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CRISPRs details
NZ_CP011280_3
Flanking alignement tool
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NZ_CP011280_3                                                                                                                 
top
Strain :
Sneathia amnii GCF_000973085
RefSeq :
NZ_CP011280 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP011280_3
DR consensus (37 bp) :
TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
Number of repetitions :
14
Begin Position :
588428
End Position :
589278
588428
GATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
CAAGGGTGGTACAACAGATTAAATAA
588490
588491
TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
CCTTTAATTCTTTTACAAAAGTTAAT
588553
588554
TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
AGTTGTTTTCACATGTTGGTATATA
588615
588616
TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
CGATATAATCTACATAGTTTGGATAA
588678
588679
TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
AAGAAATGTTGCTTGCTCACATTCA
588740
588741
AATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
AGTTGTTTTCACATGTTGGTATATA
588802
588803
TATTTGAAAGCATCTTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
TATATCCGTTGTGTTATTGTCTGGT
588864
588865
AGTTTGAAAGCATATTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
GAAGAAGAATTAATCGTGCGTTAATC
588927
588928
GATTTGAAAGCATATTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
TAGAACATATTAATCGTAGTTGCACA
588990
588991
GATTTGAAAGCATATTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
TGGAATAAATAATGCAACAATTGTAA
589053
589054
TATTTGGAAGCACATTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
TAGTATCATATCTTTATACTTACCAT
589116
589117
CATTTGGAAGCATATTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
GGGAAACTAATGCTAGCAATGGTGA
589178
589179
AATTTGGAAGCACATTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
ATATGTATTTTGAATATTAGGTATCT
589241
589242
TGTTTGGAAGCATATTTTAATTTCTACTATTGTAGAT
589278
Left flanking sequence : Till position 588428 (length
bp)
TTTTAAAATGCGAAAAAATCAAATCTCTCAAATGTAAAAAAAATAGGTTTGCAAATATGTGTCTTGTAAG
CCAAGTAATTATTGATGGATCACATTAGAG
Right flanking sequence : From position 589278 (length
bp)
AGAGTAGTGTAATTTATGAATAGGGGACATTATTATAAATAGTTATAATAAATATGATATAAATGAATAT
TACATTGAAAATAATAAATATTTAAAGGGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp