Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP016086_4                                                                                                                 top


Strain : Clostridium saccharobutylicum GCF_002003285 RefSeq :NZ_CP016086 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP016086_4
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCNumber of repetitions :33
Begin Position : 2817546 End Position : 2819664

2817546ATTTAAATACATGTCATGTTAATGTTAATCCTACACTTACTCTGTAGCTACCCCATGGCTTACT2817609
2817610ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATTTCTTCCTTTTCTGTTTGCTATATTGGCTAATTT2817675
2817676ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACTTTGAGCCAGTTATAGATAAGCTTATTAAATA2817739
2817740ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGATGAATAATGAAAGGTATAGATATTTCAAATAA2817805
2817806ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAGGTTAAAGTTATTACCAAAGAGTGTAATTACTGC2817870
2817871ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTAAACCGCCTTTTGGATACATAGGTATCTTATGGTT2817937
2817938ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTGATTTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTATACAA2818001
2818002ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACATAGTTACTTGGGCTTAAGTTATCTATTGTAGAT2818067
2818068ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCCAGCTAATGCTAGTGTATTACAAATAGATGGAA2818132
2818133ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTATTCTTTTTGCTCGTACTAAACTATTATCTACA2818198
2818199ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAGATGGATTTACTCAACTTGGATTCGATGCAAA2818263
2818264ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAAGTATTTAAAATAGAGAGGTGATAAATGATGAG2818328
2818329ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAACTATATTAATTTCATCATCTTTTAAATCAATGTA2818394
2818395ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCGAAAACTGATAATCCAAGTGACCCTGCTCCTTC2818458
2818459ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCTTGTGCAACAGACTTAAACTTAACATTATCAGAA2818523
2818524ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCCAACAGTTAATTTTTCCATCTTGACCTTTTATAT2818588
2818589ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGGTAGGCATATTTAAGTAGATTTTAAGAAGCTTT2818654
2818655ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTTACTGATACAAACACTAAAACTGATACTAAAAC2818720
2818721ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAATGGTGGTAAATTCTACATGGTAATTCCTAA2818784
2818785ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATTCCGGAAATGTTGATATTTATTTAAAATTAGC2818849
2818850ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGCAAATTTAATTTAAGGAGGAAATTATTATTATGTT2818915
2818916ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACTCATGTTACTATATGTTATACAAAAAGTGGTAG2818980
2818981ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTAGTAAAAGTGAGGTTGAACATATGATAAAACATA2819045
2819046ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTATGGTTGCTCTGTTAGTGGATTTTCTTTTTCTGT2819111
2819112ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATTTAGAAATAGATAAAACTCAAGAGAATAGAAT2819175
2819176ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGACTCACTTTTGTAAGGTCAGGTAATTCAGTTCGT2819240
2819241ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCATAAAGAAAATAAGAATCGCAAATATTAAAATATC2819307
2819308ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACGTAACTATTATTAGAATGAAACGTATTTATACT2819372
2819373ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGGTTAATCCTAAATCAATTGCCCATTGTTCCATCAA2819438
2819439ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTGACTTGGGTAAAGAACATCAGACTTTAGTTGTTAT2819504
2819505ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATCAATCAAATCCTCTTAGTGCATATTTCATCA2819568
2819569ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTCAAGGTATTCTGATTTTACATTTAGTCAGTTGAG2819634
2819635ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC2819664
Left flanking sequence : Till position 2817546 (length bp)
TCTGATTTTTATGCTAAAAACAATATGTCTTTTACAATTGGTTTCATCATAGTTAATGTTAGTCTTTAAA
TTATACAAAGCACAAGTATGTTTTAGATAA
Right flanking sequence : From position 2819664 (length bp)
CCCTAAGAAAAAAGCCACTTCTTATATTAAGATAATGCTTTCATTATAGTTAGTGTAACACATCCTTAAA
AATTTACCAAGCACCCTCAACTTAAATTAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp