Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP009557_5                                                                                                                 top


Strain : Clostridium perfringens GCF_001304735 RefSeq :NZ_CP009557 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009557_5
DR consensus (36 bp) : GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATNumber of repetitions :23
Begin Position : 1711152 End Position : 1712637

1711152TAACATATTATAAGTAAATTCTCGATATGCTATAATAGAGCTTTAGAAGAAGAGAATGCAAAACTT1711217
1711218GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATGGATGGACTTTATTTGGCAAGAAAGTTTAT1711283
1711284GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATGGTCTTAAAATAGGTTCGATTTTATATTAC1711349
1711350GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATGGTAACATTACAAGTATCTGTATTGGTGAA1711415
1711416GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATGGAGGAACTATGGACAAGACATTATTTAAA1711481
1711482GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATATTGTAATTTTTTTATTTAAATATTTTTCT1711547
1711548GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATTTGCAATTGCTAAACAAGAGGGAAAATATA1711613
1711614GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATGGCTATATTCAAGATTCATCTGTTAAAAGT1711679
1711680GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATCCTTTAGGAGCTTATGAATTATCAATTCAA1711745
1711746GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATCCAGTTGGACTTGTATCTGTAGGATTTAGA1711811
1711812GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATGGGCAACTCTAAGGGCAAGAGTGGTGGTGC1711877
1711878GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATCTAATACAACTGCAATAATCTTTTGGCTAA1711943
1711944GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATGAGGATGGAATTGTTGAGAATATAGAATGT1712009
1712010GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATGCTTTTGATGCAGATACTATTTATATTTTA1712075
1712076GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATTATAGCAAATATCAAAGTTGTGGATATACA1712141
1712142GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATAACTTTAATACAATGGAGTATAACTCGATT1712207
1712208GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATGCTAATACAATCTTTCCCGCACCTTCCCA1712272
1712273GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATATGCAAGGAATGGAGCATACTATCCAATTC1712338
1712339GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATTTTCAATATGTCTCCGACGGCACTCGCCGT1712404
1712405GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATGCACCACCGACTACACTAGGAACATCAGTA1712470
1712471GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATCATGCCCCTTTATTTATCTGTAGGACTTAA1712536
1712537GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAATCTTGGGGTGATGTAGGTTCTATAGATAAA1712601
1712602GTTATAGTTCCTAGTAAATTCTCGATATGCTATAAT1712637
Left flanking sequence : Till position 1711152 (length bp)
TCTTAATTTCTTTTAAGTTCATTTGTCACCTCTAAATAAAATTTTATAAATATTTTTTAAATTAATATAT
AATAATATAATAACTTAAAATTAATAAAAT
Right flanking sequence : From position 1712637 (length bp)
AGGAACTAATGAACCCCTTGAAACAACTAATTTCAAGGGGTTTTTACTTTCTAAAAAACATTCAATTGTC
GTGAATTTATCTTCTTTTCCTGCTTTTTTG
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp