Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP016087_7                                                                                                                 top


Strain : Clostridium saccharoperbutylacetonicum GCF_002003305 RefSeq :NZ_CP016087 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP016087_7
DR consensus (30 bp) : ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGNumber of repetitions :28
Begin Position : 3635366 End Position : 3637172

3635366TTTTTCATTCCAATATGGATATATTTAAAGTAACATAATTGTTATTTGCTCAATTACTCTAAAGGA3635431
3635432ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTTTTAAGTATTTTGAACTATTTGCTGGTTCAGGTAT3635497
3635498ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCTACTGCATTACCACACCTTGCCTTTTGCTCTGTAGT3635564
3635565ATTTACATTCCAATATGGCTATATTAAAAGTAATTTTAATAGTGTAGAAATTTCTTGCTGACTTAA3635630
3635631ATTTACATTCCAATATGGAATATTAAAAGTGTTAAGGCTTTTTTCTTGCTATCCCTTTTATCCTT3635695
3635696ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCCGCTTCAATTAATTTTATGTAATTCATGATCCT3635759
3635760ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCTCCCATGAACTTTATTTTGAACAAAAGTAAATTAA3635825
3635826ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGAACTTTTTAAACATGCTTCAATTAAAGTTTTAGCACC3635892
3635893ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGATCTTTCTTTGTTGCACAGGCATATATTTCTGCTCC3635958
3635959ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTAATACAACTTGTAAGATTTTAACTTCATTTGATAA3636024
3636025ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGACTAAAGGATTGCATAAAGTAAGTATCACAATAACA3636090
3636091ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCTATTCCTCCATGTGATTCATGATATGTTATATTTG3636156
3636157ATTTACATTCCAATATGAATATATTAAAAGGATTCCAGAGCATACATGTTATATAGAATTATTCTT3636222
3636223ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGGTTTTTGTAAGTTCCAAGTCTTGTATAAACATCAAT3636288
3636289ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGGCCTGTTTAATAGTTGAATCATTAGCTTTCATGCTT3636354
3636355ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGGTGGCCTTATCAGTTACATCAATTAAAAACTTCTCA3636420
3636421ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCCAAGAAAATGTGATTGCGGTGGAGCTAATGAATTT3636486
3636487ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGGGATTTATCATTAGGAATTAAAACAAACACATTAAC3636552
3636553ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGGCTTGTACTGCTGTTTCACTTCCTGTTGTATCCCAA3636618
3636619ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGATCCAATACTTACTCAAACTCAAATGATTATAAGGA3636684
3636685ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTGCTAATCAAGCATGGGAAGAAATAAAAGCTACTAT3636750
3636751ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTGTTTTTGCGTTACTCTTTTTTCGTTTCTTACTTTG3636816
3636817ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTTCTCTAGCCCGTTCTATTGTACAAGTAGTGTTAAG3636882
3636883ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTATATTCAATTAGAGGATGATAAGGGCAAAATTAAT3636948
3636949ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGAGGTTCTGGGTAGCACCTGCAATTATATATATTCCC3637014
3637015ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCAACTAAAAGAAGCTAAATTCGTCACTAATTATGTA3637080
3637081ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGACTTGGTGTCGCTGCCCAGAACCTAGCTTTAT3637142
3637143ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG3637172
Left flanking sequence : Till position 3635366 (length bp)
AACTTTTCCGATTTCATATGTTTTTATTATGGCATCCATGCTGCCTATATGTTCTTCATCAGAATAATCA
ATAATTAGTTTCAGAGTTTTATTAGTTCCA
Right flanking sequence : From position 3637172 (length bp)
ACACCTCTTATTTTAACCCCTATTAATGGGGGGTGCGACACTAGTTTTTGTCGATGTCTTTTCATTACCT
ATTTATATTGAGCCAATGATAATGTATTTT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp