Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP011266_7                                                                                                                 top


Strain : Methanobrevibacter millerae SM9 GCF_001477655 RefSeq :NZ_CP011266 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP011266_7
DR consensus (37 bp) : GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATNumber of repetitions :21
Begin Position : 1356865 End Position : 1358348

1356865TGTGCTTTCTTTCATTTAATAGAATAACCTTTGCAATTTGAAGACATTCAAGAATACATTCAAGCAACAGGC1356936
1356937ATCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACTTTGCAATAATGAAAAGACATGGACTAACAAAAAACATAACAAA1357008
1357009GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATATAAATTCCACAATTTTGGAGACCTTGAAGAAGTC1357080
1357081GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATACCTAAAAAGAAAACCATCAAGGTTTTGAAAGAGGA1357153
1357154GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATATCAACAACGAATTATGGTCATGTTAAACTAAGGGA1357226
1357227GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATCAGAAGTTCAAAAAGCATTTAAGACAACAG1357293
1357294GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATAACAAGTATGCACATTCATTTAAACAGACAATATCT1357366
1357367GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATGATATTTGATATGATATTTAATGATAATGATAGATTG1357440
1357441GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATAAAGCATAACATCGCAGAATATCCTTTTATGATTGA1357513
1357514GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATTCATCAGCAGGAGTGTAAGCAAGACCACGCTTTAA1357585
1357586GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATCTATACAATTACAAAAAAAGGAAAAGAAGATAATTG1357658
1357659GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATGACAATCTGCCATGATGTCACCATTGCGGAAAGT1357729
1357730GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATTTCAGCAAGAAATAGTATTCATCAAAGGAAAAGAAG1357802
1357803GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATGAATGTATTAAATATCGAAAACAAAGATGCAAAGCA1357875
1357876GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATACAATGAGTCTATAATGTATTTTGAGTTGTCAAATAT1357949
1357950GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATGAAGCAACATTCAGATTCTACAGTTTCCTAGATAT1358021
1358022GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATTTTAGAATACATATTTGAAGAAAACGGAAAAACAA1358093
1358094GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATCTTATATACTGACAAATTAAGTGAGTCAGAAGAGTT1358166
1358167GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATAAAATTGGAATTAGAAATGATAATAGGCATAAAAG1358238
1358239GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAATAAAAGAAATTATAAAAATAATTAAGGAGGAAAATGA1358311
1358312GTCACAATCCTTGTTTTAATAGAATAACCTTTGCAAT1358348
Left flanking sequence : Till position 1356865 (length bp)
TTTAATTTATCTACTATTTTCATAATTATATCTATCACCCTAATATCTATAAATACAACGGATTTTCTTA
AAACATGAAAAAGAGTGCCATGACTTTGAA
Right flanking sequence : From position 1358348 (length bp)
AGGGTGGAAAATTTCCTTTAAATAACCTACAACTTGCAAAAATTACTGCGACATACAGCACTTATGAGCA
AACCTAAAAATATAAGTACTATATATAAAG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp