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CRISPRs details
NZ_CP019300_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP019300_2                                                                                                                 
top
Strain :
Prevotella intermedia ATCC 25611 = DSM 20706 GCF_001953955
RefSeq :
NZ_CP019300 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP019300_2
DR consensus (47 bp) :
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
Number of repetitions :
30
Begin Position :
604302
End Position :
606579
604302
TATCGAACTCACGTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TGAATTAAAAGAACGTGGAATAATGCCAAG
604378
604379
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
GTTCCTTTGAGAGTATGGCCTTGCAAAAGC
604455
604456
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
CAATTCGGCACAGAAAAATCTTCATAAAGG
604532
604533
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
AGGCTTCAGAGTGTTATGTAGCTGTAACA
604608
604609
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
CCCATAACTATTTTGTTTTGTCGTTTCCT
604684
604685
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TCGAAGCCTACGCTCGCCACCGCACGGTGG
604761
604762
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
CCTTGCCCACTGCATCGCATTGATGCCGTC
604838
604839
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
GAACTCCAGTACAACAAACGCATCATAGCC
604915
604916
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
CTCGGCAGTCATTTCAACTTTTACTTTGTC
604992
604993
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TTGATAAGTATAAAGACATGCCAAATGTGG
605069
605070
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TGCTGCGTCCTACTTGACTTGCATTTGTA
605145
605146
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
ATAATCACCAGATAAGCTTGTATCTACAGG
605222
605223
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
ATTTGAAGATTATAATATATCTGATGAAAA
605299
605300
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
GTTCTAAATGAGAAATAAATGCGTTTAATT
605376
605377
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TATACCATTATCACAAACAATATTTAATAT
605453
605454
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
ATCATTCATTTTCTTAAGTGTATCGATGGT
605530
605531
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
CAATTTGTTTTCCAACACTCCACTATCCAT
605607
605608
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
GATATTAACGCAAGCGATTTCAACGATGAC
605684
605685
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
CCTTAGAGTCTACATAGGTACGAGCAAACC
605761
605762
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
CATCAAAGTCAGCGTTTGGGAAGTCGAAAC
605838
605839
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TTCAAAGGAGTGAGTTTCAAACGTTTAGCC
605915
605916
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TCTACATATATCTACTACATTAAACTATCT
605992
605993
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
AATGGATAGCTAAATACATGGCATTCATTC
606069
606070
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
ACTCTGAAAAGAATAGACCTTTCAGAGGCTC
606147
606148
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TTCACCATAAATAAATTAAATATCCATATA
606224
606225
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
AAGGCGGTCGAGCGACCGCTTGATGCGTGC
606301
606302
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
AATAGAGAAATCACCAACCTTTAAGAAACT
606378
606379
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
TTGATATCATTGGTATTTTTTTCATAATTT
606455
606456
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
ATAACACTCTGAAGCCTGATGAAAAGTAGG
606532
606533
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
606579
Left flanking sequence : Till position 604302 (length
bp)
AAATCTGATAGCAGGACTCATTGCATACAATCTGTTGCCAAAGAAGCCAGAAATGAACATAGAGATAATT
GATAAAAGCAGGATAATTGCATAGAGCTTA
Right flanking sequence : From position 606579 (length
bp)
TCAAATAGCTTAAAGCAATGAACATCAGTGTTGTTACGAAAGCTTAGAGAGAAAGAAAAATGCAAGCAAA
ATAAAGTTCCACTCGTTAAGAATGGAACTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp