CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP015107_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP015107_1                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium columnare GCF_001641185
RefSeq :
NZ_CP015107 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP015107_1
DR consensus (36 bp) :
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
Number of repetitions :
23
Begin Position :
944817
End Position :
946354
944817
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AATACTTTATACAATCAATTAAAAAGCGAT
944882
944883
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AAACTACCCGACATTATAAATTTAATGATA
944948
944949
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACTTTTGCCTTTTCAAATCTATAATATTG
945013
945014
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TTTATGATTTTCCACCCCTCCTCTGTTTTT
945079
945080
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GAGCCGAGTGTATCGCAAAAAATGGTTTAC
945145
945146
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AAAAACGAACCGACTAAAACCACAGCTGAG
945211
945212
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TACCGTTACCGTAATGTGCTTTGCGCTGGA
945277
945278
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TTTTACATTTATTACATTAACGATAAGCGA
945343
945344
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACATTACCTTTGTAAGCTACTTTATGTTCA
945409
945410
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TTGCCTCTTATATAGAGAAAAATAACTTGA
945475
945476
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TCTTAATAATAAATAGGAACAGGTCATACT
945541
945542
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
CGCACCAGCATCAAAAAATTTTGATTATG
945606
945607
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TTCCGACATCTTCTTTATTTGGCGCTCCTT
945672
945673
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GCTAATCTATTAAGAAACCCATCCATTAAA
945738
945739
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GGTACAAGCGGTCGTTTATTTCTTCTTTGG
945804
945805
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
AGGTTAAAAAAAATAATTTAGTAAAAGTTT
945870
945871
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
ACGTAATCCTATTGATAGCGTGGCTTTTAC
945936
945937
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
GATAATGAGACTAATTATGGAAGCGGTTTT
946002
946003
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TTCAAATGGATTAACTCGTTTAACAGAATT
946068
946069
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TCAAAATGCAATTTTATTGAATGTTGACA
946133
946134
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAACCACAAC
TCATTTGAATTTGAAAAAATGGGCATTTGA
946199
946200
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAAATCGACCA
GAGGGAGATTCACAAACACACCTATAATAAATATTAACTTGGTGTTTGTAAACCAACTTACGATGACTAATGTTTTGAAACGG
946318
946319
AATATCGTGTTTTCTAATCTTTAATCAATTATAATC
946354
Left flanking sequence : Till position 944817 (length
bp)
AAAAATGCTTCAATTTTGGCATAGCACCCCAAAAAAGAAGCATTTTTTTTAACGATATCAAAACTTAACC
ATTTGATAATTAGAAGATAAAACATCAACT
Right flanking sequence : From position 946354 (length
bp)
ACAAACACACCTATAACAAATATTGACTTGGTGTTTGTAAACCACAACCAGTTCGTGCGATTGTTTCAGG
GAATAAGTAATTTCGTGTTTTGACTTCGCC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp