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CRISPRs details
NZ_CP009933_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP009933_3                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium scatologenes GCF_000968375
RefSeq :
NZ_CP009933 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009933_3
DR consensus (30 bp) :
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
Number of repetitions :
33
Begin Position :
766433
End Position :
768564
766433
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
TATGTATTTAAAATTAATTTTGTTGATTTAAGATTG
766498
766499
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
ATCATATAATCATCTTTATAAATCCATACTGTTTT
766563
766564
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
TGGCATTTACCGTATCTACTTTTATTGGTTTATTA
766628
766629
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
GTAGTCATTGCCTTAAAATGCATCAAATCAGTACTT
766694
766695
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
TTTTAGATAACATATATTCTTTAAACTTGTCTTTAG
766760
766761
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
CGTGAAAGCTCATTTATTTTAGTTTGAATATCCTT
766825
766826
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
AATGCTTACAGAATTAAAACAGGTTTAAGTAATGA
766890
766891
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
AATGAATAATGATGTTGAACCAATTATGTAAAAACC
766956
766957
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
ACAAAGCTTGAAGCCGAGGCAGAATGGATCGTAAT
767021
767022
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
ACAAACCAGGCATTGCTGCCATTATTTCTTGTGTAG
767087
767088
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
ATTCCTAAAAGACTTGAAGCATACAACAGTTTTTCT
767153
767154
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
ACTTATCCCCTCCTTAGAGAGAGGATTAACCTCTCT
767219
767220
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
GCTTCTAATGGAGCTACTGCTTTTAATTCTTGATCT
767285
767286
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
GATAACTGTGCATATATTTGAGTAGTTGCTGGTGT
767350
767351
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
AAGAAAAATGCCAATAGGATGCGTCTTAGAAATTAG
767416
767417
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
GCATCTTTTCCTTTTGTGTAAGTAACAAAATATATT
767482
767483
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
TACATATCTGAGTTAGGGTGTGCATGATATTCGTCT
767548
767549
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
TTTTCTATAAAGTATGCAAATAAATCCAAACCTTTA
767614
767615
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
GATGAATTTTTAGCAAGTACCATAAGTTCCTTTA
767678
767679
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
AAAGTTTTATGAAAACTATTTCCATAATCGGCGTTC
767744
767745
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
AGAATAATCCAAACTATGTTAAATTCATAAATAATC
767810
767811
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
AAGAAAGAAAAGTTATATATATAAAAATTTTGATAG
767876
767877
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
GTAGGAACACAAGTCTCTACAAATACTTTAGATAT
767941
767942
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
TTAACAAATGGTTGTTTCCCATTGTCTCTCCATGAT
768007
768008
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
AGATTTATGTCTTTAATCTTTCCTTCAAATTTATT
768072
768073
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
GATGCAGGTGGTTTTATGATTCGCGAAGTCGGTATA
768138
768139
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
TAGATTAGTTTGTGCTTTTGAAGATGCAGGATTTAT
768204
768205
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
GATGAGGATCCTGCACAAAAAATTACTGACAAATAT
768270
768271
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
TATAGAGAACGACAAGGTTGTTAGTAAGAGAGGTACA
768337
768338
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
ACAAATAATTAATTTGTACAAAGCTCTAGTAAAA
768401
768402
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
TTCCCAAATCCACTTAATTTTGTTATTATTCCAGCAA
768468
768469
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAAT
TTGTTCCAAGTCAATACAAATTTATTCAAAATCGTT
768534
768535
GTTGAACTTTAACATATGGCATATTAAAAA
768564
Left flanking sequence : Till position 766433 (length
bp)
TTTTCAAAAGTAAAAAATGGCTGGTAAAATTTTAAGAAAATCCTTTAATTTCAATGGATTAAGAGGTATA
ATAAAAAATGAGAATGGCTATTTTACAGTG
Right flanking sequence : From position 768564 (length
bp)
TAAATGCTATTGCTTTAAATTAGCAGTAGCATTTATTTTTATGAATGTTTAAATAGCATTGTTTGTGTTA
AAATAATTGTTAAGGAAGGAAGTGGTTAAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp