CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP011373_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP011373_1                                                                                                                 
top
Strain :
Nonlabens sp. MIC269 GCF_001430865
RefSeq :
NZ_CP011373 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP011373_1
DR consensus (35 bp) :
AATCAGCCTTTAGATAATTGGAATGTATCAAATGT
Number of repetitions :
11
Begin Position :
1748060
End Position :
1748838
1748060
AATCAGTCACTTAATAATTGGAGTGTTTCAAATGT
TACTGATATGAGCTTTATTTTTTCTCTGTCTCCTTTC
1748131
1748132
AATCAGCCTTTAGATAATTGGGATGTTTCTAACGT
CACCGATATGACCGATATGTTTTCAAGTGCTTCTAGCTTT
1748206
1748207
AATCAACCTCTTAATAATTGGAACGTTGCTAATGT
TACTAACATGCAACAGATGTTTGCTGGTGCTTTATCTTTT
1748281
1748282
GATCAACCTTTAAATAACTGGAACGTATCAAATGT
TACAAATATGCGTTTGATGTTCTCAGAAACTCCTTTC
1748353
1748354
AATCAGCCTTTAGATAATTGGAATGTATCAAATGT
TTCAGACTTGAGCCGTATGTTTCGTGAGGCAAGTAATTTT
1748428
1748429
AATCAGCCTTTAGATAATTGGGATGTATCAAATGT
CACAAATATGAGTTTTATGTTTCAACGTGCAGTCAGTTTT
1748503
1748504
AATCAAACCCTTGATAATTGGAACGTTTCTAATGT
TCAAAATATGTCAGGTTTATTTAATAGTGCTGGTATTTTC
1748578
1748579
AATCAAGCACTTAGTAATTGGGACGTTTCTAATGT
TACTGACATGAGTAAAATGTTTGAAAACGCTCCTTTATTT
1748653
1748654
AATCAACCTTTGGACAACTGGGATGTCTCAAATGT
TACTGATATGTCCAATATGTTCAGTAAAACAGATTCCTTT
1748728
1748729
AATCAGCCGTTAAATAATTGGAATGTCTCAAATGT
TACTGACATGTCCTCTATGTTTAGAGAGGCAATTGCATTT
1748803
1748804
AATCAGCCTCTAGATAATTGGGATGTTGCTGAGGT
1748838
Left flanking sequence : Till position 1748060 (length
bp)
TTATATGTTTTTTGGTGCGGATAATTTCAATTCCGATATATCTAGCTGGGATGTTTCCAATGTTACCAAT
ATGCGTTATATGTTTCGCGAAACATCTTTT
Right flanking sequence : From position 1748838 (length
bp)
TAGCACTTTCCAAAGTATGTTTGCAGAAGCTACTAACTTCAACCAAAATATTTCAACATGGAATTTTAAT
CCCGTTAGCTTGAATAATGATCCACAAGTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp