Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP011280_3                                                                                                                 top


Strain : Sneathia amnii GCF_000973085 RefSeq :NZ_CP011280 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP011280_3
DR consensus (37 bp) : TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGATNumber of repetitions :14
Begin Position : 588428 End Position : 589278

588428GATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGATCAAGGGTGGTACAACAGATTAAATAA588490
588491TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGATCCTTTAATTCTTTTACAAAAGTTAAT588553
588554TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGATAGTTGTTTTCACATGTTGGTATATA588615
588616TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGATCGATATAATCTACATAGTTTGGATAA588678
588679TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGATAAGAAATGTTGCTTGCTCACATTCA588740
588741AATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGATAGTTGTTTTCACATGTTGGTATATA588802
588803TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGATTATATCCGTTGTGTTATTGTCTGGT588864
588865AGTTTGAAAGCATATTTTAATTTCTACTATTGTAGATGAAGAAGAATTAATCGTGCGTTAATC588927
588928GATTTGAAAGCATATTTTAATTTCTACTATTGTAGATTAGAACATATTAATCGTAGTTGCACA588990
588991GATTTGAAAGCATATTTTAATTTCTACTATTGTAGATTGGAATAAATAATGCAACAATTGTAA589053
589054TATTTGGAAGCACATTTTAATTTCTACTATTGTAGATTAGTATCATATCTTTATACTTACCAT589116
589117CATTTGGAAGCATATTTTAATTTCTACTATTGTAGATGGGAAACTAATGCTAGCAATGGTGA589178
589179AATTTGGAAGCACATTTTAATTTCTACTATTGTAGATATATGTATTTTGAATATTAGGTATCT589241
589242TGTTTGGAAGCATATTTTAATTTCTACTATTGTAGAT589278
Left flanking sequence : Till position 588428 (length bp)
TTTTAAAATGCGAAAAAATCAAATCTCTCAAATGTAAAAAAAATAGGTTTGCAAATATGTGTCTTGTAAG
CCAAGTAATTATTGATGGATCACATTAGAG
Right flanking sequence : From position 589278 (length bp)
AGAGTAGTGTAATTTATGAATAGGGGACATTATTATAAATAGTTATAATAAATATGATATAAATGAATAT
TACATTGAAAATAATAAATATTTAAAGGGT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp