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CRISPRs details
NZ_CP011391_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP011391_1                                                                                                                 
top
Strain :
Faecalibaculum rodentium GCF_001564455
RefSeq :
NZ_CP011391 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP011391_1
DR consensus (31 bp) :
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
Number of repetitions :
31
Begin Position :
137126
End Position :
139197
137126
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TTGATGACGTCGTCCAAGTCCGTATCAGGATCCGCATTTT
137196
137197
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
AAGTTTAGATTTCTTAAACATTTTTTTATTTCCTTTCCT
137266
137267
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
AATATAATTCTTGGTTTGTAAGCTCATAAACAGGCATAT
137336
137337
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TCCACGTGTTGCACCAGTAAGAACCAGAATCGTTTC
137403
137404
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
GTTTTCGATTTTCAGGCTGTCCCGCTCCTGCTGCTC
137470
137471
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
CTGCCATTTCTTTGATGATTCCCTGCGTCATTGCTTCA
137539
137540
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
AAGTGTTTCTGAAGTTTAGATTCATTAAACATTGTTTTA
137609
137610
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
AATCTGCTTCACGGACAGCTTTCTTCAGATTACG
137674
137675
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
CTGGAGCTCTGCTAGCACGTCATCAAACTCCGGATC
137741
137742
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
CTGAAGTTTTTGGTATCGTGCCTCGTTCAGGAAGTTG
137809
137810
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TGGTTGTATCCTCCTTACATCCATTTCCAGTTACG
137875
137876
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TTTGTCGCTTCAATGATGTTCATGTGTGTGTCTCCTT
137943
137944
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TAGAATTCGTCCAGGTCTTCTTTGCTGGGAAATACC
138010
138011
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
CGATGCCAGAGTCGTCAAAAAGATCATGGGCCATAAG
138078
138079
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
CAGTCCCAGCCCTCAGTCAGAAGCATGCTGTTGA
138143
138144
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TCTAATTTGTCGTAATCTGCTGTCTGCATTTCGTCTT
138211
138212
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TGTTTCACGGATATAACATTTTACATCTGCGTTTGT
138278
138279
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
GCAGCGCTGTCACCATCAATCTTCCCCGGGCATCGT
138345
138346
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TTTCCCTGGATGATTCGTTCATCCAGTTTTTTCTG
138411
138412
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATAAACGC
TGTAAATATCGTTAAATCCTTCCCACTCTGCCACCTCTTCTA
138484
138485
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TCAATAGCCGTTGTCCTGCCTTTCGTGGTTGACCCGG
138552
138553
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
AAGCAATTTTCCGTGTGGCACTGAGAAGATACAAATTTG
138622
138623
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
GTGATGAGCTGGAAACAATTATTGATGGCGGTTGAAACA
138692
138693
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TTTGTAGTTTTCCATGTGTTTACCTCCTAGGCTATTCCAGCCA
138766
138767
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TTTAACCAACTCCGATAACGTCTGACTTGCTTTT
138831
138832
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TCTGCTGCCTGATAATTTTTTGTCAGCAGGTATTTC
138898
138899
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
GACAATCTTCATCCATTTACCTGTCAGAACGCCTTCAT
138967
138968
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
GTAATCTCTGCGCTGACCATGTGGCTCTGCGCTGT
139033
139034
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACGC
TAAAACTTTGGCGGTAAACACTGTGGCCGCTCACAAT
139101
139102
GGTAAATATTGTTCTTATTAAGGATTAACAC
CGCTCCAGTCACCTGCAGCTCTGACCCCATCCAG
139166
139167
GGTAAATATTGTTCCTGTTCAGGGTTAACGA
139197
Left flanking sequence : Till position 137126 (length
bp)
TTTGGCGTATAATCAGCTTGTATCCGGAGACTGGGACAGAAAACGAGTAGTTTTGTTCATGAACTGAAGA
CAGACTATGATTTTTGTCCGCGAGGTCTCA
Right flanking sequence : From position 139197 (length
bp)
AGGAATGGTTCTGTCGGTACCAGTCTTCCGACAGCCATCAGAAAAAGACCACTCCGCAAGTTTCGGGTGG
TCTCTCTTTCTGATATGGAATTTTCACATG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp