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CRISPRs details
NZ_CP013355_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP013355_3                                                                                                                 
top
Strain :
Lutibacter sp. LP1 GCF_001543325
RefSeq :
NZ_CP013355 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP013355_3
DR consensus (37 bp) :
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
Number of repetitions :
20
Begin Position :
844238
End Position :
845522
844238
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
TATAATTTAAATAATTCTTTTGTAATAT
844302
844303
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACT
CATATAGTCCTTCGCATAAAGTTTCTGCT
844368
844369
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
TTAAGCCAATCGCATATTGTTTTTGGTT
844433
844434
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
TTGTTCTAATAATGACTTAGTTAGTTTAA
844499
844500
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
AGATTACCCTAGTTATGTAGGTGCTAGAA
844565
844566
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACT
AATTGCTGAATATCTTTTTTACTCGCTA
844630
844631
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
CTGCTGTGGTGTAGCAGCAATAACAGGAT
844696
844697
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
CGTAAATAATCTATTTCTTTTTTTGCAAA
844762
844763
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
ACTGTAATATTTACGGTTATGTTACCTAA
844828
844829
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACG
AACTCTTTAAACTCTTTAAGAAATTTTTT
844894
844895
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
GTTTGAAAACATTACTACAACATCCGAT
844959
844960
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
AATTGATATAACAACAGGAAAAACAAAAT
845025
845026
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACT
TGATAAACGAGGGTAGTCTTTAACCATAT
845091
845092
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACT
TATGCTTGAGTCTTTACGAGCCACCAAGG
845157
845158
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
CGATGGAATAGGGGCTATTCATTTACAAG
845223
845224
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
TTTACCTCTATATATCCTTCACTTTTTG
845288
845289
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
ATCTCATCTTTCCATTTTTCTAAAGTTT
845353
845354
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
TTAGCATCCTTAATTACTACACAACCTGA
845419
845420
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
TAGGCTGCCCATATTGCCGTTGCGAAATC
845485
845486
AATATCGTTTTCTCTAATCTTTAATCAAACCACAACA
845522
Left flanking sequence : Till position 844238 (length
bp)
AAAAATGCTCCAATATTGCCTTAAAAGTACAATAAAGGAGCATTTTAAATTACGATATTTTCAATTAATC
TTTTGAGTACCAGAAGCTAACAGCGCAACT
Right flanking sequence : From position 845522 (length
bp)
AAACCTCGCTTTGCTCGGTTTTGTTATAGATTAATTATTTAAAAGAGTTTTAATTTGTCATTCCGACAAA
GGAGGAATCCCATTAAAACTTAGCATTATG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp