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CRISPRs details
NZ_CP010888_15
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP010888_15                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridioides difficile GCF_001577795
RefSeq :
NZ_CP010888 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP010888_15
DR consensus (29 bp) :
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
Number of repetitions :
27
Begin Position :
3822106
End Position :
3823834
3822106
ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGT
GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA
3822169
3822170
TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAAT
AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT
3822234
3822235
ACTTATCTACCACTTAGTTAATATAAAAC
AATGATACTGTAATATCTAAAGATGTTACATTGGCAA
3822300
3822301
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CATCTTCAGTATCATATGCTGAAATATTATCAAG
3822363
3822364
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
GGCAATCATGTCAAGTACTTCTAATATAAAAAAGTTCT
3822430
3822431
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CTTACATGGAAAACGAAACATATTTAATTTGTTCTGA
3822496
3822497
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAATGAAGCATTGAGTTTAAATAGCGATATTAGAAA
3822561
3822562
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTCAATGAACTAGGGTTTAAAATACATTCTAGCCCGA
3822627
3822628
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTTAAAATTCCGGACAAACAACGCTAAATCAAAAGA
3822692
3822693
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TAATAGAATTATAGCATCAACTAATCGTAAAATATTT
3822758
3822759
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTGCGGTAAGACTGTTTGTTACAGGGATGGCAGAGTC
3822824
3822825
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TCAACTCTCCTTGATAGATTTAGCCTATCTTGCGAT
3822889
3822890
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
GAACAAATTTAATGGAAGCAATAAAAAGTAATGACG
3822954
3822955
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
GGAGGAACTAAATTTAGCTTACTTTGATAAAGAAAG
3823019
3823020
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TCAATATCTTTTCTTATTAGTTTCGCAAATTCTTCAT
3823085
3823086
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
GAAGGCAAAAACTAATGACTAATAAAGAGAAAATAAA
3823151
3823152
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ATATTTAAAGCAAGTACTTTTTTAAGAAAACTTA
3823214
3823215
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ATGGCTAAGAGATACAGATAAAAATATAAATGAATGGT
3823281
3823282
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATTACGAGAAAAATTTAAAAACGACTAAAATCCAT
3823346
3823347
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TCCATTTATTTTATATATTAAAATTATAGCATTCGA
3823411
3823412
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CTTTTGTTTTAGGATGATTATATAATATTACAAATTT
3823477
3823478
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTGGACTTATTTTATTGACTTATAAATTATCTAATTT
3823543
3823544
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAGCAGAAATAATAGGACTAATATCTATATCAACCAA
3823609
3823610
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
GATAGAAGAAAATAATATAAAAGTTACCCTAAATTA
3823674
3823675
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTAGAAGATATAGAAGTTCTTGTAGATACTGTTGAG
3823739
3823740
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TAAATTTAAAATAAATTATTAAATATCCGAAAAAATT
3823805
3823806
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
3823834
Left flanking sequence : Till position 3822106 (length
bp)
TGATTTTATTTATATCTTTATTGTTTAATTTCTTTATCATAAATTTTATTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATAATGTTTATAGGTAAGTTTATTTT
Right flanking sequence : From position 3823834 (length
bp)
CCCAAAATAGGTATATTTGAATACATTGAAAACACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAGCAGTAGTGCAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp