Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_LT605205_6                                                                                                                 top


Strain : Proteiniphilum saccharofermentans GCF_900095135 RefSeq :NZ_LT605205 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_LT605205_6
DR consensus (29 bp) : CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATNumber of repetitions :114
Begin Position : 2222274 End Position : 2229581

2222274CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCAAGACGGTGAATGAGAACCACAAATCGATGAAG2222337
2222338CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTGGCAAAAGGTACTTCATTGACAGTTAATCTCGTCGATG2222405
2222406CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCCCGAGATGCAGACGTTGGTTGTCACGACTGGAG2222468
2222469CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTCTAAACATTCGTAAACGCCACGTTAGCAACAA2222531
2222532CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATTGGTCGTCTTCCCTGCTCCCCGATTTCTCATTT2222595
2222596CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAACGATATACACGGGCAACAAACCTTCGAGTGGGT2222659
2222660CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATACTGCCACATCTTCGATGTTTCCATGAACGCCATT2222723
2222724CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTAATATTTCAAGTGCTTTTTTATACCAGAACTCCC2222787
2222788CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATTGAAGCAAATTACGAAGCAACGCTGATAAAAA2222850
2222851CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCGAGGGAAAGGACAAACTTATCGAACAGCAGCAA2222914
2222915CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTTCGAATATACAATACTATTGATGGTTAAATAA2222977
2222978CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATACGAATATCTTAAAAGCTTAGGTGCAGAAATA2223040
2223041CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCGTAGATGTCGGCCGGATGCTGAAGAGCTTCCTT2223103
2223104CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAGATGTCTTACGCAGTCAGCCGAAAATAGATTTTC2223167
2223168CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAGGAGTTAAAGAGGGTTGTTAACTTTTTTTTAATTG2223232
2223233CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATAGTGACGTGTACCCGGTCTACTATAATCCCGG2223295
2223296CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAAGTAAATTCACCATCCACAAAGCATAAAGCAACCTT2223361
2223362CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGAAGGAAGAAGAAAGAAGTTCGCGAGGAGCTGCCGG2223426
2223427CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTATAGGATACCGGTTCCCAATGGGGCGAGAACATT2223491
2223492CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCGGACCTCCGTCTTGAGATTATTGTCCGTAATT2223554
2223555CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATGGAATACTCATTGCGAAGGGGAACATCAGAGTT2223618
2223619CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCCGAGCTGTCGTTGATCGCCTTCGGTCTGAAGA2223681
2223682CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATGAGTTCGCGAGAGTGTATTCAGCACCGACGTATA2223746
2223747CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGTGGTAGTCCCAAGGGATCGTGCTGTTTTCGGCATAA2223812
2223813CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCTTCTGGAATCTTGATAAACTTCGAGCAGAAACC2223875
2223876CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAAACATGAGATAAACTACAACACAGAGGCTCCATTAAAG2223943
2223944CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTTCTGCCGCCTTGCAAATCGCAACTAAAATATGGGA2224009
2224010CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAATATTGTCGTCGTTAGTGACAATAACTACACGAA2224073
2224074CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCGAGAATCCGAGAGGCTATTGGATTGGCGAAACG2224137
2224138CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAATAAAACAACAAAACATTATAATCGGGGTGGCTGT2224202
2224203CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCTTGTCTTATTTTTTAATATTGTCAATCCTGTTA2224266
2224267CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCAAGGAACTCATTTTGATATGGGTGTTTCATTTG2224329
2224330CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAGAAGATAGCGAGGGTAAATTCAGGACGGGCAAAG2224393
2224394CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATACAAAATGCACAAGCGGTGGAAAGCCCATTATGACC2224458
2224459CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGTCGTTCGAGTAGCTCCAGCGTGATGTCTGTGTCGT2224523
2224524CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGGTGATGAGGGAAGAAATTGGCTTCTCCAAAATGG2224587
2224588CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAAAAGATACATGGATTGGTTCACGAGGGGTGAAC2224650
2224651CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCGTATAGCGCAACAAGACCATGTGCCGTGTTAA2224713
2224714CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCTTACGATTGCGCCTTTGACCATATCGCCATACAAAA2224779
2224780CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAAGAGTTTAAAAACCCCACCGTTGACTTTAAGAGG2224843
2224844CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTATTTTTTCGCTTAACCGTGCTGCGTAGGGCTGA2224906
2224907CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATATAGCATTCAGAGAAGGTCAATCCTCCCCGAAAAT2224972
2224973CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATAGTCTTATGTCTGCCTTCCAAAACGCTATCGAAG2225037
2225038CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCTGTTTATGTTGTGTGGTAAAACTTTATCCATTTCC2225102
2225103CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTAAACTTTTGGCACTCTTCCAAAGTGCCTTCGAATA2225167
2225168CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCCGTCTCGACAAAGTGCGGCGACAGCTTGTAAG2225230
2225231CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTCAGAATGTGGAATATGATATTCGGGTAACAAG2225293
2225294CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCTTCGGTGCACAAATTTATTAATATTTTAAAATTTGA2225359
2225360CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCGGCTTCCATCTTGTTCTCGTCTGCGGTCTTATCGGG2225425
2225426CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAAAATATGGGTTCTTCTGACAATATCCAAATTTAT2225489
2225490CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGTAGTTACTCCGATACTACTCATATCACCATTAC2225552
2225553CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTAAAAAGAGCCTTCTGTATTATTTCTGAATTTTAATT2225618
2225619CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATATTTCCTCCTGTTTTGGGGTGTCAGGATCCGCAC2225683
2225684CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCAAATCTTTGAAGGGATAGAAGGTGTTTCACCC2225746
2225747CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCCAATGCTCAGTTCAGGGAGAAATACACCGAGCTGA2225811
2225812CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCAGTTCAATTGTCGCAGACCTTGACTTGTTGGGTT2225875
2225876CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTAAGTTCTTCCTGTTTTGCCAATTCGCCTGATT2225938
2225939CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTGAAAATACCCAAGCTGCGAGGGAGTGGCTGGAGAG2226004
2226005CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCCGGTTTAATGTCTCTTAACTTTGAAGCGCAAAGA2226068
2226069CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTTACATTGCATTATTGTTTATCGCTTTTACAGCA2226132
2226133CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAGATTATAGGCCAAGTTTGCCGATTGATTTTTTG2226195
2226196CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATACAAGACTCATAAAGGTAGATTTTGTTCAAAAGAA2226259
2226260CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCGGATTACCCGCTCTTAACCGAAGCTAACTTCTA2226322
2226323CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTTACCAACTCGTCTTCCATGCTTTCCTATTGATAAT2226388
2226389CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCCTGGGGAGGAAAGTTCAATTTTCCGATTTGAGCGA2226453
2226454CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAGGAGAATGAGGTGGAAGTATAAAGACGGAAAAAT2226517
2226518CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGCAAATTAAAACCGTCAGAAAATGACGGTGTTATTG2226582
2226583CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGAAGAACCGTTGTAAAACTTAATCCTGTTTCTTTC2226646
2226647CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCTCGTGGAGAAGGAGTTTGCAAAGATTGAATCCG2226709
2226710CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAAGGAGTAGAAACTGGTCTTAGAGGGCTTCAAAA2226772
2226773CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCCATAATCATAGTTTTTAAAAATTAGCATCTGT2226835
2226836CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCTTTTTTATTCTTTTCGACAAAGTAAGGCATAAA2226899
2226900CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATTCGTCGGTTATCAATTCGATGTTCTCTTTGAGTT2226964
2226965CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCTTAAAAAATAGAATTATGAAAACAAAAGAATTA2227027
2227028CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCTGTCTTTGAGGTAGAGCGCGGATTCTATTTTCTTGAAG2227095
2227096CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCGGGAATAAACTCAACGTCGAATTTCCGCAAAAC2227159
2227160CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTAAAAAAGACAGAAATATACAAGCAGTTGACGC2227222
2227223CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTGCGAAAAACACGATCGCAACTCAAAAAACATTTA2227287
2227288CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTAGCTCTTAAATGTCATATCTGTATCATATAGAGAGA2227353
2227354CCATTAATCGTACTAGATAGAATTGAAATAAAAGTGGGACGGAAACGAGGATGATTGGGCGCCGAT2227419
2227420CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATACGCAAAGCAAAAGGAACATTTTCTTTCTGGAATCATC2227486
2227487CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTAGATAAAACCGCTCGTTATCCGGTGTATTGAAGT2227550
2227551CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTATGAAGGCGCTATGTTACGATCCAGGGAACCTTCAG2227616
2227617CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAAGAAAAAAACGGTTACTGTTTCAGACCAAGAAT2227679
2227680CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTAGAAAATAGTAAAGAGGCGAGGGAGTGGCTGGAGA2227744
2227745CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCGCTGCTCTAATGAGCGGTGCGAAAAGAAACTGAAA2227809
2227810CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTAGTTTTATCCTCCAATCGTTCGGGCACAACAAACC2227874
2227875CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTAAAACGAGCCTTCTGTATTATTTCTGAATTTCAA2227938
2227939CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCCAGAGAGACCCCGTGTAATCGTCGCCCTCTTTAT2228003
2228004CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTCATTATATTCTCGCATCCCTTATCGATTCAGGGTAA2228070
2228071CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGCGAAGATACCGCCGTGATAGAAGTAAGCCCGGAAT2228135
2228136CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGGTGATGAAAGTTCTGGTTACACAAAAAGGGCTTG2228199
2228200CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTTTTAGGTTGCTCACACCTGCCCGACATGTAACGGT2228265
2228266CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATTTTTGTTTCTAATTCTTTCTCTAAAATCATAAT2228329
2228330CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCCTTTAAAATGGCAAGGAATACTTTCTCGAAGTCGC2228394
2228395CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTCAGCAAACGACGAAATTATATACCTCTCTGTTTGA2228459
2228460CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCCATCACGGCTGACCCCGCCTATACCCAAACCGAAG2228524
2228525CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAGAGAAGCCTAAGGGAAGTCCAGTACCAAGTATTA2228588
2228589CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATCAATCCGGCAAAATCTTCCGACTTGTACGCCCTT2228653
2228654CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAGAACAGGATGCTTTATTTCCGCCATACCTTTATA2228717
2228718CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATAAATGACGATGATTTATTTACGCTCGCTCGGCTGC2228781
2228782CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATATCAAACAAGAACAATCGAGTTAAGAAGTTCTACGA2228846
2228847CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATACGGATTTTACTAATCTGGTTAATAAGTCTGCGTTT2228911
2228912CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCGTGTTTTTCTCTTCTCTGCTGCTGCTGGTCACT2228974
2228975CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGTAGAAATAAATAAGAAACCTTACTACGGTTTCG2229037
2229038CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGAAGGAACCTCTCACTTTGTGAATTTGATCGCTTCT2229102
2229103CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTAGTTTGAGGGCGGGGAACAAGCCAACGATGAAT2229166
2229167CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATCCACATGAGAACCTATATGTATCGACCCGTCTG2229228
2229229CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTGAAAAAATTATACACGGTGGCACAGGCAGCCGAA2229292
2229293CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTTACATTAACAGTATCAGCTTTTTTTGCTTTCGTTTG2229359
2229360CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTTGACAAGCTAACGATGCTTAAAAACACTCTAACG2229423
2229424CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATTGATGTTAATTGTGCTATTAAATTAAACATACTTTG2229488
2229489CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAATGCGAATTACTATACAGGTGTTCGCCGGTGCTTTTT2229552
2229553CCATTAATCGTACTAGGTAGAATTGAAAG2229581
Left flanking sequence : Till position 2222274 (length bp)
TTTGTATCTTTGGCTATCGACAACTTTTTCAACAAGAATTCGATGATATTTTTCTGTTTAAATGCTGATA
TACAGCTTTATTTTTTGCCGTTTTTAACGG
Right flanking sequence : From position 2229581 (length bp)
GGATATGGATTGAAGATGTGCAAAAAAAAGCTGTCCCAAAACGAAGTTTACTTCGCTGAGACAGCCTCTT
TTCCATAAGTTTCAGAACGGCTATTTCTTA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp