATGAAAAGACAAGATCTACTTTCGATAC3874015
3874016GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATATTTTTAGACTTCTTATGGTACAAGTTACATTCAAT3874088
3874089GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTGACAAATCAGATAATAATCCTATATGCCCTTGGGG3874162
3874163GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATGGGATTAATTTTCGAGTAAAAGAATTAGAGTGTGAG3874235
3874236GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATACTCTTAGGACCTAATACATATTATGTTAGCAATTCTA3874310
3874311GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATACACATAAAAAAAATAGAATAATGCAGAGAGTTAAAA3874384
3874385GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAAAGAAGATGAACTAACGTATGAATATTTAGAACAGT3874458
3874459GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTGATGACGTAATAGCTCGTACTTCGACATCTGGGA3874531
3874532GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATCCTGCGGAGGAATCTAACCGCCTACAATGTATTCCCAT3874606
3874607GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATGAAAATAAGGGTGTGATTCCTTGAGAGAAGTATG3874677
3874678GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATGTTTGCTTCTCTTTTCGCGGCTTCAATTAGTATTTC3874750
3874751GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATACATGCCACGGGCGCGCGCGTTCATCGGCGGGACCAG3874824
3874825GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTGGAATTGTTGGGATTTCTGTAGAAGAACAGAAGAAAT3874899
3874900GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTTTCTCCCCTTCTTCAAGGGCCTGTTGTACTTCA3874971
3874972GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAAAAAACAGTCACCAGAAAATACTATTCTTCAG3875041
3875042GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATATATTCTGCTCAATCACCGACTGCATCCACTTCTCA3875114
3875115GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAGTGCCTCTTGATACCCCTTTGAAGTGTGTATATAA3875187
3875188GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTCTATTTCCTTGAACTGAACTCCGTGAAGTGCGAATCT3875262
3875263GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAAATAATTTGGAATCATTATCATGCGCTGAAGAA3875333
3875334GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATACGTTCCGCGTCGATGGTCACAAGATCGCAATGCA3875405
3875406GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATATCCAAAAAGGATAGCACCTGTCCGCGACGATTGGG3875478
3875479GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATACCGATACCAGCGAATGGCAAAAGATCAAACACCTCG3875552
3875553GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTCCGGTTATGAAACATACTGCCGGAACAACATTA3875624
3875625GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATAGGTGACGCTAGGCCGATATATCGAAGGCTTAGCA3875696
3875697GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATATTTCTGGCTCCCTCGAAATTGATGAAATGTATG3875767
3875768GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAATTTATGAATACTACTATATATACTTTTTTAATTAT3875838
3875839GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTTTCGAAT3875875
Left flanking sequence : Till position 3870714 (length bp)
TAGCTATCGTAGACATATATTATAATATGTTATAATATGATAAATAAATGTACATTCAAATTTGCCAAAC
TAGAGCCTGTAGAGTATCAACAGAAAAATT
Right flanking sequence : From position 3875875 (length bp)
AGGGCAAAATTTTCCGTTATTTGGCCAGAAAAGGTCTGAAATGAGCCCTTTTTCGGAGACAAAATTCTTG
CTGGAAAATTATCAAACCCTTTATAAATAC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp