Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP011564_5                                                                                                                 top


Strain : Halanaeroarchaeum sulfurireducens M27-SA2 GCF_001305655 RefSeq :NZ_CP011564 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP011564_5
DR consensus (30 bp) : GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCNumber of repetitions :58
Begin Position : 841117 End Position : 844914

841117GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCACCAACACCTGGACGTCCTGATTGAGTGGAAAAATA841182
841183TTGCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCCATGCCGGATTGTTCATTATCCACCACTGCCCTA841247
841248GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGTTCAACAGCGATGGAACGAAGGGACGCATCCG841310
841311GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGGTTTCAGAAAATGGCTCCTATCTAGCTCAATGCGG841376
841377GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCACGGTGCGTGCGGTCTGGAATGAGGTACTATTTGCAG841443
841444GTTCCAGACGGACCGTTGAGGGGTTGAAGCAGCCCAAACATATCGAGGATGCATGAAAAATCGGCG841509
841510GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGTCCGGTACGCGGATACCCGAGCAAAGAACCGGGCG841575
841576GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCTGACGCACCTCGGGGATAAGGTCCCGGACGGTCGAAGCCGA841647
841648GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCAGGTGATCGTACTTGACCTCGTGTTCGTCGGAGCAG841713
841714GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCTTTGATGACGTTCACGTACTCGTCGTTCTTGTCC841778
841779GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCACGTCATCCGACCACGGGGACGCCTCGCGGTCCCC841843
841844GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCGCGTTCTCACCCGTGCCAACCGCAAGATTTTTGGCG841910
841911GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCAACTCTTGCTCCAACTCCAACTCTTGATCCAACCGC841977
841978GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCACCACGCGTTAGCCTAACGGTCATAATGCCTGCAGG842043
842044GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCTCGGGGTACAGCCGCCTCAGCGCTGTCTCCGAGTAG842109
842110GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGAGGACGAGGGAGAGACGTACAACTGCGGCGATTGTG842176
842177GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGGCTGGCAAGCGCCCTACCAGGCCCAAGAGCGGTTC842242
842243GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCTTCACGCTCGCCGCCACCTGAGGAAATCTACGAAT842307
842308GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCGCATTGTCTAGCATCCAGCAACAGCAGGCGGAGGAA842374
842375GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCATACCAGATTATCAGGTTGTCAACGAAATCGGGCGC842440
842441GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCTGCGTCAGAACAGAAGGTCTACGATGGGTCGGTGTG842506
842507GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCGACCCCGCACGACCACAATCTTACTTACTAACATGG842573
842574GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGAGGGTGAGACGGTCGAGGTTCCGACGACCTTCGA842638
842639GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCTTGAGCCGTTCCATCATCGGAATCACCCGAACCGC842704
842705GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCTTGGTCCCTTCGATCGTTCGCAACGTACTCGAACCTA842771
842772GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCTGGTTTACGCCACCGTCGACGATCGGAGCATCCTC842837
842838GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGGTCGGCGTCGTAGCCGAAGGCGATTATCTCCGTGC842903
842904GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGGTCGCTTCGCGGGTCGTCGCTGACGGTCGTCGAC842968
842969GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGCAGGGGGCGGAAACCTACCGCGAAAAGATTAGCGA843034
843035GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGAAGCCGAGAGCGTCACGCCCGAAGCCGTCGTGGACGTG843103
843104GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGTCAACGGGCACGATCGCGTAGCGGCCCGGCTCCGG843169
843170GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCATCTATTTGCCTTTGTGAAACGGCGATTGCGGCCCCC843236
843237GTTCCAGACGGACCCTTAAGGGGTTGAAGCTTTCGGCACGGCTTCATCATCGTTGGCCTCCACCATT843303
843304GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCCCCATGAGGCGGCGGCCACGCCAAGATTGAATCC843368
843369GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCAGTTCAGCCCAAACCGTTCAAGCATTGACTACACGCG843435
843436GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCTAACTTTTGAATCCGCTTGTCGTCGGCCATGGTCAC843501
843502GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGAACGGCCAAGAGTGCAAAAGCGAGGGCGGGCAAACTG843569
843570GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGGCTTGCCACGAATGCGGTGGTGAGGTTTTAGCGG843634
843635GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCTGCAGCAAGCAGGTGTTGGCTTCGATGTTAAAGCGG843701
843702GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGTCAGTCGGTCGCTGGTTGCCGTCGGACATTGCGTAT843768
843769GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGAAATGACTGACGAACAACTCGCCCGCGACGACGA843833
843834GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGCAATCAACTGGTGGTATCCCAATAAGCGAGCGTGG843899
843900GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCTTGGAGTGACGAAGGCCAAGACCCATTCGGCGGA843963
843964GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCGCACCTGCGACCGCCGCTAGGGCGAGGATGGCGGTGT844031
844032GTTCCAGACGGACCCCTGAGGGGTTGAAGCGACGCATCGACATCCTGATCCGTGTTGTCGTCCGC844096
844097GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGTATGAAATTTTACATCGCTGATTCGTCCGGTGATGTG844164
844165GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCTCCGTAAAACTGCACCGTAACGTTGATCGGCTCGG844229
844230GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCTGAGACGCTTCACGGCCACCTTCACCCATTTAGA844294
844295GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGCCAAGTCGGCGTGGTCCCCCGTCTCACCAACCGTC844360
844361GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGCTGAAGGTTACGCTCAGGGAAAGGAGGATCATCATA844427
844428GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCTTGAGTCCATCCGCCGATGCATCGACTTCGTTATCG844493
844494GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCTGGATATGACCGTTACAGACGCCCGCGAGGTGCAAC844559
844560GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCGTGATTTCGATCTCCGAGTCGAGGGGGTCCTCGA844623
844624GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCAGCGAGCGCTACAACGTCAGCAAGACCTACGCGA844687
844688GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCTGGCCGGGCTGTTCGGGCGTGAATTGACCGACGA844751
844752GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCCCACGTGCGTCCGTGGTCATGTCCTTTCTTGGGCTATG844819
844820GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGCATCAATCAGGCGAAGCGAATTGCACCGAAAGGTGT844884
844885GTTCCAGACGGACCCTTGAGGGGTTGAAGC844914
Left flanking sequence : Till position 841117 (length bp)
TGTTCATCGACCCCCGGGGTTTTGGCGGCTACTGCGGGTCGACGAAATAACTAAATGCTAACCGCGTATA
TTACGCGCTGTATGGCCGAAATCGGCCATG
Right flanking sequence : From position 844914 (length bp)
GTCAAATGACGGACTTCAGTGCATCCAATCCTCGGTTTCAGATTTAGCTTGAAGATGTAAAGAATGACGC
CGTGCGAAGCGATACACGATCCTCGTCATT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp