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CRISPRs details
NZ_CP015403_3
Flanking alignement tool
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NZ_CP015403_3                                                                                                                 
top
Strain :
Burkholderiales bacterium YL45 GCF_001688905
RefSeq :
NZ_CP015403 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP015403_3
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
Number of repetitions :
51
Begin Position :
1144997
End Position :
1148657
1144997
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTTTTCCACTCAGAAGCTGCTGAATAAGACTTCA
1145067
1145068
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTAAAGCCGGTAAAAGAGTCGATTGAGATGGTTAC
1145139
1145140
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTCTTACCGGGATCCTAAGCAAAAGTCAGCGGATTCGGC
1145215
1145216
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTCTTACCGGGATCCTAAGCAAAAGTCAGCGGATTCGGC
1145291
1145292
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTCTACTAATTTTCTTGTTGCACGAGGCCACTTTC
1145363
1145364
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTAAGGATTGCTTGTTCACCTAAGTGAGCAAGGGA
1145435
1145436
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TCCTCTTTAAATTCACAGAAGGAATCATCGAAAAG
1145507
1145508
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
CTTGACGAAGGTCATTAATCGTAATTGCATTGACAC
1145580
1145581
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TATGAATTTTTCTTCCGGTTCTGTTTACGACTATTT
1145653
1145654
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TAGAAATGATCTACAAGACCGGGAACACCATAGAC
1145725
1145726
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TAACAGCCGTTTGGTCCAACCGATTAAAAACTGAATATT
1145801
1145802
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
CAAGAGGCGTCCCAACCACAAATCCACCAGAGTAGC
1145874
1145875
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GATGAGAATCTTCAAAATTCTGTAAATGTTCCGAC
1145946
1145947
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
CGTAAAATTCGTTACTTTGCTTGCGGTGAGTA
1146015
1146016
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TGAATGAATCACCGGGAAGGACTTCGTCAACGTAAAA
1146089
1146090
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
CGCGTGGTATTCCTACTCTAAGAAGACTAGTAA
1146159
1146160
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
CGCGATGATTCGCTGTATTCATGAGTCAAAAATG
1146230
1146231
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TGATTACATTAGTCGGATTCCTCGTGCACAATATGG
1146303
1146304
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TCATACCAGGCTGATTAAGCACAGTAGATCCAATAC
1146376
1146377
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TACTTCTTTTGCCAACGGCACTGTTTTTGACTACTT
1146449
1146450
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TCCTGACCCTGTTTCGAATTTCAATCTTTTGAAGCG
1146522
1146523
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTTAACAAGTCCTTTGTGGAACATGGTTATATTAT
1146594
1146595
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TGCAAGTGTGCTCGTCCTATGCCGGTTTACGGTGTAC
1146668
1146669
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GCACTGACCGCACGGAATTTGAAAATGCGTATA
1146738
1146739
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GAGGTACTCGCTACACAGAAATTCTCCGGTCTCATTT
1146812
1146813
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GCCTGACGCTCGTTTGCAACGGCCGGAGTACTTGGG
1146885
1146886
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTGCTAATTTAGGCTCTTCGCTTCTGTCTGACGCTAC
1146959
1146960
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GGCGCCACCAACACCGCCGGATAAAAAACTACCAA
1147031
1147032
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
ATACACTGACCGCAAGGAATTTGAAAGTGCGTGTA
1147103
1147104
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
AAAGAAGAAAGTTTCTAAGTAGACGTTATCCATGAA
1147176
1147177
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTTCCAATCATCCTTCCGATTTTAGTCTTGTCTGGAT
1147250
1147251
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GACGTAAAATTCGTTATTTCGCTTGTGGCGAGTA
1147321
1147322
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
CTCGACCCCCCAACCTACTGATGTCGGTAATAAG
1147392
1147393
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTCCAGATTCAGAAGTTACTAGAGCGTGATGCCCG
1147464
1147465
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTCGATGATGCTACTCGTTCTTTTCAAGGCATCTATTT
1147539
1147540
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GACGTAAAATTCGTTATTATGCTTGTGGCGAGTA
1147610
1147611
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GCTATTTTTGATTCTGTAGCTAATGAGTACAATCCTC
1147684
1147685
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GCAATCAACCTACGTTATTTAGGTATTTTAATTC
1147755
1147756
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GATAAGATTTTCGTTAAATACGGAAACCGCCTCTCA
1147828
1147829
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TAAGAATAGCTTGTTCGCCTAAGTGCGCCAGAGA
1147899
1147900
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTGACTGCAAGTGTGCTCGAGCTATGCCTGTTTA
1147970
1147971
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
CGACACCGGATACATTAGCAAATCCGGCCCTTACAC
1148043
1148044
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GCGGTTGAATGTCTCTTCGCCGTTAATCTTTGTTAA
1148116
1148117
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TGAAATTTGAAACAGGGTCAGGACCGTCACCCAT
1148187
1148188
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTGGCAGCTTATGGTCTTGCTTCTGATGTCCGTCG
1148259
1148260
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
CCAAGAAAGACAAGACTAAAATCCATAGGATGAT
1148330
1148331
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
ACAACAAACGTCTAATACGAACGATGTTTCCCCGCA
1148403
1148404
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
GACGCAACTTACTCAACAGTTGCTCAATCGTGCTC
1148475
1148476
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TCAATCGTGCGATGTTAGAGACGCAACTTACTCAAC
1148548
1148549
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
TTCAACAAATCTTTTGTTGAGCATGGCTATATCAT
1148620
1148621
GTTTCAGTTGAAGGATGTAAGTTTGTACAATTGAAAC
1148657
Left flanking sequence : Till position 1144997 (length
bp)
TGCCAGCGCTTTGGGGCCTATAAACCTTCGTCATAAAGTTTTCAGTTCAAGTATGTTGTACTTTTGCTAC
TTGCGTCTCGAGTTTCTCCAAAGGAGAAAG
Right flanking sequence : From position 1148657 (length
bp)
CCTCAGCTAATGCTATGAAATTTATAAATTTTATTTTGTGTTAGCTGAGGATTTCTTCGAAACAGTTCAA
ACTGCACGAAAAGTGCCATAATTTTCGAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp