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CRISPRs details
NZ_CP019300_1
Flanking alignement tool
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NZ_CP019300_1                                                                                                                 
top
Strain :
Prevotella intermedia ATCC 25611 = DSM 20706 GCF_001953955
RefSeq :
NZ_CP019300 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP019300_1
DR consensus (47 bp) :
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
Number of repetitions :
11
Begin Position :
602421
End Position :
603239
602421
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
ACCCACAATAAGAAGAACTACTATCTGCCT
602497
602498
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TAGCAATGGTGCTATAATATCCTCCAGGCT
602574
602575
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TTGTTGTGTAAAGGAATCGGGTTAAAACCC
602651
602652
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
CCAATGATGTGAGCGTGTCTACAGCCGTGT
602728
602729
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
AACGTATTCAGTACCTAAAAAACCTAATAC
602805
602806
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
GATATCCTAGGTGCTTATAATGATGCCAGAG
602883
602884
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
CCCTCTGAAATTTTATTGAAAACTATACAC
602960
602961
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
AACTTCCATTTTCATAATGTGTTACTCCTT
603037
603038
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
GGGGGCTATACACGCCCCCACGTTGTTTTA
603114
603115
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
ACAAAGACGCTGAAAATAACCGTCTTGCCT
603191
603192
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
603238
Left flanking sequence : Till position 602421 (length
bp)
AGCTGATGAGATTTAACAAATATTACAAAAAAAAACAGCTGTCTGAATTGTACAATTATAAAAGTAGGGG
TAGTATTATATATAATCACCTAAACAAATT
Right flanking sequence : From position 603239 (length
bp)
CGTCCACTTTATGCCCTTGTAGTTCCTGTGTTGTGATTAGCTTTAAAATTAACGTGAGTTCGATATAAGA
AAGTTGTTTTAAAAGTTGTAGGAGTGGAGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp