Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP011522_9                                                                                                                 top


Strain : Streptomyces sp. CFMR 7 GCF_001278095 RefSeq :NZ_CP011522 (chromosome linear)
CRISPR id : NZ_CP011522_9
DR consensus (29 bp) : ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCNumber of repetitions :15
Begin Position : 3813333 End Position : 3814215

3813333ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCAGGCCCGGGGGGCGCAGCGAAGCGCAGAGGGC3813393
3813394ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCATCGCCAAGTCGAAGCCCGAGATCCTCGACCG3813454
3813455ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCCTGGCCCCGGCTGCCCGGTTGCAGGTCCGCCC3813515
3813516ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCGGCTCGGAACGCGAGGACCAGGTCCAGGCCGT3813576
3813577ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCGTCCTGTTCCAGTTCAACCGGCCGGACAGCAA3813637
3813638ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCTGGCACCGGTCGGTGCTGTGCCAGCTGCTCGG3813698
3813699ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCCGCCGGGGTGGGTGCTCTGGCCGAAACACAGC3813759
3813760ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCGTCGTCACGGTGAGGACGGAGACGGCGCGCTG3813820
3813821ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCCCGGACGGGCATCGCAGAAGCTTTCGACCGTG3813881
3813882ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCGCCGCGTCCAGACCGGGCGCGTCGATGACGTA3813942
3813943ATGGTCCCCGCGCGTGCAGGGGTGGTCCCGAGGCATTCGGGGGCCGGGACGCGGAGGCCTT3814003
3814004ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCACCGCGAGCTTCTCCTCCAACCGCACGGTGTC3814064
3814065ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCACCGCGAGCTTCTCCTCCAACCGCACGGTGTC3814125
3814126ATGGTCCCCGCGCGTGCGGGGGTGGTCCCTGGAGAAGGCCCGTAAAAGCGCCACGCGGTCG3814186
3814187ATGGTCCCCGCGCGTGCCGGGGGGACCTC3814215
Left flanking sequence : Till position 3813333 (length bp)
TCGCACCTCGGGCCGCCGATGAAGCGAGGTCGATATGTCCGTTTCCCGGGAAGTGATGGAAAACAGCACC
TCGGCCGCATAAACCCGCAGGTCAGGAACT
Right flanking sequence : From position 3814215 (length bp)
GGCGGAGCCGACGAACGCCCCCATGCGCTCGTTCCCCAGGGCGTGCGCACCCTCCGAGGCACCGCGAAGG
ACGGCCGGCGGAGGATGCGCAGCCCCGGGT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp