Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP016089_4                                                                                                                 top


Strain : Clostridium saccharobutylicum GCF_002003325 RefSeq :NZ_CP016089 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP016089_4
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCNumber of repetitions :33
Begin Position : 2818158 End Position : 2820276

2818158ATTTAAATACATGTCATGTTAATGTTAATCCTACACTTACTCTGTAGCTACCCCATGGCTTACT2818221
2818222ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATTTCTTCCTTTTCTGTTTGCTATATTGGCTAATTT2818287
2818288ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACTTTGAGCCAGTTATAGATAAGCTTATTAAATA2818351
2818352ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGATGAATAATGAAAGGTATAGATATTTCAAATAA2818417
2818418ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAGGTTAAAGTTATTACCAAAGAGTGTAATTACTGC2818482
2818483ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTAAACCGCCTTTTGGATACATAGGTATCTTATGGTT2818549
2818550ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTGATTTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTATACAA2818613
2818614ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACATAGTTACTTGGGCTTAAGTTATCTATTGTAGAT2818679
2818680ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCCAGCTAATGCTAGTGTATTACAAATAGATGGAA2818744
2818745ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTATTCTTTTTGCTCGTACTAAACTATTATCTACA2818810
2818811ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAGATGGATTTACTCAACTTGGATTCGATGCAAA2818875
2818876ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAAGTATTTAAAATAGAGAGGTGATAAATGATGAG2818940
2818941ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAACTATATTAATTTCATCATCTTTTAAATCAATGTA2819006
2819007ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCGAAAACTGATAATCCAAGTGACCCTGCTCCTTC2819070
2819071ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCTTGTGCAACAGACTTAAACTTAACATTATCAGAA2819135
2819136ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCCAACAGTTAATTTTTCCATCTTGACCTTTTATAT2819200
2819201ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGGTAGGCATATTTAAGTAGATTTTAAGAAGCTTT2819266
2819267ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTTACTGATACAAACACTAAAACTGATACTAAAAC2819332
2819333ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAATGGTGGTAAATTCTACATGGTAATTCCTAA2819396
2819397ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATTCCGGAAATGTTGATATTTATTTAAAATTAGC2819461
2819462ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGCAAATTTAATTTAAGGAGGAAATTATTATTATGTT2819527
2819528ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACTCATGTTACTATATGTTATACAAAAAGTGGTAG2819592
2819593ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTAGTAAAAGTGAGGTTGAACATATGATAAAACATA2819657
2819658ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTATGGTTGCTCTGTTAGTGGATTTTCTTTTTCTGT2819723
2819724ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATTTAGAAATAGATAAAACTCAAGAGAATAGAAT2819787
2819788ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGACTCACTTTTGTAAGGTCAGGTAATTCAGTTCGT2819852
2819853ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCATAAAGAAAATAAGAATCGCAAATATTAAAATATC2819919
2819920ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACGTAACTATTATTAGAATGAAACGTATTTATACT2819984
2819985ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGGTTAATCCTAAATCAATTGCCCATTGTTCCATCAA2820050
2820051ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTGACTTGGGTAAAGAACATCAGACTTTAGTTGTTAT2820116
2820117ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATCAATCAAATCCTCTTAGTGCATATTTCATCA2820180
2820181ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTCAAGGTATTCTGATTTTACATTTAGTCAGTTGAG2820246
2820247ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC2820276
Left flanking sequence : Till position 2818158 (length bp)
TCTGATTTTTATGCTAAAAACAATATGTCTTTTACAATTGGTTTCATCATAGTTAATGTTAGTCTTTAAA
TTATACAAAGCACAAGTATGTTTTAGATAA
Right flanking sequence : From position 2820276 (length bp)
CCCTAAGAAAAAAGCCACTTCTTATATTAAGATAATGCTTTCATTATAGTTAGTGTAACACATCCTTAAA
AATTTACCAAGCACCCTCAACTTAAATTAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp