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CRISPRs details
NZ_CP012275_1
Flanking alignement tool
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NZ_CP012275_1                                                                                                                 
top
Strain :
Pediococcus damnosus GCF_001611075
RefSeq :
NZ_CP012275 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP012275_1
DR consensus (36 bp) :
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
Number of repetitions :
15
Begin Position :
1223607
End Position :
1224568
1223607
TTCCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
ATGTGTATACAGTCAAGCTTTTTTACATTA
1223672
1223673
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
TGCCCTCAACAACGTTAGCCAACGCCACAC
1223738
1223739
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
CATGAGTGGTACTTAACCGACGACGACCGG
1223804
1223805
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
TGGTGGTTGCTGATACAGCTTTATGGTCAG
1223870
1223871
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
ACGTATGTGTGATGAAATGCCAGATAAGAT
1223936
1223937
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
TCCGGTGCGGAATCAATTTGCGATTGAGTA
1224002
1224003
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
AGATGTGCATGACGCACGGTTCGGACAAAC
1224068
1224069
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
AAGGAAATGGTGAGTTTGCGATTGTTAATG
1224134
1224135
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
ACGTTCCTGCCATTGGCAGCACAAACTTTT
1224200
1224201
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
GCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTG
1224266
1224267
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
TTAGTTCAACATTAGGATCTGCATATAATA
1224332
1224333
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
TCATGCTGAACGTCTTTATCATGTTTTATG
1224398
1224399
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
TGCGTTTGATGGTGCCAAAAATGTGGAAGTG
1224465
1224466
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
TTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGT
1224532
1224533
GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
1224568
Left flanking sequence : Till position 1223607 (length
bp)
TTTAATGAAGTTCAGATTTTGGTGCAATTGAGGTTCATTTATTTTATATATACGATAATAATTAAAACTA
TTTTACCTCAATGCGTCAAGCCGCTCCTGA
Right flanking sequence : From position 1224568 (length
bp)
CGTTTTTTTATAATGCTACTCTCATAGACATTAATAACGCCAATCAACAAAATCCTGATCAACGTAGCAA
TAACGGCATTTATCGAATTCTTCGTGATTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp