Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP019699_3                                                                                                                 top


Strain : Novibacillus thermophilus GCF_002005165 RefSeq :NZ_CP019699 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP019699_3
DR consensus (30 bp) : GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACNumber of repetitions :38
Begin Position : 2038294 End Position : 2040796

2038294GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACTGCCGAATAAAGGCGTAAGAAACGCGACGTTCATA2038358
2038359GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACGGGTTCTCAACTTCGCTCTGAAATTTTGACAAAGCTAAGG2038428
2038429GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACTGGACAGCACGGAAGTTTACAGCGGATGCTACGGA2038493
2038494GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACAGCTATGACAAGCTTGCGAGCGCTATGGGACTTGTC2038559
2038560GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACACGGCCGCTATAAAGCTGTCCCATCGATCAAGTAATTTC2038628
2038629GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACCTATATCTTCCCCGTCGGGACCCTCCCCGACTTTC2038693
2038694GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACTCGGCGGAATATGATATCGTGTTCCCGGTAACTGCCG2038760
2038761GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACGAGCTGTTATGTCAGACGTGTCACAATCAAGAACAC2038826
2038827GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACGCCTACACTGGTATGCGAAAAGGCGAACTGTTGGCTCTG2038895
2038896GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACAACGAAAAGTGGTGATGCGAAATGACTAAACGCAAA2038961
2038962GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACATTCACCGCCTGCAGGTGCTTTTCTTACGGTTTCA2039026
2039027GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACTCATAAGCCGGGGTATCCACCCCGGAGACATCCCAGA2039093
2039094GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACATTCCGTTTCGGTGGTGAACATGCTCGCCTTTTTTAA2039160
2039161GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACTGATTTCAAGGGTGGCACATGCGATAGAGAATTGCCG2039227
2039228GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACATTGGTCAGCAACCATCGGATAAGGTGCGATTCACTT2039294
2039295GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACTCGCTATCCTCGACCCTGTTCAGTTTATCAGGGTCG2039360
2039361GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACACACCTTCCGCTGCGTGAATAGCGGAAGGCGGTAA2039425
2039426GTTTGTAGTTTACCTATGAGGAATGGAAACACACCTTCCGCTGCGTGAATAGCGGAAGGCGGTAA2039490
2039491GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACTGAAGGATGACGACGTCGTCGTCTAGGACGACATGCGG2039558
2039559GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACCATCTTCTACTGAAACCCCGGCACTGTTCGCTATTGC2039625
2039626GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACGAAGTCATATAAGATTGATTTTTTCAAGATGTTGCTT2039692
2039693GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACCTCGATATGCGGCAGCCCTGAGTTCTAAAGAATCA2039757
2039758GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACTACGGTAAGACTCCGCTATAAAAAAGAAACCCCTCT2039823
2039824GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACCAGTTATCGCGGCGTTGTGGGCGTGGTGGAAAAACAA2039890
2039891GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACCGGATGTGACGGTTCGGCCTGCTTGACATCAGATTT2039956
2039957GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACCATTGTGACCTCGTTCCATCTTCGTTCCCCTCTTAA2040022
2040023GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACCAGCAATTCCTCACTAAACTACGGGTTAATTGCGACAC2040090
2040091GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACGCGAATTTCATTTCAATTCCTCCTCCCTAGGTCTCC2040156
2040157GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACCTCGGGACAAAAGAATATTTGCTGCAGTGCAATACAGGA2040225
2040226GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACAGACGACGGGGGCCTTTCCAAAGCCAATACAAAG2040289
2040290GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACTAATGCCCATCTGTCATGTGCAGGTTCTGCAATTGCAG2040357
2040358GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACGGAGAAACAAAAGTTCAATCGTTAAATTATGTGTTGAC2040425
2040426GTTTGTAGCTTACCTATAAGGAATGGAAACTTCGGGACAAAAGAATATTTGCTGCAGTGCAATACAGGA2040494
2040495GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACCCTGCATACTTCTTTTGTAACTCTTTGCGATACTTA2040560
2040561GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACAAAGAAAAGAACACTAGAGATCATGAAACAAGCTGGA2040627
2040628GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACGGGCAACATCTAGGCATAGATTGGACTGTTTTTTTTAAC2040696
2040697GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAACGACGGCACAAGGCCTGTTTGCGTCGCCCAAGCCGGGTATA2040766
2040767GTTTGTAGCTTACCTATGAGGAATGGAAAC2040796
Left flanking sequence : Till position 2038294 (length bp)
GATCGAATTAATTTCTTTAAGGTCAGCACTTCCAATTACTATGCAGAAACGCTACAATAATAGCAAGGAC
AAAATGCTGATATTATCAGCGTTCAATGGG
Right flanking sequence : From position 2040796 (length bp)
TCTGTGCCAGGCAGACGCAAGTCTTGTAGCCTTAACGCTTGTAGCCTACCAAGTGAAGGATGGAAAGTTC
CTTGTGACGGAAAATACAAATAATTAACAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp