Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP019609_2                                                                                                                 top


Strain : Vagococcus penaei GCF_001998885 RefSeq :NZ_CP019609 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP019609_2
DR consensus (36 bp) : GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACNumber of repetitions :32
Begin Position : 1801260 End Position : 1803349

1801260GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTATATCACAAGATTTTAAAAAAATAGTTGT1801325
1801326GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTAGATAGTCGCATAGTTTTAGATGATGATTA1801392
1801393GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACCAAAATAGTTATCCATTATTTTTTATCAAGA1801459
1801460GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACGTTTGCATTATCGACGAAGCACCACTCAAT1801525
1801526GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACATCACTTCTACCCAACTTTTGCCGTCCCAT1801591
1801592GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACACTGATTTACCACTACCACAACCTGACACG1801657
1801658GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACCAAAAATCAGTTAGACGACAGAAAAGGTTGT1801724
1801725GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACCAAAATAGTTATCCATTATTTTTTATCAAGA1801791
1801792GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACGTTTGCATTATCGACGAAGCACCACTCAAT1801857
1801858GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACATCACTTCTACCCAACTTTTGCCGTCCCAT1801923
1801924GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACCTACGGCGGTGCAATCGGCACGTACGGGCG1801989
1801990GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACAAAATTATCTCAATTAAAAAATGTTTTGGC1802055
1802056GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACAACATGTTTATCGTTTATGATGACACCATT1802121
1802122GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTAAAGTTGTTATCCTTCTGCTCTTCGCTAC1802187
1802188GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACGTTTTTTAAGACAATCCTATCCAGAGCTGT1802253
1802254GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACAAAATTATCTCAATTAAAAAATGTTTTGGC1802319
1802320GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACAGTGAAGCTGATACTTGTTTTCGTTCATCA1802385
1802386GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACATCTCAACGAGGAACGTATTGGGCTGTTCG1802451
1802452GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACATTCCGATTGAAATTGTTGACGGAATTACA1802517
1802518GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACCAGAAGGTGAGCGTGTTCTTTTCATCACTG1802583
1802584GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACCAATACCTTTTATTCCGCTTGTAAATCCAT1802649
1802650GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTAAAATTTTTTCTTTGATTAAGACTTTTTC1802715
1802716GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTTGGTTTTTTTGACAAACGTCACATCGTCT1802781
1802782GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTTCTACACTTTTAAAAAAAGAGCAAACATG1802847
1802848GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTTTTCTTTTGGCTCTGGAATAAGGAGTTTG1802913
1802914GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTTCTACACTTTTAAAAAAAGAGCAAACATG1802979
1802980GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTATGCCTCCTGTTTTTTAGAAATTCGGTAA1803045
1803046GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACAAACGTCAAAGCGCGGGTAATAAATTAGGTACAG1803115
1803116GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTAAAAGTATTGAAACCATTTATTGATAAAG1803181
1803182GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACTGATTAATTTTTCTCAAAATGACAATAGCA1803247
1803248GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAACCAACTCATTTACTGCCCAGCCACGTCCACG1803313
1803314GTTTTTGTACTCTTAAAGATTTAGTAACGGTAAAAC1803349
Left flanking sequence : Till position 1801260 (length bp)
ACATAATAGTTAAGAGCCCAAAAAAAGTATTGACTAAACTAGAAGAAGCGTATTTAATGTAGGTAGGTAT
AAAAATTTTATTTGGAGACGTTCATTTGAG
Right flanking sequence : From position 1803349 (length bp)
ATTAAAGAATTGTTAGTTGTGCAACTTAACATTAACGCATTTTTGCATTGAAATCACACTTAAAAAGCTC
TAGTCACTACCAAATACAACATAAGGTAGT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp