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CRISPRs details
NZ_CP013992_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP013992_2                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium columnare GCF_001534645
RefSeq :
NZ_CP013992 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP013992_2
DR consensus (36 bp) :
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
Number of repetitions :
35
Begin Position :
320994
End Position :
323320
320994
GATTATAATTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TATAAAAGTTTAGTGTTTGTTTAGTGCAA
321058
321059
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CTATCCTACCTATTGGACGGCGGTACTCAT
321124
321125
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CCGTTTCAAAACATTAGTCATCGTAAGTTGGTTTACAAACACCAAGTTAATATTTATTATAGGTGTGTTTGTGAATCTCCCTC
321243
321244
TGGTCGATTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CCTTCGAACAAAAAGGAAAGTCAGGTAAGT
321309
321310
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
GCTTTGAATTTGGTTTAAAGGGTATGCCTG
321375
321376
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
ATTGAAAGCTGAACTGGATGGTGAATTTAT
321441
321442
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
ACTAAAACCTTGTACCACATTGCTCATAAT
321507
321508
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CGAGAAAAGGGATGCTTACCTGTTGTGGTT
321573
321574
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
GATTGAGCTATGAGTAGTTGCGATATATTA
321639
321640
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CTGTTTAAATCAAACGGTTCCTGTTTATAA
321705
321706
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
AGTCAAGTTGGTGTTAAGTTTGACATTGAA
321771
321772
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
AAACACTTGGTTATAATGGTGGGGTTAGA
321836
321837
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TTTGTTTGTCCAAACATTTGGCTTAATGCA
321902
321903
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CGACTTTCTTCTTTCGCTCCATCTTCTTC
321967
321968
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
AATGTAAAGATTATCTAAAAAAACTTATAC
322033
322034
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
AAGTATGTGAATTCACCGCAAACGGCTTTG
322099
322100
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TTTTGAGCCAATATTAATAACAGAAGAATG
322165
322166
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
GACGACCTTGTTTATTATGTTAGCAAACAT
322231
322232
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CACAGCCAGCACATTATAAACAGGACTTTT
322297
322298
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
ATGGTTATAAACATGATGTTGAAGAGGCG
322362
322363
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
ATTCATCGTTTCCACAATTTGGGCATGTTA
322428
322429
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
AAAAATAATTTCACAATCTCAGGGAATGG
322493
322494
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
GATAAAGGAGGAATTATAATACCACCACAT
322559
322560
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CATTAGAAAGTATGATAGTTAAGGATTATG
322625
322626
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CTAATATTAGTAATGATACTAAAATGGATC
322691
322692
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TGGTTCGAGTGATTGGATAAAAACAAGTAA
322757
322758
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
ATTTTGTTTTGAAGTTGTTGTTTAGTTCG
322822
322823
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CCCAATACCTCACAAACTAATACTACGTTA
322888
322889
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
ACCAGGTTTGTTATTCAATAGCGAAATTGA
322954
322955
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
AACTGTAATCACGAACCATTACGCCATTAT
323020
323021
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TTCTATCCATGCGTCTTTTGTTGCATCCGT
323086
323087
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TAACGGGCGTTTCGAAGTTCAAAACGATAA
323152
323153
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TATGCAGAGGTGTTCATTAGACAAAAGTGG
323218
323219
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
AATTGATAAGTTTGCGAGTAGCAATCAAAG
323284
323285
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
323320
Left flanking sequence : Till position 320994 (length
bp)
CTCAAACCATATAGACTTTCACTCTTTGTTGGTGATTTTAAAAGTTTGAGAATAATTTCATTTAAAAACA
CAAGTTTATATTTGTCATTGGTGTGTTTGT
Right flanking sequence : From position 323320 (length
bp)
AGTTGATGTTTTATCTTCTAATTATCAAATGGTTAAGTTTTGATATCGTTAAAAAAAATGCTTCTTTTTT
GGGGTGCTATGCCAAAATTGAAGCATTTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp