Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP017603_3                                                                                                                 top


Strain : Clostridium formicaceticum GCF_001854185 RefSeq :NZ_CP017603 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP017603_3
DR consensus (30 bp) : ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATNumber of repetitions :17
Begin Position : 2541918 End Position : 2543001

2541918ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATGAAGAACAAAACCTTTTCTTTCTAGTTCTTCCCAT2541982
2541983ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTAATAAAAAATCTCCAATATAGAAAAATCCAATAT2542047
2542048ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATGATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTA2542113
2542114ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATA2542179
2542180ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAAT2542245
2542246ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGG2542312
2542313ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATAACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAA2542380
2542381ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTG2542446
2542447ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATAGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGC2542511
2542512ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATCCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCA2542577
2542578ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA2542643
2542644ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA2542709
2542710ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTAC2542775
2542776ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATCAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTT2542841
2542842ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATCAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCA2542907
2542908ATTAAACCTCAACATAAGATGTATTTAAATATCCTTGTTTTTCTAGAACTTCTAATGAAATTTG2542971
2542972ATTGAACCTCAACATAAGATGTATTATTTA2543001
Left flanking sequence : Till position 2541918 (length bp)
CATATTCTTAATAAATTGACTTGGTAAAAAATTTATTATACTATTGATTTAGCTTGATTATGACGAAAAA
TCAAAAGATTGGAATGAGTTGCTTGCAATG
Right flanking sequence : From position 2543001 (length bp)
TGATAATAGAAATTTTACATTCTTTTTAGTATTAGTTGAAAGGCATAATTTTCCTCACTATGTAAAACAC
GAATAGTGGATTTTAGGGTTTTAAATTAAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp