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CRISPRs details
NZ_CP018912_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP018912_4                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium columnare GCF_001936395
RefSeq :
NZ_CP018912 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP018912_4
DR consensus (36 bp) :
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
Number of repetitions :
29
Begin Position :
2342108
End Position :
2343985
2342108
GATTATAATTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TCATCATTTATTAATGAATCAAAATTATCA
2342173
2342174
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TTTAGTTATTAAAATGATTATCAAAGCGAC
2342239
2342240
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TTTGTCGCTTCGCCTTAAAAAGTATTCTATA
2342306
2342307
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
GGGCTAAATATGGTGGTTTTGAAGAAGATG
2342372
2342373
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CCCTTTTATTTTGAAATCATCAATCTTCA
2342437
2342438
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TGTCTCCATTTTTAAGAGCTTTGATGTAGT
2342503
2342504
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TAAAACCTCACGGCGACGAACTAAAGAAG
2342568
2342569
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
GACGATGCTGACGATATGGAGTCACGCAT
2342633
2342634
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CTGACAAAACCTTTCAATGGCATTTGTTA
2342698
2342699
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TAGAAAGTCGATATAACAACGGAGCAAAG
2342763
2342764
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CGAATTTCATAGATTAAAACCTGGGGAATT
2342829
2342830
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CATTGTGATTGACGTTTGTATTCATAGTTT
2342895
2342896
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
ATAGATCAAGACAATCCAAATAGATTTAAT
2342961
2342962
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TGTAATTGGAACTCTTGTTGATGGTATAGG
2343027
2343028
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TAAAAATGATATTACACAAAAAGCAAATAT
2343093
2343094
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TTATTCAAAATTCTTTAACGAATAGATGTT
2343159
2343160
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
ATTCTGTGGTAAGACTAATGCAGGTGGCTG
2343225
2343226
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
ATAATCCATTATAATTTCCTCGCCTATTGC
2343291
2343292
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CAAAAGTTTCAAAGGGATTTGTATCCGTGT
2343357
2343358
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CATTTAGATTTAGTGAAGGAGCAGTCAAGT
2343423
2343424
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
AGAACCTTTGTCTAAAATAACAGTAGAACA
2343489
2343490
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
AAATTAATTAAAAGAAATTTCTTAAATAAG
2343555
2343556
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
CTCTATTATTTGGACCTGTTAAATCGTCT
2343620
2343621
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TCAATCGAGAGCGACGTATGAACAAAAAG
2343685
2343686
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TTCTTTTGTCATAAACTCTAATTTTCCATT
2343751
2343752
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
ATAAGGGTATTAAAAAAGTATAGTTTCATA
2343817
2343818
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
TCGGAAAAGAAAACATGACTGCTGCGAATG
2343883
2343884
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
GAAGTTTTTACCTTTTTCGAGCTTCGCGTC
2343949
2343950
GTTGTGGTTTGATTAAAGATTAGAAAACACGATATT
2343985
Left flanking sequence : Till position 2342108 (length
bp)
AACGAAGTCAAAACACGATATTATTTGGTTAAAAATTACGATTGTAATTTCAGTTGTGGTTTACAAACAC
CAAGTCAATATTTGTTATAGGTGTGTTTGT
Right flanking sequence : From position 2343985 (length
bp)
AGCTAACAGCTTAGTTATTAAATATCAAAGCATTAAGCCGAAATATCGTTAAAAAAAATGCTTCTTTTTT
GGCACGTTATACCAAGATTGAAGCATTTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp