CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP017019_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP017019_1                                                                                                                 
top
Strain :
Moorella thermoacetica GCF_001729945
RefSeq :
NZ_CP017019 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP017019_1
DR consensus (30 bp) :
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
Number of repetitions :
99
Begin Position :
479330
End Position :
485861
479330
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AATACCTGGGGCAAGACGTGGGGGGACTTAAATAC
479394
479395
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCCCGCTGATGGGCATTATCCTGGGTGGGTATTTCG
479460
479461
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CTAGACGCATGGCGGAAGAAGGGAAGACAGTAGAAG
479526
479527
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CCGCCATATAGTGCTGACACTGTAAGACGTACTCATC
479593
479594
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCGACCTGCCGGAAGGCTCCTGGCGCGGTGGCCAT
479658
479659
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ACGTCCACCGGCACGGCCCCGCTGGCCACGTTTTTC
479724
479725
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CGGTGCATTTTCCCCGGCCTTGGGAAAGGCGGGACC
479790
479791
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CAGGCCCGCTGGGAGCCTATCTCGGCAAAAAAACAA
479856
479857
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GCATTTCATTTATCCGCATACCGCTATAGATCAAAA
479922
479923
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AGATAACAGGTAATGGCTCACCATCCAGGCATTGCG
479988
479989
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TAAACTACCTGGGCGTAAATATCCCTGGCACCAGCGA
480055
480056
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TGCTGCCATCTTCTGCCGGCTCTTTTTCTCCGCCTT
480121
480122
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CCGCTTCCATATCTCCTACGGCGTACCACTCCAGA
480186
480187
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CTGGCGCCCAGGAGGCCGTCATTTTGTACCTCAAC
480251
480252
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TAAATTTGCCCCTAGCTTCGCGGTCGCCGGGGTAAA
480317
480318
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AGTAATTCTACGCCCTTATTCATTATTAAACTCCT
480382
480383
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCAAATCGTTGACGCGCAGATGGCCGCCAGAAAAGAA
480449
480450
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCTCAATAATTTGTTTATGTCACATCCTAAACATTA
480515
480516
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ACAGTAACTTTCCCTGTGGAGGGGTCGAACTCTA
480579
480580
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TACCAATTCACCCACAGGTTGTAGATTTACTACGG
480644
480645
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TATTCCTACATATTCCAGTGCTTCTTCAGCATTCAT
480710
480711
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ACACATTTTGTGATAAAAACATATCACATACATATAT
480777
480778
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TAGAGAATATCCAACACCGCCCGGTGGTCCACCTGCT
480844
480845
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AGCGGCTCCCCTTTCGGGGAGGTACGGGCTTGCACCGT
480912
480913
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GAAGTGACGCCACAACTGGCGCAAATGAGGTTGAATATT
480981
480982
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CACCTTTAACCTTGAAACTTTTAGCGTTTTCCTCCA
481047
481048
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ATCTTCTGCGGCACGTTTGCAGCCGTCGCTCCATAAC
481114
481115
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AAAAGGAAATTGGCATTTGGAGCAGGCGACAGAACAA
481181
481182
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TACACAAATACAACTTCCTGGGTGGTATTGTAGGGT
481247
481248
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCTGCTCTAAGCGAACGTTTTTTGTTTTTGCGATTAA
481314
481315
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GTATATCACGTTGCTACGTTGTTGTCAATGCATTTTCG
481382
481383
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TAAATATCTTCGGCGATTTGTAATTCCCCCGACGGCA
481449
481450
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TATGCCGCGTGGAATATATTGGCAGGATGGTGGTA
481514
481515
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCGCTTGCGATGACGATTTCCTCATAGCTCCCGTT
481579
481580
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CACTCTGGTATAACCTCGATAAGCCGCTGCGCGGC
481644
481645
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CCATTTTGGAGACACTGTTAACTTAACCAAACTAAGAA
481712
481713
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AAGCATCTTTATTGCCTGTCGCCTTCCAACAAAAA
481777
481778
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCTTTGTAATGTCGCCGATGTCCAGCTCACTCGATG
481843
481844
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TTCCCATCCTGGCCGGCCTGGCGGTAGAGTACCTCCGGC
481912
481913
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AAGGCGTATAAGTACAGCTCCAAGACCGTACTAGTGC
481979
481980
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CCGGCCTCACAGCGGCCTGGTATGAGAAAAAACTTGA
482046
482047
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GAATATTATAAAGCGGCTTTGCGCCTGTAATATGCG
482112
482113
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AATGCACGCGGGCACGCAGCTTTTGCTTCCTCTTCGGA
482180
482181
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TTGTAACGGAACCACTCGTAGGCGCACTTGGTGCTCTG
482248
482249
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CTGTTCAACCGCAGTATTTGTTTTTTCGCTCATCTA
482314
482315
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AATGCACGCGGGCACGCAGCTTTTGCTTCCTCTTCG
482380
482381
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CAAGCTCGGAGTGAGCCTGCGAATACCATTCCGGCC
482446
482447
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GATGCAAGCCGCCCATTCAAAGGCGGCTTCTCCTA
482511
482512
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ATTTAAGCTATATACCAGTAGAATTATGGGAACAAA
482577
482578
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CCCGATACCACGGCAGCTAATGATCTGCGTATCAG
482642
482643
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ACGTAGATAAGGAGCTATACTGGAAGATTGTCGCCT
482708
482709
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GATGCAAGCCCATTCAAAGGCGGCTTCTCCTACCTCT
482775
482776
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TAATTTTCTCCCCTTCAAAGGGGATATAAATTTTTTGG
482843
482844
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AGAAAACAAGGAAAGTCTTTTCGAGAAATCGCTGAA
482909
482910
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GTGATCTCGTCCACGGTCATATAGAGGTACTTTTCA
482975
482976
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CACATATTTTTACCTCCTATTGCCAATAATTTTATA
483041
483042
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GGATTCTTACAATACCGGCTACAACATTAAATAAATA
483108
483109
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CTCTGGTTCGCCGTCAGAAGGTTCGTCGTTCCCTCTG
483175
483176
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CGGGATAGCGCCCACCGGATAAATCACTGCCGCCAGAG
483243
483244
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TAGTCAAGGAGGTGTAAGTATAGAGCAACCTTTGTCTG
483311
483312
GTTTGAAGCCTTCCTATGAGGGATGGAAAC
ACCTAAATATTCTTCAGGAGTGTAAAATCCTTTTGA
483377
483378
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GTATATCACGTTGCTACGTTGTAGTCAATAGACTAC
483443
483444
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ATAGTATTTGAAGTTTATCATCATGCTCAAAGCTTA
483509
483510
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AAGTTCCTCTAAATAACCTGAGTTCTATAGTATTTTC
483576
483577
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ATCCTCCTGCCTAGCGGGATAAACCTCTCATCAGTC
483642
483643
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCAGTAAGATCATTATTAGTAGTGTTGGATTTACCGT
483709
483710
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCTCGTCGCGAACATACGCCGGTTCTCCGGCGCGGATT
483777
483778
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ATCGCCATTGAATGGAAGTCTTCTTTCCATCGGCTA
483843
483844
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TGGAAGAACGCCTTTCCGCTGATTTTGTCTTAGAG
483908
483909
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AAGAAACGATTTTGCAGGGAAAAGGGAAAGGTTGA
483973
483974
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TTTTAGCTGTTTATATTGCTTTATCAGCTATTATA
484038
484039
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ATTTCAAGTAAAGTATTTTGTAATTCTCCTTTTCT
484103
484104
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TTGAGTCCTTGCCATTGTTACATACCTCCATTTTAA
484169
484170
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CAAGAAGCTCAGGCGTTGTCAAAAATAGAAAAAGAAA
484236
484237
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GCCGGGAGATAACGGCGATTGAGGCCCAGGCCGAGCA
484303
484304
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ATGTAATAAGTAAGGTAGTTTCTCTTCCTGGTGAGA
484369
484370
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GATATAAGTCCTTTGAAAAATGTAGGTATATCTTTTA
484436
484437
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AGAATACCTATCACTACCTACCACCTACCAGATTTC
484502
484503
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TACGGTCAGCTTCTTCGTTCCCTAGTTCTCCGCGC
484567
484568
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TTAGTATTGATTATCATTTTCAATGAAATTTCGTA
484632
484633
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CTTTATCAACCTTAACATATCCTGCATTTTTAAGC
484697
484698
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCAGTGTAGAGCCTTATGGGCAAGCTGAAGTATGGGA
484764
484765
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AGATTTCATTTTCTTGCTTCAATTGCTCTACTACCTG
484831
484832
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CCGGTTCGCAGGACTTCTTGTTTTGTGGCTTCAATCCA
484899
484900
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TCTTCTCCTGATTAATACCAGGAGACTTTTGCGCTTT
484966
484967
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GTTGAATAATATTTTCCTTTGAAAAGGTAACTATAA
485032
485033
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
AAAATAACAACTAAATATCGACTATATTTAAATGGAG
485099
485100
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TTCTTCTACGATTTCCCACTTAACTTCGTCTGTTATA
485166
485167
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TAATGATTCTCGTTACTCGGGTGCATCGCAGAATAA
485232
485233
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TTTTTAAACCTACAGCCACTAAAGCAGTTAGGACATA
485299
485300
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TAGCGCAAGATGAACGAATGATAGATAGGCAAATACGC
485367
485368
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GAGTGGTGGAGAGAGCAAAAATGGCGACCAGATAAC
485433
485434
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TGAAGCTGGTCATCGATTTTCCGCCCGAACTCAAG
485498
485499
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TTTTTTTACTCCTTTTTTCTGCCTCTCACTTTCCT
485563
485564
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
CTTCAAGTAGTAATAGTATAAATAACGTTTTAAGTG
485629
485630
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
GTGGATGGGTAGTTTATTTATGTGGCGGGCATATTGG
485696
485697
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
TGTGTTTCTATACAACAACAGTTGGATGGTACTAATAC
485764
485765
GTTTGAAGCCTACCTATGAGGGATGGAAAC
ATGAGAGAGGCCAAGAATTTCAAGCCCAAAAACAAAA
485831
485832
GTTTGAAGCCTACCTAGTTCCCCCTGAAAA
485861
Left flanking sequence : Till position 479330 (length
bp)
AACAGGAGATTCTAAGAATGAGGCCTTTTTCTTGCCGAGTGGATTGAAGATGATATAATAGTGGGTGAGA
AAAAGGTTAATATTTTCAACCACCTAACGG
Right flanking sequence : From position 485861 (length
bp)
AGTCCACTTTTTGCATCACATAGGGGAAATGTCATTTCCGGACTGTAGATCGAGTAGAATTCTAACTGTT
TCATCCATCTTGTTAAACCATTGTTGCCAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp