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CRISPRs details
NZ_CP014672_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP014672_2                                                                                                                 
top
Strain :
[Clostridium] stercorarium subsp. thermolacticum DSM 2910 GCF_001697245
RefSeq :
NZ_CP014672 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP014672_2
DR consensus (30 bp) :
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
Number of repetitions :
18
Begin Position :
781568
End Position :
782700
781568
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
GATTGTTTGCCCTCTGTCATTTGCTGAAATATCG
781631
781632
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
TCACCATCGCCTTTACTATACAAGTGTGTTCCTC
781695
781696
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATTTCGGTGATGCACCCCACGAGCATAAAATGCTCG
781761
781762
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
GTTAGGTTTCTTTTTAGATTCTATGATACCTTTTA
781826
781827
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
TCAAAAATCTATATCACTTTTTACTATATCCCTTGT
781892
781893
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATCGATAATGTCAATTCTACCTAAAGGGTAATAATC
781958
781959
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
GTGTTTTTTAATATATTAAGTAATGTTTTATCATTT
782024
782025
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
GCAGTAGTCCGTATGCTGGTAACATCCGGCCTCTC
782089
782090
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
CATAAATAATTATTTAGAGGCGCCTCCTGAAAGGC
782154
782155
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTACATGTTGCTCATACAGTGGAACAGGTACCGTAA
782220
782221
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
CTTTAGCGTCAAACATTACATATATCCCTCTAC
782283
782284
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
CGAACACCAGGACCACAGCAAAGCGGTGCGTGATG
782348
782349
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCTCGACATTGGATATAGGCCCAAATTCACAAGA
782412
782413
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCTTCTGAAAGGATAATAAAAATAGCCGTCGCAA
782476
782477
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
CGACAGAGTTCTTCTTATTAAAATCTCGGGAACT
782540
782541
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATGATCGTTGTGGAAAACGAATACTTCGTTTCCAC
782605
782606
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTATTAAAAGCGTTTAATGCACCGTCTATTGTTA
782669
782670
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
782699
Left flanking sequence : Till position 781568 (length
bp)
GATGTAAAAATCGAGCAATATCAGCTATTTGCGGATTTTAATACTTAAAAACATGAAAGTTATGATTTTA
TAAAAGCGGCTTTTTACGAGGGTTTTACGG
Right flanking sequence : From position 782700 (length
bp)
ATTTTCATTGTGGGAAACCTTCACATCGAAGGTATTTCATACAATTTATATTGAAAAGGATAAAACTAAT
GGTATAATTTAAATAAACGTTTTGTCTGTC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp