Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP013476_2                                                                                                                 top


Strain : Turicibacter sp. H121 GCF_001543345 RefSeq :NZ_CP013476 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP013476_2
DR consensus (36 bp) : GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACNumber of repetitions :20
Begin Position : 1349788 End Position : 1351075

1349788GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACTTATTTGAATAATCTAAGTTAGTCGGATTT1349853
1349854GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACCGTAGTGATCGACGGCGTGAAATATGAGAG1349919
1349920GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACAACATATTCGTTGTTAATTGGTCACCATTG1349985
1349986GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACTTATCTAAATAATAAGTGTATGACTGACCG1350051
1350052GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACTGTTCCATATGAAACAATTGAGGAAACACA1350117
1350118GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACTCGCTTTAGACTCATTCGATGCAGAACGC1350182
1350183GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACTAGCTTAGAGTTGATCGCGTCAGCGGTAT1350247
1350248GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACGAGAGTTTAAAATCCCTGGCAAGGCACAAG1350313
1350314GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACATAACTCTTAAAGGGGGAACGGATGTGGCA1350379
1350380GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACTAAACGCTTAAACATCTCCGTATCAACCAA1350445
1350446GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACGTGACGATCTACTCATGACGCTATCAGCAT1350511
1350512GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACAGGTCCATCACAATCGCCATCAACATCAAC1350577
1350578GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACAAAAAGTCCTCCTGGTGCTGTTATTTAGTA1350643
1350644GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACGTTCTTGATCGAATAAATGATGATTCGATA1350709
1350710GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACCGCTATACTATCCCCCTCACCGACACACTC1350775
1350776GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACTGACTTTTGAGTTAGTACCATCAGCGGTAT1350841
1350842GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACCTTTTTTATTTGATAAGGCTAAGAATGGGG1350907
1350908GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACCCATTATCTCGGACAGTTTGCCGCATTAGA1350973
1350974GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTAGCTACTGTAAAACCTTACATCAGTGGATGGTCGTATGCACTTC1351039
1351040GTTTTAGTACCCTTAAGATTTTATTGATTGTTAGTA1351075
Left flanking sequence : Till position 1349788 (length bp)
ATCAAGACTTGAATGGAATTTTTTAGAAGAAAAACTTTATAAATTATAAGTACTCAGTTATACTTTAATT
AAGTATTAAAATCTTAAATCATCATTTGAG
Right flanking sequence : From position 1351075 (length bp)
GAATATTAATAGTTTTACTTATCCACAATTTTATATTTTATAACAATTAGTTAACGGGTTACCTTTTTTG
GTAGCCCTTTTATTTTGAATGGTGTTATGA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp