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CRISPRs details
NZ_CP016827_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP016827_4                                                                                                                 
top
Strain :
Lactobacillus helveticus GCF_001702095
RefSeq :
NZ_CP016827 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP016827_4
DR consensus (30 bp) :
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
Number of repetitions :
22
Begin Position :
870872
End Position :
872284
870872
AGCACCACGCGTATTAAGTTAAATAAAAAC
TCAAATCTAATTATTGATGATATTGAAAATAGAAGA
870937
870938
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CAGCACAAATTAAATCTGCAAAGGCTCATGGTCTTA
871003
871004
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
ATTAGTAGTGGCAGCTTTCCAGTTGTCATTCATTC
871068
871069
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GGTGAGAGTGCTGCTAACATCCAATCACTAAATGA
871133
871134
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TGATGCCATAAAAATTGACTATTTGTGCGGTAGCGA
871199
871200
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TACTTCTCAATCAGCTTTTCAGCATCTTTTTTATCT
871265
871266
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GCGATCACTGGACTAAGCACAAAACCACTTCAGTTGA
871332
871333
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
ACTTCCGAAGTACCATTGCCACCAGCCACTGCATG
871397
871398
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AACGGCATAAACCATTGAGTCGACATTGTCATCGTG
871463
871464
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AAGCTCCATTAATGCTGACTTAATCCCCCATGCAGT
871529
871530
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TTATCGGCTTACTGGCTGGCGTAGATTTGATTCTGTG
871596
871597
CTTTACATTTCTCTTCAGTTAAATAAAAAC
TACTTTCACCCATTGTTTTAGCAACGGCAGAAATAC
871662
871663
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AAGTGCCCCTGCGCGCTTATATGCACTCATGCTAGT
871728
871729
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TTTGCTCACAGCCAGGGCTATGCGATTGATTTTTC
871793
871794
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TCCGTCGAAGTATTTCATAGCATCGTCTTTCCAGA
871858
871859
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TCTCACCGTCAACCACAGCAGAAGTCGGGCCATTGTC
871925
871926
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GATCAGTAAACTTAATTCCGTCTAATCGATAGTAGAA
871992
871993
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CAGAAGTTGTTGTTGAAGACTTTTCATTTTTAGGT
872057
872058
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GAAGAAAGTTAAAGAAATATCGAAAAATGGTAAATCA
872124
872125
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CTTTTAGTAGTAACCACAGAAGTTAAATAATTAGA
872189
872190
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CTTTTAGTAGTAACCACAGAAGTTAAATAATTAGA
872254
872255
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
872284
Left flanking sequence : Till position 870872 (length
bp)
GCCGAGAACAATCGAGCGCGCAGTTTAACTGGCTTTCAAGCACGATTAGAAATTGCTATTCTGACTTGTA
ATCTAGCTTATTGTCTAGAACGATTTAACT
Right flanking sequence : From position 872284 (length
bp)
AGTTGCAACTACCAGTCCTACTGTATCAATAGATTCAACGGCCCTATCTGTCGACCTAACCAAAAACGCA
TCCAAAAATCACTAAAATCATTAGACAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp