CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP019615_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP019615_1                                                                                                                 
top
Strain :
Listeria monocytogenes GCF_001998945
RefSeq :
NZ_CP019615 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP019615_1
DR consensus (36 bp) :
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
Number of repetitions :
40
Begin Position :
272389
End Position :
274999
272389
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GGCGATTCTGTTGAAACTGCAACGAAACTT
272454
272455
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CCACGTCAGACCAAGAACTTAAAACTATGC
272520
272521
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CTAAATTCATGTTGCGGGATGTTGTGGATG
272586
272587
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GAACTTCTTCACCATCCTTCATTTCTGTTT
272652
272653
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TCAGACTTCTATATCCACAATAAAAGCCCT
272718
272719
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GCGAGTCAATTCATCAAACCCAATCAGAAA
272784
272785
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GTGTACACGATAGTCCAAGTCGGTATTTCC
272850
272851
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CTCACGTTGTCAAGGTCAAATTTTAGATATG
272917
272918
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GAGGTTCGTGGGGGTAATCCCGGCTTGCGA
272983
272984
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
AGAGGCAACGAGACTACAGACGCACTTAGA
273049
273050
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTTGGTCGAATTCTTCCGCATCTTTAAACT
273115
273116
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTAATGAAGAACTAGAAACAATTGAAAACA
273181
273182
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GCACGTATGATCGTCTTCTTTGATGACCTC
273247
273248
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TACTCGTATAAAAATCAAGAGAGACGTATT
273313
273314
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CTTCCGCGTTACATGTTTGACATCAAGTAA
273379
273380
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GGTTGTGCCGTCACCCGTTGGTGGTAGGCT
273445
273446
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTTTCTTTTTCACGATGCGATCGAACGTTT
273511
273512
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
AGTGCAATATTTAGCGTACACATCTTTTAC
273577
273578
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTGGTCAATAGATGACTGTATTTCTTGCTC
273643
273644
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TGAAACACACAACATTTCAGAATGGCTTAG
273709
273710
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
ACTTACTGAACAACATTGATTACCACAGTT
273775
273776
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TAATAAACAAGAAATATTACTTCATGAATC
273841
273842
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CACTATCCACTACAGTGATTTGTATTGTGC
273907
273908
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GTAATCCCAATTAACCCCGCAGAGGGTGTA
273973
273974
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TGTCATGGCGAAAGGTAAAACGGTCGATTG
274039
274040
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
AGTGTTGGAGACTGCAAGGATTTCCGGATT
274105
274106
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
AACCTGCAGGTGCTGTGTTCACGTCAGCAA
274171
274172
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTGATGAGAATCTATACAGGTACTTAACCG
274237
274238
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TGTTGTCAAAGATGGTAATAAATGGGTGAC
274303
274304
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
CATCGAATTGATACTTTTCGAGTGAAGCAA
274369
274370
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GTGGGAAACGTTAAATATTATAAAACAGAT
274435
274436
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GCATCGTACCCCAGTTCATGAAGCGCGGTA
274501
274502
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
ACAAAACTCTCTAATTCAATTGCTCCATCA
274567
274568
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTTATAAAGAATACTTGCGGGGCATAAATG
274633
274634
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
GTCTAAACTTGGAATATAACTTAGGTCTTG
274699
274700
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
ACTGATGAAAGTATTTCTCCAATGACAAGT
274765
274766
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TTAAATACGATGGAATTAATCTATCGATGC
274831
274832
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TCAAAGAGTTTATACCTGTTTTGATTGAGT
274897
274898
GTTTTAGAGCTATGTTATTTTGAATGCTACCAAAAC
TAATATTCTTCCCCCCCATCGCTAACAGGG
274963
274964
GTTTTAGAGCTATATTATTCTGAATATCAACACACA
274999
Left flanking sequence : Till position 272389 (length
bp)
AAATTTTATGTAAACCATAAAATAGCATTCAAAATTGAAATCTTGCTATGGATGAATGGCGCGATTACGG
AATCTTGGAGGAAAGAAAAAATTCTGCGAG
Right flanking sequence : From position 274999 (length
bp)
AAGATAAAATGCATCGCAATTACCAAACCATGGTTAAATTTAAAAAGGAGTTAGGCTATCTATATGACAC
AGTATCACTATCTTGCTTCGAAGTCACTCT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp