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CRISPRs details
NZ_CP016553_1
Flanking alignement tool
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NZ_CP016553_1                                                                                                                 
top
Strain :
Aggregatibacter actinomycetemcomitans GCF_001690155
RefSeq :
NZ_CP016553 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP016553_1
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
Number of repetitions :
69
Begin Position :
1147800
End Position :
1151913
1147800
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
GAATGGACCACCTCATAACTTTTACCGCTGCC
1147859
1147860
TTTCTAAGCTACCTATTCGGCAGTGAAG
CCGGAACAAACAATGGCAAAGGTGATGGTAAG
1147919
1147920
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CTTTGGACTTACATTTTTTATCTTTCTGATTT
1147979
1147980
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AGGGTGTAAGAACTCCAATTTATCGGCATAGAG
1148040
1148041
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TGCGTATCAAATCTAATCGACAAAGAGTTATC
1148100
1148101
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CTATAAAAAACATTTAGATAAATTGGAAAATA
1148160
1148161
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TCTTTTTCCCATTTTGAATCATTATTAATAAT
1148220
1148221
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CAGTAGTTATATAACGCCAACCAACCCAATGT
1148280
1148281
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TTCAGCATTTTGAGCAACTAATTCCTTTACGT
1148340
1148341
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ACAATCCTTTATTAGCATTGCCTACAGGGGCT
1148400
1148401
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CTTTTAGTGGTGCAAATATTGGCTATTTCAGA
1148460
1148461
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CCGGTTGTGCTGTCGGGAACGGATTAGCTGTA
1148520
1148521
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
GGTTTTTTACAAGTGATTTTAAATTTGCTGAA
1148580
1148581
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ATTATCTAATCAGCAGTTATTACGTGGCTTTA
1148640
1148641
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ATTATCGCAAATTGGGCTTAAGTTTGTATTGT
1148700
1148701
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CCAAATCATTAAACCAATCGCATTTTGTTTTT
1148760
1148761
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
GTACAAGAGAAATAAAAAAGTCTAACATTGTA
1148820
1148821
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TAGGTCTAATTGAAGGTGAATGGATTTTCCTT
1148880
1148881
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AATATGTAAATCTTTTTGCTTATTCAGATTTT
1148940
1148941
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AATTATATGCCGCCAATTGACATAGGGGCCAT
1149000
1149001
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TTGCAGGTGCAAAAGGCGATCAGGGCGAAAAA
1149060
1149061
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
GTTGACACAAACAGTTTTGATGACCGAGTAAA
1149120
1149121
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
GCATAATCAATGCTGAATCTGTTACATATCAA
1149180
1149181
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AAACGGAAATCCGCCATAGTTTGCGAAGTTAT
1149240
1149241
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AAAATACTATAACTGTTATAAATCCTTTTCTT
1149300
1149301
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ATCTTGATTTAATCTTGCTGCGTAATACTCTA
1149360
1149361
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ATGAAAATGAATTACCGGTTGTATGGAAGAGA
1149420
1149421
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ATTTGTTTTAATATTTGTGCCGGTGACTGTCTA
1149481
1149482
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ACGGGACGTAAAACAAAATATCTACACCCAAA
1149541
1149542
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CTAAAGTAAGTAACTTTAGTGATACTAATTTT
1149601
1149602
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CTGTAATTGAATCTTTTATTAAAGGTGACATT
1149661
1149662
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ATGATTATCTGAAACCATAAAATTTAGATTTT
1149721
1149722
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TGCATATTATTGTTAAAGGACAATTACCGTCA
1149781
1149782
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TTTTTTCAGCAGGATTAAAACAAAAAGATATA
1149841
1149842
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TTAGGGGTTGTTAAAATCGACCTTGTTTTGTA
1149901
1149902
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AATGTAAATTTCCTTAAATGAATTTATAACAT
1149961
1149962
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
GTGTTAATAGTAACAGTGTTTTCGATTGCCAA
1150021
1150022
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TCATCATTTCAGGTGCGTACAGTTTGCAATAA
1150081
1150082
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AAGTAATATTGCAACACTATTTCAATCTAAAA
1150141
1150142
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ACTTCATAATCGGAAAGTCTTTGGTCTTGATT
1150201
1150202
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TTTTCTTACCTTCTAAAGCCGGTTGATGATAT
1150261
1150262
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ATACAAAAAACATCATAAAAAATTTTTATTAT
1150321
1150322
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ACTTCATAATCTGAAAGTTTTTGGTCTTGGTT
1150381
1150382
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CTTTTACACCTTGACGTTGCACTAATTGAGAT
1150441
1150442
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TACCGCACACACTGCTTTCCGAGAGGATTATT
1150501
1150502
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CATATAATTTTAGAATTGACAACTGTTCAGAG
1150561
1150562
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
GTTTAAATTAAATACAAACCAAACAATTTATT
1150621
1150622
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TGAACCTTGAGCTTGTGTAGTTTTGTCATCAT
1150681
1150682
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CTAATTAATAGTATTGCAACGCAACAACCAATG
1150742
1150743
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TACCCAAATTTGATTAACTATTTTGTGCGTTA
1150802
1150803
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
GGCTTGCTCCTAAATGACTTCTATTTTCATTA
1150862
1150863
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TGACAGGGAAAATCATCAGTGAAGGTGGCAAA
1150922
1150923
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TTTATTTTAAAAGCTTCTATGCTTGTTTTATAG
1150983
1150984
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ACTTCATAATCTGAAAGTTTTTGGTCTTGGTT
1151043
1151044
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TTAGTAAACCATTTTCAATAGCCACAATTAAA
1151103
1151104
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AAAGCATTTCTTCATCAATACCGTACTTTGGA
1151163
1151164
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TACCTACTGCTTGTTGAACCGGTGCTTGAGTA
1151223
1151224
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AAGGTATAAAAGCTTTGATTTATGGTGGAGCA
1151283
1151284
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CAACCAATAATTGCTTATCAGTGCAGTTTGTT
1151343
1151344
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AAAACATATCTAAATTTCTTAAAATAGCCATA
1151403
1151404
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TGAACCTTGAGCTTGTGTAGTTTTATCATCAT
1151463
1151464
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CTTGTAAGGAACATTTTGGAGGTAGTTTAGAT
1151523
1151524
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
CCGGTTTCTACAATTTCTCGCACAGCATTATA
1151583
1151584
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
GTTAAACCGGTGCTTGAGTAGGGGTTGCTGTTG
1151644
1151645
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
GGGGCGGTCAATAAGGAGCATAAACCGCCCAA
1151704
1151705
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
AATTTGAGACTTGAACCAAGGCGATTTTTTAAT
1151765
1151766
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
ATTGTCAGCGTGATGATTTTTTCCCGTATAAA
1151825
1151826
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
TTAAGCTTTATAAATCGTTTGATGGCGTTAAT
1151885
1151886
TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG
1151913
Left flanking sequence : Till position 1147800 (length
bp)
TCATTATAAAATCCTCTTGTTGATGGTATTTTACCACCTATTGACGACTGCGGGATTAGTGTATTACTAC
ACTTTGCAATCGGTATCATAAAGCGTGTAT
Right flanking sequence : From position 1151913 (length
bp)
TAGGCATTCTAACTGAAAATAGCTGATATACCAAGTTGTTAGCGTATTTTAAAGTGAAAATCCTTTTTAT
AGATTGTGTTTTTAATATACTGTTTTTAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp