CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP017019_6
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP017019_6                                                                                                                 
top
Strain :
Moorella thermoacetica GCF_001729945
RefSeq :
NZ_CP017019 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP017019_6
DR consensus (29 bp) :
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
Number of repetitions :
54
Begin Position :
1935464
End Position :
1938935
1935464
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GGAGTACATAGTAGTTCGCGAATTTAACTCCTCGAT
1935528
1935529
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CGCCCCACTACGGCAACTTCCCGGCTGTCGTACCAG
1935593
1935594
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GCCTGGAGCAGCAGCAGCTAGGTCGCGCCTCGCAG
1935657
1935658
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TCGCCGATGCAATGCTGGTTAAAATTTTAACCCTCA
1935722
1935723
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CCGGCGTTCAATGCCCGAGCGAACACTCTTTAACTC
1935787
1935788
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TAAACATGCCGTAATGGGCATGAGCGACATTGTTT
1935851
1935852
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TATTACCCCTTAAGGTTTATGCTAAACAGGACACTA
1935916
1935917
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GGTTAGCGTGTGGGCTGCCACATTCCCAATTGCCCC
1935981
1935982
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TCTATATCAAGTGGGAAGCACGTCTCACAGACGTTA
1936046
1936047
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TCAGCTGCCGGAGAAGATAGGATTTGCAATAGGATTTA
1936113
1936114
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GCTGCATAGAAATCCTTGATAACTACAAAGGGGCTAA
1936179
1936180
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
ATTCGCGGTATGGCATGTTGCATAGAATACCAATAA
1936244
1936245
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TCAATGGCTTTATCAGCCGGGTTAGTAGCTATGACG
1936309
1936310
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CGAGGATAAGCCAGCAAGTACAGAAGCCGGATGTCT
1936374
1936375
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AGGCCGGAAAGGTAGGGTCGGAGTAGATTAGCTCG
1936438
1936439
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TTATGTAGTAGCTTTGGACAGCAAGGGGACCCTGCAA
1936504
1936505
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TGCATCTCTAAAAAGCATCCAGACAGCTACAAAA
1936567
1936568
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TATAATTAACAGGTTGATTGTAAACCACCTGGGGCC
1936632
1936633
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TAGGTGCCGAAGGCATTGACCGGGCTGTCAGAGCTC
1936697
1936698
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GTAAGCCCGGCACGATCTTGCCGGCAGGCCATCCCG
1936762
1936763
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TTATTTACCACCGCCGTTAACCTGTTCAATTTTAGC
1936827
1936828
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TTAAACAAGCCAATTAAAAGTTTTAAAAGATACTCA
1936892
1936893
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TTTCATAGACTGATTCCTTCGGCGCCTCGCATCTCA
1936957
1936958
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GCGTCCGTCAGCCATTTAGCTCACCTCCATTAACTT
1937022
1937023
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GACAATTTACGGCCCCCGGCATGGGGCCTAAGTTT
1937086
1937087
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GACTTACCGGCATAATAACGTCGCCCCTGGGGTTAT
1937151
1937152
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CCTGATACTCTGCGTTTCCACGGGGCTTATCGCCCTG
1937217
1937218
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CCCCAGGGTATTGCAGCAAACTGATTATACAGTCCTA
1937283
1937284
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AGATTTTGCGGGACACCAAGGCCCCTGCCATATTGG
1937348
1937349
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TGCTTTACGCTGCCGCGACGGGGTTATTTGCGATGA
1937413
1937414
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CCAAATCACGTTTTTCTGCCTTAAGGCGTCTAGCTC
1937478
1937479
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TCTATGGTGTTTGCATTGACACTGGGTCTTTTGAATA
1937544
1937545
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CAGCTCCATCCTCGCCCAGGGCGTCCCGCAGATCGA
1937609
1937610
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CTGCCGCTGGACATGAACAAGGTAGAGCTGCGCTTG
1937674
1937675
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GTACCACAATGAGCGCTAGCTGTCAAGTGATAGACC
1937739
1937740
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AAGTCACTGGTACGATACAAGAGAAATTGCCGCAG
1937803
1937804
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AGTAGCAGATGCGGCAGGCAATCGGTACTTAATATA
1937868
1937869
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TAGCAGATGCGGCAGGCAATCGGTACTTAATATA
1937931
1937932
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
ATGTAATAGGATTTACCATGTAGGGGTAGATAACTA
1937996
1937997
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TCTTAATTACGGTATCAAGGCCGCCTATATGGTCCTCA
1938063
1938064
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TAGGTCGTTAGCAACTAAGCTACCTCCTCTCCAGCG
1938128
1938129
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GATAGAATGCGGATTGGTAAGCTTCCTCTTACATC
1938192
1938193
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GTCCTAGAGTTTTAATTAGCTCTTCCTGTACTGCAT
1938257
1938258
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TGGCGGCAATCGCAACTTTATAAGGAAAACGGCAA
1938321
1938322
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CGCTCCTGCCAGTGAAGCTGCTCGTTGAAGTAGGT
1938385
1938386
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
AGCAGATTTACAGCGCTGTAGAAGCGCATTATATAT
1938450
1938451
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CTTTATCGGCGGCGAAGTCGCAGCCCTGGAAGTTTTC
1938516
1938517
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CCACAAGAACGAGAAAGGCTATTATGCTGTATCTT
1938580
1938581
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
GGCTCCGAGCCGGATGGGAGTACATCAGGCAAGAGTA
1938646
1938647
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CAGGTAGCAGCGGAATACGCAAAGACGGCAGGCAAAA
1938712
1938713
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TGTCAGGGCTGCGTGGAAGTGGCTACCGATTTCGG
1938776
1938777
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
TTGCGGACCATTTTGGTGACCTCAACGAAATGATCAA
1938842
1938843
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
CCATCACTACCACCCGGTCACCTGCCTGGAGCCGC
1938906
1938907
GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC
1938935
Left flanking sequence : Till position 1935464 (length
bp)
CCTCTCAGGGGAGATTTTATCACAAGGTGGGTCAGTTTTATTTGACGATCCTGGGTCAATTCTATTTTAC
GATCTACACCCCTGGAACTCGCCGGCAGCA
Right flanking sequence : From position 1938935 (length
bp)
CGCAGATGAAAGGCTTGTCCCGACAGGGATTTTAGCAATTTTTTAAAAGCCCCTGCGTCAAACCGCCAGT
TTGCACTTACACTATAGGAAATTATCTGTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp