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CRISPRs details
NZ_CP018099_9
Flanking alignement tool
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NZ_CP018099_9                                                                                                                 
top
Strain :
Caldithrix abyssi DSM 13497 GCF_001886815
RefSeq :
NZ_CP018099 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP018099_9
DR consensus (30 bp) :
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
Number of repetitions :
31
Begin Position :
4498966
End Position :
4500979
4498966
GTTCCAAACCTACTCTTGTTCGATTAAAAT
CGTAATTCGTAATTCTTAATTCGTAATTGAGTTAAA
4499031
4499032
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
CAACGTCGATAAACTGATTGAAGAAAGTAATAAGGC
4499097
4499098
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
TAAGCCAGATACCGGTGTACAGCCGAAGCTCAACGG
4499163
4499164
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
ATGATACACAGGCTATACAAAAAGCTATTAATTATG
4499229
4499230
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
TCTGGTTAAACCGGTTAGCGATGCAATAAAGTTTTCACC
4499298
4499299
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
ATTCCGATTCCTGACAGCTCCGCGGCCTATCTAAGAGT
4499366
4499367
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
TAAGAGGCAGGAAAAAAACAGTCAGATTGCATCC
4499430
4499431
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
GTTTTTTATTAAAACTAAAATAGGAGGGCAATAGCCG
4499497
4499498
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
TCGAGGTTAAATTTGTTTTCTTGCTTTAAAACTT
4499561
4499562
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
TCTATGGCCAAACGTATTTCGATAAGAATATATT
4499625
4499626
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
CTTTTCCCTTTATGTTTAGTTATGCTTATTTGCGC
4499690
4499691
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
TTTGGTGAAACCACTTCGTATACGGTTACACTGGG
4499755
4499756
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
TTGTTGAAATAGTGGAGCGGCCGGGCTATCATATCCT
4499822
4499823
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
CTTGTCATACAAAAATACATGAGCAAGAAAAAAT
4499886
4499887
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
AAATTGCCCGGCTCTTAAATCTGTAAGCTTTTTCCT
4499952
4499953
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
AAAGTCTCTGCCGGATTCTTTCAAGTCCTATGAGCAA
4500019
4500020
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
TCAACCAAAAAAAAGGAGAAAAAAATGGAACACAT
4500084
4500085
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
GTTTTTCCAGGTGATACAGTCTTGTGGTGTAAACAGTA
4500152
4500153
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
ACAAGCACAACCTATTTTTAAAGTCGCTGTAACTCCTTT
4500221
4500222
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
GGTGTTTCCAGATCAGTCATCTACAAAGCCCTCAAGGC
4500289
4500290
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
ATAATCTTACATTGCACAGATTCAACCTGGGGTAACCT
4500357
4500358
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
TCTGTGAACGGTCTTCCTTAAGCGCTTCGATCTG
4500421
4500422
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
AGCACAAACCGCCAATAAAATCAAAGCCTTTATTGCC
4500488
4500489
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
TCAAGCGTTATAAAGAACATCCGCAAGATTTATCT
4500553
4500554
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
AACTCATGAACAAAGACAACGTAAAGTGTACAACTTC
4500620
4500621
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
ATAATAGCTGGCACTTTGGAATTATTGTTATTGAT
4500685
4500686
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
CTATATTGCGCAAACGTTATTTGAACAAGAACGTTTT
4500752
4500753
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
GGCTTAATAAAAGATGCAACTCGCAGATTGTCCGGG
4500818
4500819
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
AGGCTAGTGTTTACGTGGCTACGCAACCGGACGCG
4500883
4500884
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
AAAACTATCTGAAGAAAATGATGGATTTGAATTAAA
4500949
4500950
GTTTCAATCCCACTCTGATTCGATTAAAAC
4500979
Left flanking sequence : Till position 4498966 (length
bp)
CTCCGGATCGCTCCAAACGTCATTCCCGCGCAAGCGGGAATCCCCTCCATGCTTCGCTCCAACCGTCATT
CCCACACAAGCAGGAATCCCCCCCATCTTT
Right flanking sequence : From position 4500979 (length
bp)
CCGTTGTTCAGGCTCAAAAAAAATACCATTTTTCAATGGCTTATGCAAATCCTTTTCCGCATATTTTTAA
TAGATGCCGCGTCGATCTCTAATTGTACGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp