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CRISPRs details
NZ_CP013243_6
Flanking alignement tool
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NZ_CP013243_6                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium botulinum GCF_001889325
RefSeq :
NZ_CP013243 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP013243_6
DR consensus (28 bp) :
TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAA
Number of repetitions :
21
Begin Position :
4017733
End Position :
4019014
4017733
TTTAAATACACCTAATGTAAAGGTTAGA
CTTAAATTTAACAAAAATAATACTAATAGTAGTACATATAAG
4017802
4017803
TTTAAATACATCCAATGCAGAAGTTAAA
TTTGTTTTTTATATTTTCTATATCCTATATATTATTG
4017867
4017868
TTTAAATACATCTAATGTAAAAGTTAAA
CATTATTGTAGCTTAATAAATTATTATTACTTTTTTA
4017932
4017933
TTTAAATACATCTAATGTAGCAGTTAAG
TTTTTTCTTTAATACTTTCATTAGTACCCCTGG
4017993
4017994
TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAA
CTTATTAGAAACTAAAAAAATCGGAGGTTTAAAAAAAG
4018059
4018060
TTTAAATACACCTAATGTAAAAGTTAAA
CTTAAATAAAACTAAAAATTTTTATAAATCGATAG
4018122
4018123
TTTAAATATATCTAATATATAAGTTAAA
TCCATCTTACTCTATTTTCCATATTTCAAATATGCGTG
4018188
4018189
TTTAAATACATCTAATGTAAAGGTTAAA
CTAAGAAAAATTATAAAACATGGAGGATGATACTAG
4018252
4018253
CTTAAATACATCTAATGTACAAGTTAAA
CTCGATTTTTTTAAAAAGCAATAACAACTTAT
4018312
4018313
TTTAAATACATTTAATGTAGAAGTTAAA
CAAAAATAAAAAGTGAAGGTTTTTAATAAAACTTTTG
4018377
4018378
TTTAAATACATTTAATGTAGAAGTTAAA
CATTTATAAAATACCAAAGTCAGAGGTAAAATTATAG
4018442
4018443
TTTAAATACATCTAATATAAAAGTTAAA
CTTATATTTATGCATTTGTAAAACCTCCGTTCGTTTG
4018507
4018508
TTTAAATATATCCAATGCAGAAGTTAAA
CTAAAAACCTCCTGTGTGCCCCTTTG
4018561
4018562
TTTAAATACATATAATGTAGAAATTAAA
CAAATAATAGTACATAGTTGTAC
4018612
4018613
TTTAAATACATCCAATGTAGAGGTTAAA
CTAGTTATTCTTTTTGTTTTTTACACACGCTA
4018672
4018673
TTTAAATACATTTAATGTAAAAGTTAAG
CCTTATTAACAATAAGAAATTAGGAGGTTCCTTGCTAG
4018738
4018739
TATAAATATATCTAATATAGAAGTTAAA
CTAATAAAAATTAGGACAATAAACGTTTGCGGAGTTTAG
4018805
4018806
TTTAAATACATATAATATATAAGTTAAG
CTATTTTCCCTTTCATTAATTAAATAAAATAGGTC
4018868
4018869
ATTAAATACATCCAATGTAGAAGTTAAA
CTAAAAAAGTAATAATAAATTAT
4018919
4018920
TTTAAATACATATAATGTACAAGTTAAA
CCACCTTATTCCATTAGCGATATTCCAAATATGTGTTG
4018985
4018986
TTTAAATACATCTAATGTAAAAGTTAAA
4019013
Left flanking sequence : Till position 4017733 (length
bp)
ATATAAATCAGGTAAAATGCTAACATAGCAAGCTCTATCTATGCTTTTTTTCATAATTTTTGCACCTTCT
CTTTCTCTCCTTATATTTACACTTATACTT
Right flanking sequence : From position 4019014 (length
bp)
GTTTTATTTTTTTATAAATCTGCTATTTCTACTGCAAAAATAAATCCATGTGAATCTCTAACTATATGAG
TAAAAGATAAATTTCCCTTAATCTCCATAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp