Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP016092_4                                                                                                                 top


Strain : Clostridium saccharobutylicum GCF_002003385 RefSeq :NZ_CP016092 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP016092_4
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCNumber of repetitions :33
Begin Position : 2818157 End Position : 2820275

2818157ATTTAAATACATGTCATGTTAATGTTAATCCTACACTTACTCTGTAGCTACCCCATGGCTTACT2818220
2818221ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATTTCTTCCTTTTCTGTTTGCTATATTGGCTAATTT2818286
2818287ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACTTTGAGCCAGTTATAGATAAGCTTATTAAATA2818350
2818351ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGATGAATAATGAAAGGTATAGATATTTCAAATAA2818416
2818417ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAGGTTAAAGTTATTACCAAAGAGTGTAATTACTGC2818481
2818482ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTAAACCGCCTTTTGGATACATAGGTATCTTATGGTT2818548
2818549ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTGATTTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTATACAA2818612
2818613ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACATAGTTACTTGGGCTTAAGTTATCTATTGTAGAT2818678
2818679ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCCAGCTAATGCTAGTGTATTACAAATAGATGGAA2818743
2818744ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTATTCTTTTTGCTCGTACTAAACTATTATCTACA2818809
2818810ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAGATGGATTTACTCAACTTGGATTCGATGCAAA2818874
2818875ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAAGTATTTAAAATAGAGAGGTGATAAATGATGAG2818939
2818940ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAACTATATTAATTTCATCATCTTTTAAATCAATGTA2819005
2819006ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCGAAAACTGATAATCCAAGTGACCCTGCTCCTTC2819069
2819070ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCTTGTGCAACAGACTTAAACTTAACATTATCAGAA2819134
2819135ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCCAACAGTTAATTTTTCCATCTTGACCTTTTATAT2819199
2819200ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGGTAGGCATATTTAAGTAGATTTTAAGAAGCTTT2819265
2819266ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTTACTGATACAAACACTAAAACTGATACTAAAAC2819331
2819332ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAATGGTGGTAAATTCTACATGGTAATTCCTAA2819395
2819396ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATTCCGGAAATGTTGATATTTATTTAAAATTAGC2819460
2819461ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGCAAATTTAATTTAAGGAGGAAATTATTATTATGTT2819526
2819527ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACTCATGTTACTATATGTTATACAAAAAGTGGTAG2819591
2819592ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTAGTAAAAGTGAGGTTGAACATATGATAAAACATA2819656
2819657ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTATGGTTGCTCTGTTAGTGGATTTTCTTTTTCTGT2819722
2819723ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATTTAGAAATAGATAAAACTCAAGAGAATAGAAT2819786
2819787ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGACTCACTTTTGTAAGGTCAGGTAATTCAGTTCGT2819851
2819852ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCATAAAGAAAATAAGAATCGCAAATATTAAAATATC2819918
2819919ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACGTAACTATTATTAGAATGAAACGTATTTATACT2819983
2819984ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGGTTAATCCTAAATCAATTGCCCATTGTTCCATCAA2820049
2820050ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTGACTTGGGTAAAGAACATCAGACTTTAGTTGTTAT2820115
2820116ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATCAATCAAATCCTCTTAGTGCATATTTCATCA2820179
2820180ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTCAAGGTATTCTGATTTTACATTTAGTCAGTTGAG2820245
2820246ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC2820275
Left flanking sequence : Till position 2818157 (length bp)
TCTGATTTTTATGCTAAAAACAATATGTCTTTTACAATTGGTTTCATCATAGTTAATGTTAGTCTTTAAA
TTATACAAAGCACAAGTATGTTTTAGATAA
Right flanking sequence : From position 2820275 (length bp)
CCCTAAGAAAAAAGCCACTTCTTATATTAAGATAATGCTTTCATTATAGTTAGTGTAACACATCCTTAAA
AATTTACCAAGCACCCTCAACTTAAATTAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp