Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP018763_1                                                                                                                 top


Strain : Pediococcus acidilactici GCF_001922325 RefSeq :NZ_CP018763 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP018763_1
DR consensus (36 bp) : GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCNumber of repetitions :23
Begin Position : 429771 End Position : 431258

429771GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTCGGACTCTGCATTGTCGTAAACGGCTTGG429836
429837GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCCAAAAAAAGTTATTATTCCTGCATTGAAAG429902
429903GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTTACCGTTTTGTTTAGACTTGAAAACTTTA429968
429969GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCCTTTTCTAGCTGATTACATTACCGGTTTTT430034
430035GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCAGCGACAGCCGTTATTTACCGGACGAACCG430100
430101GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTGGCTGAACGTAAGGCTATAGAGAATCGAC430166
430167GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCCTTATTTGCTCGAAGAACATACTCATCAAT430232
430233GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTTAGAGCTCGGCTTGTAGCTCCCGAAACTA430298
430299GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCGGTATTGCTGAATGTTATCAGAGGTCCCTT430364
430365GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTATCAATGTCCCCAAATGTCCCCAAACAGA430430
430431GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCGGGAAGTACGCTCCAATGACGCTAAATTAC430496
430497GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCATTACTGGTTACATGTTGGCGCATGTTGAC430562
430563GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTCCCAATTGCCGCTTGCGCAGCGTGACGAG430628
430629GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCGGCCATTTGCCGAGATTAGAAATGCGGTTA430694
430695GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCTACCAGCCCACTGTCCAGCAGCACCACCTG430760
430761GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCCCCAAGGATATCGTTTGACAAATAGTTTTT430826
430827GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCAAGGATAATAACGCTGCCTTTGTCTATGAC430892
430893GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCGAACGGATTTCGGAGAATTCCTAAAATCTG430958
430959GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCAGTCTGGGTTACGTAATGTAAGCCGTGCGG431024
431025GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCACTATAGAGGAATGGAACGAGTGCCGACCT431090
431091GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCCCGAATTAAGCAGACAATTTAGCATTGCTA431156
431157GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCAGTCTATAAAGTGATTGATCACCGCACCGA431222
431223GTTTCAAAAGGATGCCAAATCCCTAAGGCTAATCAA431258
Left flanking sequence : Till position 429771 (length bp)
GGCAATCAGGAGGCCTATGGAAATAGCGAATTCTACTACATTGACAATGACTTTGTTGATTGGCATCAGT
AATTGATGAAATTTTAGTTAGAAAATAACG
Right flanking sequence : From position 431258 (length bp)
AAATAGATACGATTATTTATTTAATATTACAATCCTTAAAGTCCCTCCAGCAAAACAACAAGCTACTTGA
TCAAGCGTGACAGCTTTTAAGTAGCTTGTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp