Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP014771_1                                                                                                                 top


Strain : Hymenobacter sp. PAMC 26554 GCF_001596155 RefSeq :NZ_CP014771 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP014771_1
DR consensus (29 bp) : ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCNumber of repetitions :134
Begin Position : 789869 End Position : 798571

789869TTTTCTACTTCACAAGGTCTGATTGAAGCTGGCTTAGTTTACTCTCAGCTACCTGGGAAGAAGACAA789935
789936ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTAAGTCTTCAAAGGTTACCCGCGCCCGGCATAGCTT790000
790001ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTGGCACACCGCGCCCGACGCCCTACCCGCGCCCACGT790066
790067ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTTGCGCTAAGAGTGAGGGGATAGCCGAATGCCTTCA790131
790132ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGTGCGGTAGGGCGCGGTGCTGCGCCTGGCTTAGGT790196
790197ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCTGGACCTGGTACTTCACCAACCCGCACCCCCCCA790261
790262ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCACCGTGACAAGCACGCAGGCACTACGCATTAGCAA790326
790327ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTACAGCAGCAAATCGGGCCGAATCTTCACCGTCAGGC790392
790393ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCGGCGGCAGCCTCAGCGGCCCTAAAGCGGGCCGCAA790458
790459ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAAGTTCAGATGGCCATTGAGTGGTGCCGCGTGAAC790522
790523ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCTGAAATCAACCAGCGTTACGAATGCAACCGCAAT790587
790588ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGACCGCCGAAGGCCAGGCGGCGCGTCGCCTCGGAC790652
790653ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCACGAAAGCCCTGCACGCCGAAATCAGCGAGTTGAAC790717
790718ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTACTGAGCAGCTTTGCCCTGCTGCTGGGCCTGCTGGC790783
790784ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCTGCTCCTGCGCGTACTTGGCCTGCGTCGTAGCAG790848
790849ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTTCTTCGCTGACTTTAACAGCAGCTCAACTTCCTCA790913
790914ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGTGGCCGCCGCGGGCCTGGTGCTGGTGGTCTGGGA790977
790978ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCCTGGGTGGGTTAGTCTGCTTGGCTGTAGAAGTCGC791043
791044ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTAGGTGGGCCAGGCAGCGCCCACCGGCAGGCGGAACAC791110
791111ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGTGGCCAGGCGCGCCGAAGGGACCCCTCTGGGGCAA791175
791176ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCTGGCCGCCGCCGTGCGCCGCCGCCGCTACTGC791237
791238ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCGGAACCAGGGGGGTAGGGTTTCAGGCGGCGCGAA791302
791303ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGTGGCCAGGCGCGCCGAAGGGACCCCTCTGGGGCAA791368
791369ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCAGCCGCACACGAGGGCGCAGGCTTTCCAGTAGCCG791433
791434ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGGGTTGCCGGGCAACACACATCTGGCCCTGGTGAA791498
791499ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCAGGCCCTAGCCAAACAGGCCGCCGAAATTTTCAA791563
791564ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCACTACTAGTGCCGCCAACCGCGTTAGTTACCGAAA791628
791629ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGCGGGGGCGGCGAGTTGCTTCGTGGCGCGCTGCTC791693
791694ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTGCTTTTTGCTGGACTTGTCGGGTGCCATTTTACCG791758
791759ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTCTGGCCCAGCCTTCCCGGTAGGCGGCGCGCGTGGT791823
791824ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTCCGGCTCCCGCAGTACCGACAGGGGAGCCCGCGTT791888
791889ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGGTTGCCAGGCAAGACGCACCGCGCGCGGGTGAAT791953
791954ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCATTGCTCCACCACCAGCACCGTTACCCGCAGATTCT792018
792019ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTAATTCCCGCAGATATCGGCCACGTCCTCATTGGTCA792084
792085ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTGCGGTGCTTGGCCACGTCGAAGAGCACCGTGTCGC792149
792150ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGTTTCCATATCGTGGCAACGCCGGTGAAGGTGGTG792214
792215ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTCCCCGTCCCCGTGGCCGTCAGCAAGTAACTCGCC792278
792279ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCGCACCGCCTACCTGTTTCCCAGCAAGACCAAGCCG792344
792345ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGAGGCCAGCGGGTGAGCGGCTATGCCGGTCGGTCGTC792410
792411ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGAGCCACTTGGCGATGGGGTAGAAGAGCTTGCCGAC792476
792477ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCAGATGCACCTCCCCGGCGGCCCGGACCACGACTT792540
792541ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGATTTCGGCCCAGGTGTAGGGCGGCGCGGTAGGATA792605
792606ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCGGCTTTCGCGGTAAAAAGGATACACGAAGGTATC792670
792671ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGTGCCCTTCCTGCTGAGCGGCCACGGCGCAAAACA792735
792736ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCATTTTACGGAGCGGTGGACACCAAGAATATAGCCCCA792801
792802ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCTGCTGGCCTGTGTACAGATACGCGGTGAAGTAAGCC792868
792869ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGAGCTAATTGAAAAAAAGGTCAGTGTGTTAATCACC792933
792934ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCACCAGCTCGTGGGCCAGGTCGTTGTACACTTCGACC792998
792999ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGAGGTCCGTAGGCGGCCCGTGTGCTTGAACTTGCGC793063
793064ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGACTGCCGACCGGGCCGAGTACGTGGATATTCAGAA793128
793129ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTACCGCAAGCACGAGCTGGCCCCCTTGGACTTCTACC793194
793195ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGATATTCTCTACACGAATAACGATATCATCACCTGT793259
793260ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCAGCGGGTGGGCCTGCTGGCCCCCGGCGTGTACCG793323
793324ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCCGCCAGCAGTTCGCCCAGGATTTCGACTTGTACC793388
793389ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTCCGGGCGAAATCCTGGAGGTGCGGCTCCTCTACCA793453
793454ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTAAATCGCCGCCGCGAGCGAAATACGTTAGTAGGAA793518
793519ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTGCTGTACCAGGTCCAGCCCAAGGCCTTCATTACGC793583
793584ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGTTTTGCATGGCCTTCAGGGCTGCCGCGGCCTGCT793648
793649ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGTAGCTGGCGCGGTAGTGGGGTCGGTGGCAGTGGT793713
793714ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCCGTCGTCCGCGAAATAATAGGCGGGCTTGCCGAA793778
793779ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTTTGGCCAACAACCCAATCGGCCCAGTCGGCTCCG793842
793843ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCTGGTGCGCGCAGTCGCGCAGTAGGTACTGCTGCTC793908
793909ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCGGCCACGTCTTGGCTGCTAATCCAGGTGCGCAGGT793974
793975ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGCCAACGGCGGCTTTAAGGCGGCGGCCGACCAGCT794039
794040ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGGGTCGCTGCTGTGAAAGAGGTAGAGCCGGAAGTC794104
794105ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCTCCTGCCCCACCGCGGGTATCGGTTCGGCCTAAAG794170
794171ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCGATGGCGGTGGAGCACCGGCGCGGCGTTGGGGTC794235
794236ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTTCTCTACTCCAGCCCTGGGCCACGCTCGTGATGCT794300
794301ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGCGTACCACTTGGTCCACGGTGGTGGCCAGCAGCTT794366
794367ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCACGAGCAGGGGCAACAGATTGGTGGCGGCAGTTTC794431
794432ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCGGGCGAAATCCTGGAGGTGCGGCTCCTCTACCA794495
794496ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTCGTGGCCGGCGTCGGCGGCTATATCTGCGTGCAGG794560
794561ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTGAGAATCTTTTCGCTCAGGCCACTCTTGATTTTCC794625
794626ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTCTGGAGCTGATTAACTCCTGGGGGCCCTCGTTTTC794690
794691ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTAGGAGCAACTGCTTATCCTGAACCCGGATGATTTTC794756
794757ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGTTGGTTTGGGGGTTGCCATAAGTGGGCGGTGGTT794821
794822ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGGTAGCTGCTTTGCTGGCCACGTAGGCGCTGAAAT794886
794887ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTACGACGAGCTGAAGCGCCACAAAATCACGCTCGACC794952
794953ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCAAATTACGAGCGGCACCTTTACGATGGACCCGACC795017
795018ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCCATTACGACCAGCGTAGCCGGCGGTACCGTCCTGGT795084
795085ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGAGACGTCCGGAGCGGTTAGCTGCTGGCCCTTCGCT795149
795150ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCGTGAGCCGGGTGATGATGATGTTGGAGCCCAGCAG795215
795216ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGGTCGAACCCCGCCTGGACCCCGGCCCAGGCCCACC795281
795282ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCAGCGTGGCCGCGCCGTAGAAGATGACTTCCACCA795346
795347ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAGTCCTGCACGATGGTCACCGGGCCGCGCTGCACGA795411
795412ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCATAGTGCTTGGCGGCCAGCGCGGCTACTTGTGCGTA795477
795478ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCCATTGTTGTCTTGGTCCATAGAGGAATCGTCTGA795542
795543ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAAAATATACCTGTCCTGCCTGTTCTGCTAATGTCTG795607
795608ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAAAATCTCCCTACGGCGAATCTGTGCCGTGCCTAGT795672
795673ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAGGGATGAGTACGAGGCTCGGTTTATTTACTTGTCT795737
795738ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCTTCAATGGCCCTTAGGCGGGTGGCATAGAGCTTA795802
795803ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCAACAAAACCAAGTCGGTGATTGAGGATGCTACGGC795868
795869ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGCCACCGTGAGACTGGTAACGGCCCCTTGCTCCTG795933
795934ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTCTGTGGCTGGAGGCAATGGGTCTGCTCAATGATGCT795999
796000ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAACCCAGTGGCGTAGCGAGGTGAGGGTAGGTAGCTA796064
796065ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGCAAGAATGAGCGCGGCCACAACACCGTCGAAAA796128
796129ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCTCGGCGGATTGCGGGGATTGGGGTAGGGGATACAT796194
796195ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGGGTCGCCCGTGCCGTTGCCGGTTATCTCAATGGT796259
796260ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGAATTACAAAAGTCTCGCGGCGCAACCTACAATATT796324
796325ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGCGAGGCCAGCAACGTTTTCACCAACAATCCAACG796389
796390ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGTGAAACGCTCCTCTTCGTCCATTGCGCTCCAACCA796455
796456ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAAAAAATGCTTATTACTGTATTTCAGCAACTTAGAA796520
796521ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTTAAGACGCCAAGGACGCGAGGAAGTGTTCACGCGAC796586
796587ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGGGTCGTCTCAATTGCGCAACTGGTTGGCCTGCGCT796652
796653ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTAGTCGTGTGTCGGGTTGCCCCCCGTCCAGTAATACG796718
796719ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCCTACGTTGCGCACGTGCGCTGTGGTTACCTCGTCGT796784
796785ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGCGGTGCTGGTTCCATTTTACGAGAAGGTAACCCT796849
796850ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAACAACATGGCAAATTTCTCGAATTATGGCCCTTCG796914
796915ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCAAGACCAGTAATTTCTACGACCCCACGCAGCCCGAA796980
796981ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCAATTGCAACAGGTGGAAGCCTTTCAAGCCCTGT797044
797045ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAGCATAGCTGCGCCCAAAAGTCGGCCAGCGTCAACT797109
797110ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCCGGGTTGCCAGTATAGCAGTAGGGGCCAACACT797173
797174ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCCATCAGCAACAGCGTTGCAAGAAGCATACTGAGCGG797240
797241ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAACAAGCTGCGCCTCACCGACATGCTGGCCTTCGTG797305
797306ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGCCGCCCCTCGGCGCTACTGATTCGACCACTACGCT797371
797372ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGGCGGCGTGGGCTTCGGGGTTGAGAGGTTCCATAT797436
797437ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCGTTGGAGTGACTCCTGTGCAACATTTTTTAGCCT797501
797502ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGACGCCGACCCTGGCCAGCGCGGTGATGCCTTTGAT797566
797567ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTCTGGAGGCGGTGCAGATTGTCCACCCAGCGCTCCA797631
797632ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCTCCAGCACCGTGCGCAGGTAGAGCATCGGCACCAC797696
797697ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGCGCGAAACGGGCACCATCGCCGGGCTGGCGTAGTC797761
797762ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCTGGCACCGTAATAATCCACTGCTTCGGCGCTGGCCA797827
797828ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCAAGTATTCCCTTGGTGCCGACCGCTTTGCCACGAT797892
797893ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGTAGCCCGTTAGCACCGCTTCGCGCAGCGCCTGCGA797958
797959ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGCGTGGGCGCCAGGCTCACGAGGGGGCTGAATGCC798023
798024ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTCGTTGAGGCCCGTAAAGAGTCGCGCTAGCACGGTG798088
798089ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCGGCAATGGTACCCTGCTTGGCCTTCTCCGCTTCCT798153
798154ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCCAGGCTCTTGGCCTGCGCCAAGGTATCGAGTGTCAT798218
798219ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCAGCGCCTGCTGGCTGGCCTGGTCCGTGCGGTTCTT798282
798283ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGGGGTAGGACTCATGGGCGACGAACGGGTTTGCGCT798347
798348ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCACCGCGTCGTCGATGGTCTGGGTATCGAGGTGCAGC798412
798413ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCTTGCCGAACTCGATGGCCTTGAAAATTAGCTCCAGC798477
798478ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGCGTAAGCCTGCTCGTGGTGGCTACCATGATATGCCGT798542
798543ATTTCAATTCCACCTGGTCCGATTGAAGC798571
Left flanking sequence : Till position 789869 (length bp)
GGCCCTGGGCCGCGCCGAGGCGCTGGTGGCCGCCGGCGTATAAAACGGGGGTATGAATGTTTTCTTCTGA
AAAAGCGCGCTGGCGATAAGCCGGCGCGCT
Right flanking sequence : From position 798571 (length bp)
CCGCCAAATTCAGCGCAATTATACGCGCTAGCGCTTGGGAAACGCTTGTTTTAGGTCCTCAAAAAACTTC
GTAAGTCGTCGGTGGCAGATAGTAAGATTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp